Гаплогруппа E (мтДНК) - Haplogroup E (mtDNA)
| Гаплогруппа E | |
|---|---|
| Возможное время происхождения | 35,000[1] до 8000[2] YBP |
| Возможное место происхождения | Восток Сундаленд[1] или же Фуцзянь морской берег[2] |
| Предок | M9 |
| Потомки | E1, E2 |
| Определение мутаций | 3027, 3705, 7598, 13626, 16390[3] |
В митохондриальная генетика человека, гаплогруппа E это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК) типично для Малайский архипелаг. Это подгруппа гаплогруппа M9.
Источник
Было сделано два противоположных предложения относительно места и времени происхождения гаплогруппы E. Согласно одной из точек зрения, клады сформировались более 30 000 лет назад, примерно во времена Последний ледниковый максимум, на северо-восточном побережье Сундаленд (около современного Борнео В этой модели гаплогруппа была рассеяна в результате повышения уровня моря во время Поздний ледниковый период период.[1][4]
В 2014 году митохондриальная ДНК скелета возрастом 8000 лет была обнаружена на Остров Лян, один из Острова Мацу у побережья юго-восточного Китая, было обнаружено, что он принадлежит к гаплогруппе E, с двумя из четырех мутаций, характерных для подгруппы E1. На основании этого Ко и его коллеги утверждают, что гаплогруппа E возникла 8000-11000 лет назад недалеко от севера. Фуцзянь побережье, отправился на Тайвань с поселенцами эпохи неолита 6000 лет назад, а оттуда распространился в Приморскую Юго-Восточную Азию с Австронезийский язык разгон.[2]Соарес и др. Предостерегают от чрезмерного акцента на одной выборке и утверждают, что молекулярные часы подразумевает, что более ранняя дата (и более южное происхождение) остается более вероятной.[5]
Распределение
Гаплогруппа E встречается повсюду Приморская Юго-Восточная Азия.[4]Он почти отсутствует на материковой части Восточной Азии, где распространена его сестринская группа M9a (также найденная в Японии).[4][6]В частности, он встречается среди носителей Австронезийские языки, и он редко встречается даже в Юго-Восточной Азии среди членов других языковых семей. Обнаружен в популяциях Тайвань, то Филиппины, Индонезия, Малайзия (включая Сабах из Борнео, но не Оранг Асли полуострова Малайзия), прибрежная Папуа - Новая Гвинея, и особенно в Чаморро из Марианские острова.[4][7][8][9][10][11]
Из четырех основных субкладов E1b и E2a находятся в основном в Приморской Юго-Восточной Азии, в то время как только E1a и E2b также встречаются на Тайване.[12]E2b имеет низкое разнообразие на Тайване, что позволяет предположить, что он появился там около 5000 лет назад.[12]Наиболее распространенный субклад E, E1a1a, имеет наибольшее разнообразие на Тайване, за ним следуют Филиппины и Сулавеси. Более того, другие ветви E1a1 в значительной степени ограничены Тайванем.[13]
| численность населения | Частота | Считать | Источник | Подтипы |
|---|---|---|---|---|
| Чаморро (85 Гуам, 14 Сайпан, & 6 Рота ) | 0.924 | 105 | Вилар и др., 2013 г. | E2a = 68, E1a2 = 29 |
| Восточно-индонезийский (Сулавеси, в т.ч. 89 Манадо, 64 Тораджа, 46 Уджунг Паданг, & 38 Палу ) | 0.266 | 237 | Хилл и др. 2007 | E1a = 42, E1b = 9, E2 = 7, E1 (xE1a, E1b) = 5 |
| Филиппинский (Минданао ) | 0.214 | 70 | Таббада и др., 2010 г., п. 24 | E1a1a = 10, E2 (xE2b) = 4, E1b = 1 |
| Филиппинский (Visayas ) | 0.214 | 112 | Таббада и др., 2010 г., п. 24 | E1a1a = 18, E2 (xE2b) = 5, E1 (xE1a1a, E1a2, E1b) = 1 |
| Восточно-индонезийский (Амбон ) | 0.163 | 43 | Хилл и др. 2007 | E1 (xE1a, E1b) = 3, E1a = 2, E2 = 2 |
| Восточно-индонезийский (Waingapu, Сумба ) | 0.160 | 50 | Хилл и др. 2007 | E1b = 6, E1a = 1, E2 = 1 |
| Индонезийский (Бангка ) | 0.147 | 34 | Хилл и др., 2006 г. | E = 5 |
| Борнео (89 Банджармасин & 68 Кота-Кинабалу ) | 0.146 | 157 | Хилл и др. 2007 | E1a = 14, E2 = 5, E1b = 3, E1 (xE1a, E1b) = 1 |
| Филиппинский | 0.125 | 64 | Таббада и др., 2010 г., п. 24 | E1a1a = 5, E2 (xE2b) = 2, E1a2 = 1 |
| Филиппинский (Лусон ) | 0.124 | 177 | Таббада и др., 2010 г., п. 24 | E1a1a = 14, E1b = 5, E2 (xE2b) = 2, E2b = 1 |
| Тайвань (абориген) | 0.120 | 640 | Peng et al 2011 | E = 77 |
| Восточно-индонезийский (Алор ) | 0.111 | 45 | Хилл и др. 2007 | E1a = 3, E1b = 2 |
| Восточно-индонезийский (Матарам, Ломбок ) | 0.091 | 44 | Хилл и др. 2007 | E1b = 3, E1a = 1 |
| Индонезийский (Паданг, Суматра ) | 0.083 | 24 | Хилл и др., 2006 г. | E = 2 |
| Индонезийский (Медан, Суматра ) | 0.071 | 42 | Хилл и др., 2006 г. | E = 3 |
| Индонезийский (Пеканбару, Медан, Бангка, Палембанг, & Паданг ) | 0.067 | 180 | Хилл и др. 2007 | E1a = 6, E1b = 4, E1 (xE1a, E1b) = 1, E2 = 1 |
| Индонезийский (Бали ) | 0.061 | 82 | Хилл и др. 2007 | E1a = 3, E1b = 1, E1 (xE1a, E1b) = 1 |
| Филиппинский (Палаван ) | 0.050 | 20 | Скоулз и др., 2011 г. | E1a = 1 |
| Индонезийский (Палембанг, Суматра ) | 0.036 | 28 | Хилл и др., 2006 г. | E = 1 |
| Tujia (Уезд Яньхэ, Гуйчжоу ) | 0.034 | 29 | Ли и др., 2007 г. | E = 1 |
| Гелао (Округ Даочжэнь, Гуйчжоу) | 0.032 | 31 | Ли и др., 2007 г. | E = 1 |
| Индонезийский (Ява, в т.ч. 36 из Тенгер ) | 0.022 | 46 | Хилл и др. 2007 | E1b = 1 |
| Индонезийский (Пеканбару, Суматра ) | 0.019 | 52 | Хилл и др., 2006 г. | E = 1 |
| Чам (Bình Thuận, Вьетнам ) | 0.012 | 168 | Peng et al 2010 | E1a1a = 1, E2a = 1 |
| Каролинский (Сайпан ) | 0.000 | 17 | Вилар и др., 2013 г. | - |
| Йи (Hezhang County, Гуйчжоу ) | 0.000 | 20 | Ли и др., 2007 г. | - |
| Донг (Уезд Тяньчжу, Гуйчжоу ) | 0.000 | 28 | Ли и др., 2007 г. | - |
| Батек (Малайзия ) | 0.000 | 29 | Хилл и др., 2006 г. | - |
| Cun (Хайнань ) | 0.000 | 30 | Peng et al 2011 | - |
| Батак (Палаван ) | 0.000 | 31 | Скоулз и др., 2011 г. | - |
| Lingao (Хайнань ) | 0.000 | 31 | Peng et al 2011 | - |
| Мендрик (Малайзия ) | 0.000 | 32 | Хилл и др., 2006 г. | - |
| Темуан (Малайзия ) | 0.000 | 33 | Хилл и др., 2006 г. | - |
| Данга (Хайнань ) | 0.000 | 40 | Peng et al 2011 | - |
| Джахай (Малайзия ) | 0.000 | 51 | Хилл и др., 2006 г. | - |
| Сенои (Малайзия ) | 0.000 | 52 | Хилл и др., 2006 г. | - |
| Семелаи (Малайзия ) | 0.000 | 61 | Хилл и др., 2006 г. | - |
| Гелао (Округ Даочжэнь, Гуйчжоу) | 0.000 | 102 | Лю и др. 2011 | - |
| Ли (Хайнань ) | 0.000 | 346 | Peng et al 2011 | - |
Субклады
Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы E основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека[3] и последующие опубликованные исследования.
- E
- E1
- E1a
- E1a1
- E1a1a
- E1a1a1
- E1a1a
- E1a2
- E1a1
- E1b
- E1b1
- E1a
- E2
- E2a
- E2b
- E2b1
- E2b2
- E1
Смотрите также
- Генеалогический ДНК-тест
- Генетическая генеалогия
- Митохондриальная генетика человека
- Популяционная генетика
- Гаплогруппы митохондриальной ДНК человека
Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Митохондриальная Ева (L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CZ | D | E | грамм | Q | О | А | S | р | я | W | Икс | Y | |||||||||||||||||||||||||||
| C | Z | B | F | R0 | pre-JT | п | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ЧАС | V | J | Т | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Рекомендации
- ^ а б c Соарес и др., 2008 г., п. 1215.
- ^ а б c Ко и др., 2014.
- ^ а б Ван Овен и Кайзер 2008.
- ^ а б c d Хилл и др. 2007.
- ^ Соарес и др., 2016.
- ^ Trejaut et al 2005.
- ^ Таббада и др., 2010 г. С. 24, 28.
- ^ Peng et al 2010.
- ^ Хилл и др., 2006 г..
- ^ Вилар и др., 2013 г..
- ^ Peng et al 2011.
- ^ а б Соарес и др., 2008 г., п. 1213.
- ^ Таббада и др., 2010 г., п. 29.
- Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Михан, Уильям; Блэкберн, Джеймс; Кларк, Дуглас; Раджа, Джозеф Марипа; Исмаил, Патима; Bulbeck, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2006). «Филогеография и этногенез аборигенов Юго-Восточной Азии». Молекулярная биология и эволюция. 23 (12): 2480–2491. Дои:10.1093 / molbev / msl124. PMID 16982817.
- Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Кларк, Дуги; Блюмбах, Петя Б .; Визуете-Форстер, Матье; Форстер, Питер; Bulbeck, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2007). «Митохондриальная стратиграфия островов Юго-Восточной Азии». Американский журнал генетики человека. 80 (1): 29–43. Дои:10.1086/510412. ЧВК 1876738. PMID 17160892.
- Ко, Альберт Мин-Шань; Чен, Чун-Ю; Фу, Цяомэй; Дельфин, Фредерик; Ли, Минкун; Чиу, Хун-Линь; Стоункинг, Марк; Ко, Инь-Чин (2014). «Ранние австронезийцы: на Тайвань и из Тайваня». Американский журнал генетики человека. 94 (3): 426–436. Дои:10.1016 / j.ajhg.2014.02.003. ЧВК 3951936. PMID 24607387.
- Ли, Бинбин; Чжун, Фугуан; Йи Хуншэн; Ван, Сяньрань; Ли, Лянфан; Ван, Лилан; Ци, Сяолань; Ву, Лифу (2007). «Генетический полиморфизм митохондриальной ДНК в этнических популяциях донг, гелао, туцзя и ии из Гуйчжоу, Китай». Журнал генетики и геномики. 34 (9): 800–811. Дои:10.1016 / S1673-8527 (07) 60091-5. PMID 17884690.
- Лю, Чанг; Ван, Ша-Ян; Чжао, Миан; Сюй, Чжи-Юн; Ху, Ю-Хуа; Чен, Фэн; Чжан, Жуань-Чжан; Гао, Го-Фэн; Юй Юэ-Шэн; Конг, Цин-Пэн (2011). «Полиморфизмы митохондриальной ДНК в этнической группе Гелао, проживающей в Юго-Западном Китае». Судебная медицина Международная генетика. 5 (1): PE4 – E10. Дои:10.1016 / j.fsigen.2010.04.007. PMID 20494640.
- Пэн, Мин-Шэн; Куанг, Хай Хо; Данг, Кхоа Фам; Trieu, An Vu; Ван, Хуа-Вэй; Яо, Юн-Ган; Конг, Цин-Пэн; Чжан, Я-Пин (2010). «Прослеживание австронезийского следа в континентальной части Юго-Восточной Азии: взгляд на митохондриальную ДНК». Молекулярная биология и эволюция. 27 (10): 2417–2430. Дои:10.1093 / molbev / msq131. PMID 20513740.
- Пэн, Мин-Шэн; Он, Джун-Донг; Лю, Хай-Синь; Чжан, Я-Пин (2011). «Прослеживание наследия первых жителей острова Хайнань - взгляд на митохондриальную ДНК». BMC Эволюционная биология. 11 (46): 46. Дои:10.1186/1471-2148-11-46. ЧВК 3048540. PMID 21324107.
- Скоулз, Кларисса; Сиддл, Кэтрин; Дюкурно, Аксель; Кривелларо, Федерика; Ярве, Мари; Рутси, Сиири; Беллатти, Мэгги; Таббада, Кристина; Мормина, Мару; Рейдла, Маэре; Виллемс, Ричард; Кивисилд, Тоомас; Лар, Марта Миразон; Мильяно, Андреа Бамберг (2011). «Генетическое разнообразие и данные о примеси популяции в Batak Negritos из Палавана». Американский журнал физической антропологии. 146 (1): 62–72. Дои:10.1002 / ajpa.21544. PMID 21796613.
- Соарес, Педро; Трежо, Жан Ален; Лоо, Цзюнь-Хун; Хилл, Кэтрин; Мормина, Мару; Ли, Цзянь-Лян; Чен, Яо-Мин; Худжашов, Георгий; Форстер, Питер; Маколей, Винсент; Bulbeck, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2008). «Изменение климата и расселение людей в период после ледникового периода в Юго-Восточной Азии». Молекулярная биология и эволюция. 25 (6): 1209–1218. Дои:10.1093 / molbev / msn068. PMID 18359946.
- Соарес, Педро А .; Trejaut, Жан А .; Рито, Тереза; Кавадас, Бруно; Хилл, Кэтрин; Энг, Кен Хонг; Мормина, Мару; Брандао, Андрей; Фрейзер, Росс М .; Ван, Цзе-И; Лоо, Цзюнь-Хун; Снелл, Кристофер; Ко, Цанг-Мин; Аморим Антониу; Пала, Мария; Маколей, Винсент; Bulbeck, Дэвид; Уилсон, Джеймс Ф .; Гужман, Леонор; Перейра, Луиза; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2016). «Устранение происхождения населения, говорящего на австронезийском языке». Генетика человека. 135 (3): 309–326. Дои:10.1007 / s00439-015-1620-z. ЧВК 4757630. PMID 26781090.
- Таббада, Кристина А .; Trejaut, Жан; Лоо, Цзюнь-Хун; Чен, Яо-Мин; Лин, Мари; Миразон-Лар, Марта; Кивисилд, Тоомас; Де Унгриа, Мария Коразон А. (2010). "Разнообразие митохондриальной ДНК Филиппин: густонаселенный виадук между Тайванем и Индонезией?". Молекулярная биология и эволюция. 27 (1): 21–31. Дои:10.1093 / молбев / msp215. PMID 19755666.
- Trejaut, Жан А .; Кивисилд, Тоомас; Лу, Джун Хун; Ли, Чиен Лян; Он, Чун Линь; Сюй, Чиа Юнг; Ли, Чжэн Юань; Лин, Мари (2005). «Следы архаичных митохондриальных линий сохраняются в австронезийско-говорящих популяциях формоз». PLOS Биология. 3 (8). e247. Дои:10.1371 / journal.pbio.0030247. ЧВК 1166350. PMID 15984912.
- ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2008). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386 – E394. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749. Архивировано из оригинал 4 декабря 2012 г.. Получено 2009-05-20.CS1 maint: ref = harv (связь)
- Vilar, Miguel G .; Chan, Chim W .; Сантос, Дана Р .; Линч, Дэниел; Спатис, Рита; Гарруто, Ральф М .; Лам, Дж. Коджи (2013). «Происхождение и генетическая особенность чаморро Марианских островов: перспектива мтДНК». Американский журнал биологии человека. 25 (1): 116–122. Дои:10.1002 / ajhb.22349. ЧВК 4335639. PMID 23180676.
внешняя ссылка
- Общий
- Яна Логана Сайт митохондриальной ДНК
- Манниса ван Овена Филотрия
- Гаплогруппа E
- Ballinger, S.W .; Schurr, T.G .; Torroni, A .; Gan, Y.Y .; Hodge, J.A .; Hassan, K .; Chen, K.H .; Уоллес, округ Колумбия (1992). «Анализ митохондриальной ДНК в Юго-Восточной Азии показывает генетическую преемственность древних монголоидных миграций». Генетика. 130 (1): 139–152. ЧВК 1204787. PMID 1346259.
- Herrnstadt, C .; Elson, J.L .; Fahy, E .; и другие. (2002). "Анализ с уменьшенной медианной сетью полных последовательностей кодирующих областей митохондриальной ДНК для основных африканских, азиатских и европейских гаплогрупп". Американский журнал генетики человека. 70 (5): 1152–1171. Дои:10.1086/339933. ЧВК 447592. PMID 11938495.
- Ингман, М .; Kaessmann, H .; Pääbo, S .; Gyllensten, U. (2000). «Вариации митохондриального генома и происхождение современного человека». Природа. 408 (6813): 708–713. Bibcode:2000Натура 408..708И. Дои:10.1038/35047064. PMID 11130070. S2CID 52850476.
- Stoneking, M .; Jorde, L.B .; Bhatia, K .; Уилсон, A.C. (1990). "Географические изменения митохондриальной ДНК человека из Папуа-Новой Гвинеи". Генетика. 124 (3): 717–733. ЧВК 1203963. PMID 1968873.