Гаплогруппа R (мтДНК) - Haplogroup R (mtDNA)
Гаплогруппа R | |
---|---|
Возможное время происхождения | 66.8±14,2 тыс. Лет назад [1] |
Возможное место происхождения | Южная Азия[2][3] Юго-Восточная Азия[4] |
Предок | N |
Потомки | R0, R1, R1b, R2'JT, R3, R5, R6'7, R8, R9, R11 'B, R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, п, U |
Определение мутаций | 12705, 16223[5] |
Гаплогруппа R широко распространенный митохондриальная ДНК человека (мтДНК) гаплогруппа. Гаплогруппа R связана с заселение Евразии примерно 70 000 лет назад и распространен среди современных популяций по всему миру за пределами К югу от Сахары.[6]
Гаплогруппа R является потомком макро-гаплогруппа N. Среди потомков гаплогрупп R clade B, U (и поэтому K ), F, R0 (и поэтому HV, ЧАС, и V ), и JT (наследственная гаплогруппа J и Т ).
Источник
Соарес и др. (2009) оценивают возраст гаплогруппы R до 66.8±14,2 тыс. Лет назад (95% ДИ ),[1] то есть примерно между 80 000 и 50 000 лет назад, с наиболее вероятным возрастом около 65 000 лет.
Это согласуется с появлением в ходе Прибрежная миграция из Восточной Африки в Западную, Южную и Юго-Восточную Азию.[3] Было высказано предположение, что ранняя линия гаплогрупп M, N и R вдоль прибрежного маршрута в период примерно от 70 000 до 60 000 лет назад.[7]
Гаплогруппа R имеет большое разнообразие и древность у коренного населения Южной Азии. Племена и касты Западной и Южной Индии демонстрируют большее разнообразие, чем другие регионы, что, возможно, свидетельствует об их автохтонном статусе.[2] Ларруга и др. (2017) обнаружили, что мтДНК R распространилась в Евразию и Австралию из основного района вдоль побережья Юго-Восточной Азии.[6]В Усть-Ишимский человек ископаемое из Сибири, датируемое ок. Возраст 45000 лет, принадлежит к гаплогруппе R * (ранее классифицировалась как U *).[8][9]
Распределение
Гаплогруппа R и ее потомки распространены повсюду Австралазия, Америка, Юго-Восточная Азия, Южная Азия, Центральная Азия, Западная Азия, Восточная Азия, Европа, Северная Африка и Африканский рог.
Базальная клада R * встречается среди Soqotri (1,2%), а также в Северо-Восточная Африка (1,5%), Средний Восток (0,8%), Ближний Восток (0,8%) и Аравийский полуостров (0.3%).[10]
Гаплогруппа R также наблюдалась среди древнеегипетский мумии, раскопанные на Абусир эль-Мелек археологические раскопки в Среднем Египте, датируемые доптолемеевым / поздним периодом Новое Королевство, Птолемеев, и Римский периоды.[11]
Субклад R2 был обнаружен в останках человека эпохи неолита из западного Ирана в Тепе Абдул Хосейн.[12]
Субклады
- Гаплогруппа R
- R0 или же pre-HV
- R0a или (preHV) 1: Обычно встречается на Аравийском полуострове, с наибольшей частотой среди сокотрийцев.[13] Умеренные частоты найдены в Северная Африка, то Африканский рог, и Центральная Азия.
- HV: Это западноевразийская гаплогруппа, которая в основном встречается на Средний Восток, включая Иран.[14] Он также встречается в Северная Африка, Центральная Азия и Южная Азия.
- V: Встречается на умеренно низких частотах по всей Европе; самая высокая частота в Саамский народ 40%.[15]
- HV1: в основном в Средний Восток.[16]
- HV2: в основном в Южная Азия.[14]
- HV3: в основном в Восточная Европа.[17]
- ЧАС: В Западная Евразия. Это самая распространенная гаплогруппа мтДНК в Европа.
- R1
- R1a * (3337): Найдено в Брамины из Уттар-Прадеш (Индия).[7] Также в Адыгея люди (Кавказ).
- R1a1: Найдено в Северо-Западный Кавказ людям нравится Кабардинцы и Адыгейцы. Наблюдается в популяциях Восточной Европы, таких как северо-западные Россияне и Поляки.[17]
- R1b: наблюдается в Восточный охотник-собиратель из Карелии, Россия, датируется 5500 годом до нашей эры.[18]
- R1b1: наблюдается в Болгарии, Армении (включая древний образец) и Индии.
- R1b1a: наблюдается у уйгуров
- R1b1b: наблюдается в Финляндии (включая Финляндия шведов )
- R1b2
- R1b2a: наблюдается у якутов
- R1b2b: наблюдается у уйгуров
- R1b1: наблюдается в Болгарии, Армении (включая древний образец) и Индии.
- pre-JT или R2'JT
- R2: Встречается в основном в Белуджистан (Пакистан).[14]
- (13500): Найдено в Раджастхан и Уттар-Прадеш (Индия).[3]
- (150, 303 + 1С): В Иран, Грузия и индюк.
- JT
- J: Самая высокая частота в Ближний Восток (12%), 21% в Саудовская Аравия.[16] J отказывается от Европа в 11%, Кавказ 8%, Северная Африка 6% и практически отсутствует в Восточной Азии.[19]
- Т: Самая высокая частота в Каспийский регион (Кавказ, Северная Иран, Туркменистан ).[14] Это важно в Европа (почти 10%),[20] Средний Восток, Центральная Азия, Пакистан и Северная Африка. Небольшая частота в Африканский рог и Индия.
- R2: Встречается в основном в Белуджистан (Пакистан).[14]
- R3: Найдено в Армении.[21] Также наблюдается у древнего человека из Венгрия, датируемая 7000 лет назад[22]
- R5: Широко распространен в Индийский субконтинент. Специально в Мадхья-Прадеш (Индия ) на 17%.[23]
- R5a
- R5a1: Находится в Индоевропейский говорящее население Индия.[24]
- R5a2: Особенно среди Дравидский группы Индия и Шри-Ланка.[24]
- R5a
- R6'7 (16362) Самое важное присутствие среди Австроазиатский язык - спикеры из Индия (10%).[24]
- R6: Небольшие частоты в Индия и Пакистан заметно в обоих Тамильский и Кашмири популяции с расширением.[23]
- R7: В Индийский субконтинент .[24][25]
- R7a: В основном в Восточная Индия, особенно в Санталы из Бихар и Джаркханд.[25]
- R7b: Специально в Дравидийский племена из Восточная Индия.[25]
- R8: Самая высокая частота приходится на Восточная Индия, особенно в Орисса (12%), и находится среди Австроазиатский племена (Мунда и Хаси компьютерные колонки). Он также присутствует на низких частотах среди носителей дравидийского, индоевропейского и тибето-бирманского языков (например Ньиши, Чангпа, Шерпа ).[26]
- R8a: в основном встречается в Орисса и Андхра-Прадеш (Индия).
- R8b: В Орисса, Гуджарат, Андхра-Прадеш (Индия).
- R9 (16304)
- R9b: в основном появляется в Юго-Восточная Азия.[27] Найдено повсюду Индонезия, в Индокитай, Малайзия, в Аборигены малайцы подобно Семелаи на 28% и Темуан 21%.[28]
- (249d)
- R9c: Во всем Малайский архипелаг и Тайвань. В основном в Батак (Палаван ) на 58%,[29] то Цоу из Тайвань (22.9%),[30] и Алор (Индонезия) - 11%.[31]
- F: Довольно часто встречается в Восточная Азия и Юго-Восточная Азия. Более высокие частоты встречаются в некоторых областях, например Никобар на 50% и Аруначал-Прадеш 31% (Индия ),[23] и Шорс выходцы из Сибири на 44%.[32] Также важна частота в Тайваньские аборигены, Гуандун (Китай), Малуку (Индонезия), Таиланд и Вьетнам.
- R11'B (16189)
- R11: Нашел в Китай, в основном в Народ Лаху из Юньнань на 12,5%.[33] Также в Япония, Корея,[34] Chams,[35] и Раджастхан (Индия).
- B
- B4: часто встречается в Восточная Азия, Юго-Восточная Азия, Полинезия, Меланезия, Микронезия, Мадагаскар и Коренные народы Америки.
- B5: распространение в Восточная Азия и Юго-Восточная Азия.
- R24: Нашел в Филиппины.[36]
- R12'21
- R14: Нашел в Папуа - Новая Гвинея[39] И в Австронезийский спикеры Восточный Тимор и Лембата.[40]
- R22 или R12: очень часто в Shompen (10/29 = 34.5%).[41] В других местах встречается в основном на юге центральной Индонезия (11.4% Матарам, 8.0% Waingapu, 7.3% Бали, 1.9% Борнео ) И в Чам из Bình Thuận, Вьетнам (7/168 = 4,2%),[42] с единичными или спорадическими встречами в Таиланд, Суматра, Ява, Сулавеси, и Алор.[31]
- R23: Небольшая кладовая, найденная в Бали и Сумба (Индонезия).[31]
- R30
- R30a: Найдено в Андхра-Прадеш, Уттар-Прадеш (Индия), в Люди тару из Непал[43] и Сингальский народ из Шри-Ланка.[24]
- R30b: Найдено в Пенджаб.[24]
- R30 * (1598, 16189): Найдено в Пенджаб, Непал и Япония.[43]
- R31
- R31a: В Брамины из Уттар-Прадеш[7] и Раджпуты из Раджастхан (Индия).[24]
- R31b: В Реддис из Андхра-Прадеш (Индия).[7]
- R32
- R0 или же pre-HV
Нашел в Маврикий
- П: Это характерно для Сахул. Нашел в Филиппины и восток Индонезия.
- (16176)
- P1: широко распространен в Меланезия. Более высокие частоты встречаются в Папуа - Новая Гвинея.[44] Также найдено в Малуку, Нуса Тенгара и Полинезия.[45]
- P2'10
- P2: В Меланезия,[44] особенно в Новая Гвинея и Новая Каледония.
- P10: Найдено в Филиппины.[36]
- P9 (или AuE): В Австралийские аборигены из центрального региона.[46]
- P3: В Австралия и Меланезия.[44]
- P4: В Австралия и Меланезия.[47]
- (16176)
- U
- U1: В основном это появляется в Средний Восток и Кавказ. Встречается от Индии до Средиземноморья и остальной Европы.[48]
- U5: примерно 11% от общего числа Европейцы и 10% американцев европейского происхождения. Самая высокая частота в Саамский народ.[15]
- U6: Часто встречается в Северная Африка и Африканский рог, особенно в Магриб.[49] Самые высокие частоты субклада встречаются среди алжирских Берберы (29%)[50] и египетский Копты (27.6%).[51] U6 также был найден среди Иберомавр образцы, относящиеся к эпохе эпипалеолита на Taforalt доисторическое место.[52]
- U2'3'4'7'8'9 (1811 г.): Широко распространен в Западная Евразия и Индийский субконтинент.
- U8
- П: Это характерно для Сахул. Нашел в Филиппины и восток Индонезия.
Дерево
Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы R основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека[5] и последующие опубликованные исследования.
- р
- R0 (ранее pre-HV)
- R1
- R1a
- R1a1
- R1a1a
- R1a1
- R1a
- R2'JT
- R5
- R5a
- R5a1
- R5a1a
- R5a2
- R5a2a
- R5a2b
- R5a2b1
- R5a2b2
- R5a2b3
- R5a2b4
- R5a1
- R5a
- R6'7
- R6
- R6a
- R6a1
- R6a1a
- R6a1
- R6a
- R7
- R7a
- R7a1
- R7a1a
- R7a1b
- R7a1b1
- R7a1b2
- R7a1
- R7b
- R7b1
- R7b1a
- R7b1
- R7a
- R6
- R8 - Индия
- R8a - Шри-Ланка
- R8a1
- R8a1a
- R8a1a1
- R8a1a2
- R8a1a3 - Южная Африка, Норвегия
- R8a1b
- R8a1a
- R8a2
- R8a1
- R8b
- R8b1
- R8b2
- R8a - Шри-Ланка
- (16304)
- R9
- R9b - Камбоджа, Таиланд (Лао Исан в Провинция Убонратчатхани и Провинция Рой-Эт ),[53] Гвинея
- R9b1 - Китай, Уйгур, Таиланд (Пн в Центральный Таиланд, Тайский в Западный Таиланд ), Лаос (Лаосский в Вьентьян[53]), Вьетнам (Ла Хо ), Дания
- R9b1a
- R9b1a1 - Филиппины (Маманва )
- R9b1a1a - Китай, Таиланд (Карен и Тайский люэ в Северный Таиланд, Лао Исан в Провинция Рой-Эт,[53] Тайский в Центральный Таиланд и Восточный Таиланд ), Камбоджа (Бантей Минчей ), Малайзия (Семелаи, аборигенный малайский ), Сингапур, Индонезия (Тенгер, Палембанг, Паданг, Манадо ), Вьетнам (Giarai )
- R9b1a2 - Тайвань (Цоу ), Таиланд (Лао Исан в Провинция Лей, Тайский в Западный Таиланд )
- R9b1a2a - Китай (хань из Тайань, и Т. Д.), Вьетнам (Тай, и Т. Д.), Россия (Тубалар )
- R9b1a2b - Китай, Тайвань (Миннан, Хакка), Вьетнам (Тай ), Таиланд (Кхон Муанг из Провинция Чианграй, Тай Кхуэн из Северного Таиланда)
- R9b1a3 - Таиланд, Китай (Хан, Дай ), Вьетнам (Дао, Nng, и Т. Д.), Казахстан
- R9b1a1 - Филиппины (Маманва )
- R9b1b - Китай, Вьетнам, Камбоджа (Сием Рип ), Таиланд (Кхон Муанг из Провинция Чиангмай, Тай Юань из Центральный Таиланд, Пн из Северный Таиланд )
- R9b1a
- R9b2 - Таиланд, Камбоджа, Вьетнам
- R9b1 - Китай, Уйгур, Таиланд (Пн в Центральный Таиланд, Тайский в Западный Таиланд ), Лаос (Лаосский в Вьентьян[53]), Вьетнам (Ла Хо ), Дания
- R9c - Китай (Баргут из Хулун Буир ), Тайвань
- R9c1
- R9c1a - Филиппины, Индонезия, Тайвань (Макатао ), Таиланд (Кхон Муанг из Провинция Чианграй )
- R9c1b
- R9c1b1 - Китай (Хан ), Вьетнам (Кинх, Дао ), Таиланд (Тай Дам в Провинция Канчанабури, Кхон Муанг в Провинция Мэхонгсон, Тай Юань в Северный Таиланд, Тайский люэ в Северный Таиланд ), Мьянма
- R9c1b2 - Таиланд (Кхон Муанг в Провинция Чианграй ), Тайвань (Макатао, и Т. Д.), Филиппины (Ифугао, Бугкалот ), Восточный Тимор
- R9c1
- F
- R22
- R9b - Камбоджа, Таиланд (Лао Исан в Провинция Убонратчатхани и Провинция Рой-Эт ),[53] Гвинея
- R9
- R11'B (16189)
- R11
- R11a
- B
- R24
- R11
- R12'21
- R12
- R21
- R22
- R14
- R23
- R30
- R30a
- R30b
- R30b1
- R31
- R31a
- R31a1
- R31b
- R31a
- R32
- п
- U
Рекомендации
- ^ а б Соарес, Педро; Эрмини, Лука; Томсон, Ноэль; Мормина, Мару; Рито, Тереза; Рёль, Арне; Салас, Антонио; Оппенгеймер, Стивен; Маколей, Винсент (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека». Американский журнал генетики человека. 84 (6): 740–59. Дои:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. ЧВК 2694979. PMID 19500773.
- ^ а б Маджи, Сувенду; Krithika, S .; Васул, Т. (2008). «Распространение митохондриальной ДНК макрогаплогруппы N в Индии с особым упором на гаплогруппу R и ее субгаплогруппу U» (PDF). Международный журнал генетики человека. 8 (1–2): 85–96. Дои:10.1080/09723757.2008.11886022. S2CID 14231815.
- ^ а б c Кармин, Моника (2005). Гаплогруппа R митохондриальной ДНК человека в Индии: рассечение филогенетического древа южноазиатских специфических линий (Магистерская диссертация). Тартуский университет. HDL:10062/567. OCLC 692161090.[страница нужна ]
- ^ Ларруга, Хосе М. (23 мая 2017 г.). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из основного региона Юго-Восточной Азии». BMC Эволюционная биология. 17 (1): 115. Дои:10.1186 / s12862-017-0964-5. ЧВК 5442693. PMID 28535779.
- ^ а б Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2009). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386–94. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.
- ^ а б Ларруга, Хосе М. (23 мая 2017 г.). «Носители макрогаплогруппы митохондриальной ДНК. р колонизировал Евразию и Австралазию из основного района Юго-Восточной Азии ". BMC Эволюционная биология. 17 (1): 115. Дои:10.1186 / s12862-017-0964-5. ЧВК 5442693. PMID 28535779.
- ^ а б c d Паланичхами, Маллия Гундер; Сунь, Чанг; Агравал, Суракша; Бандельт, Ханс-Юрген; Конг, Цин-Пэн; Хан, Фейсал; Ван, Чэн-Е; Чаудхури, Тапас Кумар; Палла, Венкатрамана (2004). «Филогения макрогаплогруппы N митохондриальной ДНК в Индии, на основе полного секвенирования: значение для населения Южной Азии». Американский журнал генетики человека. 75 (6): 966–78. Дои:10.1086/425871. ЧВК 1182158. PMID 15467980.
- ^ Марреро, Патрисия; Абу-Амеро, Халед К.; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М (2016). «Носители митохондриальной ДНК человека макрогаплогруппы M колонизировали Индию из Юго-Восточной Азии». BMC Эволюционная биология. 16 (1): 246. Дои:10.1186 / s12862-016-0816-8. ЧВК 5105315. PMID 27832758.
- ^ Ларруга, Хосе М; Марреро, Патрисия; Абу-Амеро, Халед К.; Голубенко Мария В; Кабрера, Висенте М (2017). «Носители митохондриальной ДНК макрогаплогруппы R колонизировали Евразию и Австралазию из основного региона Юго-Восточной Азии». BMC Эволюционная биология. 17 (1): 115. Дои:10.1186 / s12862-017-0964-5. ЧВК 5442693. PMID 28535779.
- ^ Черный Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, выявленное генетическим разнообразием митохондрий и Y-хромосомы» (PDF). Американский журнал физической антропологии. 138 (4): 439–447. Дои:10.1002 / ajpa.20960. PMID 19012329. Архивировано из оригинал (PDF) 6 октября 2016 г.. Получено 13 июн 2016.
- ^ Schuenemann, Verena J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды». Nature Communications. 8: 15694. Bibcode:2017НатКо ... 815694S. Дои:10.1038 / ncomms15694. ЧВК 5459999. PMID 28556824.
- ^ Брушаки, Фарназ; Thomas, Mark G .; Линк, Вивиан; Лопес, Сайоа; ван Дорп, Люси; Кирсанов, Карола; Хофманова, Зузана; Дикманн, Йоан; Кэссиди, Лара М .; Диес-дель-Молино, Дэвид; Кусатанас, Афанасий; Продам, Кристиан; Робсон, Гарри К .; Мартиниано, Руи; Блёхер, Йенс; Шой, Амели; Крейцер, Сюзанна; Боллонгино, Рут; Бобо, декан; Давуди, Хоссейн; Муньос, Оливия; Куррат, Матиас; Абди, Камьяр; Биглари, Ферейдун; Крейг, Оливер Э .; Брэдли, Дэниел Дж .; Шеннан, Стивен; Veeramah, Krishna R .; Машкур, Марджан; Вегманн, Даниэль; Хелленталь, Гарретт; Бургер, Иоахим (29 июля 2016 г.). «Ранненеолитические геномы Восточного Плодородного Полумесяца» (PDF). Наука. 353 (6298): 499–503. Bibcode:2016Научный ... 353..499B. Дои:10.1126 / science.aaf7943. ЧВК 5113750. PMID 27417496. Получено 17 ноября 2019.
- ^ Нет, Эми. «АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДАННЫХ В МЕЖДИСЦИПЛИНАРНОЙ ОСНОВЕ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ПОСЛЕДНИЙ ЭВОЛЮЦИОННОЙ ИСТОРИИ ЧЕЛОВЕКА И КОМПЛЕКСНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ» (PDF). Университет Флориды. Получено 22 апреля 2016.
- ^ а б c d Кинтана-Мурчи, Луис; Chaix, Raphaëlle; Уэллс, Р. Спенсер; Бехар, Дорон М .; Саяр, Хамид; Скоццари, Розария; Ренго, Кьяра; Аль-Захери, Надия; Семино, Орнелла (2004). «Где запад встречается с востоком: сложный ландшафт мтДНК на юго-западе и в коридоре Центральной Азии». Американский журнал генетики человека. 74 (5): 827–45. Дои:10.1086/383236. ЧВК 1181978. PMID 15077202.
- ^ а б Хельгасон, Агнар; Хики, Эйлин; Гудакр, Сара; Боснес, Видар; Стефанссон, Кари; Уорд, Рык; Сайкс, Брайан (2001). «МтДНК и острова Северной Атлантики: оценка соотношения норвежских и гэльских предков». Американский журнал генетики человека. 68 (3): 723–37. Дои:10.1086/318785. ЧВК 1274484. PMID 11179019.
- ^ а б Абу-Амеро, Халед К.; Ларруга, Хосе М.; Кабрера, Висенте М; Гонсалес, Ана М (2008). «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове». BMC Эволюционная биология. 8: 45. Дои:10.1186/1471-2148-8-45. ЧВК 2268671. PMID 18269758.
- ^ а б Малярчук, Б .; Grzybowski, T .; Деренко, М .; Перкова, М .; Vanecek, T .; Lazur, J .; Gomolcak, P .; Цыбовский, И. (2008). «Филогения митохондриальной ДНК у восточных и западных славян». Молекулярная биология и эволюция. 25 (8): 1651–8. Дои:10.1093 / молбев / msn114. PMID 18477584.
- ^ Миттник, Алисса; Ван, Чуан-Чао; Пфренгл, Саския; Даубарас, Мантас; Зарина, Гунита; Халлгрен, Фредрик; Аллмяэ, Райли; Хартанович Валерий; Моисеев, Вячеслав; Тырв, Мари; Фуртвенглер, Аня (30.01.2018). «Генетическая предыстория региона Балтийского моря». Nature Communications. 9 (1): 442. Bibcode:2018НатКо ... 9..442 млн. Дои:10.1038 / s41467-018-02825-9. ISSN 2041-1723. ЧВК 5789860. PMID 29382937.
- ^ Серк, Пия (2004). Гаплогруппа J митохондриальной ДНК человека в Европе и на Ближнем Востоке (Магистерская диссертация). Эстония: Тартуский университет. HDL:10062/777. OCLC 692161303.[страница нужна ]
- ^ oxfordancestors.com Материнское происхождение В архиве 2017-07-15 в Wayback Machine
- ^ Манниса ван Овена PhyloTree.org - поддерево мтДНК R В архиве 2009-06-13 на Wayback Machine
- ^ Фу, Цяомэй; Пост, Козимо; Хайдинжак, Матея; Петр, Мартин; Маллик, Свапан; Фернандес, Даниэль; Фуртвенглер, Аня; Хаак, Вольфганг; Мейер, Матиас; Миттник, Алисса; Никель, Биргит (июнь 2016 г.). «Генетическая история ледникового периода Европы». Природа. 534 (7606): 200–205. Bibcode:2016Натура.534..200F. Дои:10.1038 / природа17993. HDL:10211.3/198594. ISSN 1476-4687. ЧВК 4943878. PMID 27135931.
- ^ а б c Мецпалу, Майт; Кивисилд, Тоомас; Мецпалу, Эне; Парик, Юри; Худжашов, Георгий; Калдма, Катрин; Серк, Пия; Кармин, Моника; Бехар, Дорон М; Гилберт, М. Томас П.; Эндикотт, Филипп; Мастана, Сарабджит; Папиха, Суриндер С; Скорецкий, Карл; Торрони, Антонио; Виллемс, Ричард (2004). «Большинство существующих границ мтДНК в южной и юго-западной Азии, вероятно, были сформированы во время первоначального заселения Евразии анатомически современными людьми». BMC Genetics. 5: 26. Дои:10.1186/1471-2156-5-26. ЧВК 516768. PMID 15339343.
- ^ а б c d е ж грамм Чаубей, Гианешвер; Кармин, Моника; Мецпалу, Эне; Мецпалу, Майт; Сельви-Рани, Дипа; Сингх, Виджай; Парик, Юри; Сольник, Ану; Найду, Б. Пратап; Кумар, Аджай; Адарш, Нихарика; Маллик, Чандана; Триведи, Бхаргав; Пракаш, Свами; Редди, Рамеш; Шукла, Парул; Бхагат, Санджана; Верма, Свати; Васник, Самикша; Хан, Имран; Барва, Аншу; Саху, Дипти; Шарма, Арчана; Рашид, Мамун; Чандра, Вишал; Редди, Алла Г; Торрони, Антонио; Фоли, Роберт А; Тангарадж, Кумарасами; Сингх, Лалджи (2008). «Филогеография мтДНК гаплогруппы R7 на Индийском полуострове». BMC Эволюционная биология. 8: 227. Дои:10.1186/1471-2148-8-227. ЧВК 2529308. PMID 18680585.
- ^ а б c «Рисунок 4. Частотное распределение клад R7a и R7b на Индийском субконтиненте». в Чаубей, Гианешвер; Кармин, Моника; Мецпалу, Эне; Мецпалу, Майт; Сельви-Рани, Дипа; Сингх, Виджай; Парик, Юри; Сольник, Ану; Найду, Б. Пратап; Кумар, Аджай; Адарш, Нихарика; Маллик, Чандана; Триведи, Бхаргав; Пракаш, Свами; Редди, Рамеш; Шукла, Парул; Бхагат, Санджана; Верма, Свати; Васник, Самикша; Хан, Имран; Барва, Аншу; Саху, Дипти; Шарма, Арчана; Рашид, Мамун; Чандра, Вишал; Редди, Алла Г; Торрони, Антонио; Фоли, Роберт А; Тангарадж, Кумарасами; Сингх, Лалджи (2008). «Филогеография мтДНК гаплогруппы R7 на Индийском полуострове». BMC Эволюционная биология. 8: 227. Дои:10.1186/1471-2148-8-227. ЧВК 2529308. PMID 18680585.
- ^ Рисунок 4 в Тангарадж, Кумарасами; Нандан, Амрита; Шарма, Вишвас; Шарма, Варун Кумар; Eaaswarkhanth, Muthukrishnan; Патра, Прадип Кумар; Сингх, Сандхья; Рекха, саши; Дуа, Моника; и другие. (2009). Ахмед, Нияз (ред.). «Глубокое распространение in situ мтДНК гаплогруппы R8 в Южной Азии». PLOS ONE. 4 (8): e6545. Bibcode:2009PLoSO ... 4.6545T. Дои:10.1371 / journal.pone.0006545. ЧВК 2718812. PMID 19662095.
- ^ Ян Логан 2009, Гаплогруппа R9b, Сайт митохондриальной ДНК
- ^ а б Hill, C .; Soares, P .; Мормина, М .; MacAulay, V .; Meehan, W .; Blackburn, J .; Clarke, D .; Raja, J.M .; Исмаил, П. (2006). «Филогеография и этногенез аборигенов Юго-Восточной Азии». Молекулярная биология и эволюция. 23 (12): 2480–91. Дои:10.1093 / molbev / msl124. PMID 16982817.
- ^ Скоулз, Кларисса; Сиддл, Кэтрин; Дюкурно, Аксель; Кривелларо, Федерика; Ярве, Мари; Рутси, Сиири; Беллатти, Мэгги; Таббада, Кристина; Мормина, Мару (2011). «Генетическое разнообразие и доказательства примеси популяции в Batak Negritos из Палавана». Американский журнал физической антропологии. 146 (1): 62–72. Дои:10.1002 / ajpa.21544. PMID 21796613.
- ^ Альберт Мин-Шань Ко, Чунг-Ю Чен, Цяомей Фу, и другие. (2014), «Ранние австронезийцы: на Тайвань и из Тайваня». Американский журнал генетики человека 94, 426–436, 6 марта 2014 г.
- ^ а б c Хилл, Кэтрин; Соарес, Педро; Мормина, Мару; Маколей, Винсент; Кларк, Дуги; Блюмбах, Петя Б .; Визуете-Форстер, Матье; Форстер, Питер; Bulbeck, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2007). «Митохондриальная стратиграфия островов Юго-Восточной Азии». Американский журнал генетики человека. 80 (1): 29–43. Дои:10.1086/510412. ЧВК 1876738. PMID 17160892.
- ^ Деренко, Мирослава; Малярчук, Борис; Гжибовски, Томаш; Денисова, Галина; Дамбуева Ирина; Перкова, Мария; Доржу, Чодураа; Лузина, Фаина; Ли, Хонг Гю (2007). «Филогеографический анализ митохондриальной ДНК в популяциях Северной Азии». Американский журнал генетики человека. 81 (5): 1025–41. Дои:10.1086/522933. ЧВК 2265662. PMID 17924343.
- ^ Tanaka, M .; Кабрера, ВМ; Гонсалес, AM; Ларруга, JM; Takeyasu, T; Fuku, N; Guo, LJ; Hirose, R; Фудзита, Y (2004). «Вариации митохондриального генома в Восточной Азии и заселение Японии». Геномные исследования. 14 (10a): 1832–50. Дои:10.1101 / гр.2286304. ЧВК 524407. PMID 15466285.
- ^ Хван Ён Ли, Джи-Ын Ю, Мён Джин Пак, Ухи Чунг, Чонг-Юл Ким и Кён-Джин Шин, «Определение гаплогруппы восточноазиатской мтДНК у корейцев: анализ SNP кодирующей области на уровне гаплогруппы и последовательность контрольной области на уровне субгаплогрупп» анализ." Электрофорез (2006). DOI 10.1002 / elps.200600151.
- ^ Он, J-D; Пэн, М-С; Куанг, HH; Данг, КП; Trieu, AV; и другие. (2012). «Патрилинейный взгляд на австронезийскую диффузию в континентальной части Юго-Восточной Азии». PLOS ONE. 7 (5): e36437. Bibcode:2012PLoSO ... 736437H. Дои:10.1371 / journal.pone.0036437. ЧВК 3346718. PMID 22586471.
- ^ а б Tabbada, K. A .; Trejaut, J .; Loo, J.-H .; Chen, Y.-M .; Lin, M .; Mirazon-Lahr, M .; Кивисилд, Т .; Де Унгриа, М.С.А. (2009). "Разнообразие митохондриальной ДНК Филиппин: густонаселенный виадук между Тайванем и Индонезией?". Молекулярная биология и эволюция. 27 (1): 21–31. Дои:10.1093 / молбев / msp215. PMID 19755666.
- ^ Пирсон, М. Дж .; Мартинес-Ариас, Р. Голландия, BR; Геммелл, штат Нью-Джерси; Hurles, ME; Пенни, Д. (2006). «Расшифровка прошлых перемещений населения в Океании: доказательно оптимальные деревья из 127 геномов мтДНК». Молекулярная биология и эволюция. 23 (10): 1966–75. Дои:10.1093 / molbev / msl063. ЧВК 2674580. PMID 16855009.
- ^ Кутанан, Вибху; Кампуансай, Джатупол; Чангмай, Пия; и другие. (2018). «Противопоставление материнской и отцовской генетической изменчивости групп охотников-собирателей в Таиланде». Научные отчеты. 8: 1536. Bibcode:2018НатСР ... 8.1536K. Дои:10.1038 / s41598-018-20020-0. ЧВК 5784115. PMID 29367746.
- ^ Гаплогруппа R14, Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана
- ^ Мона, С .; Grunz, K. E .; Брауэр, С .; Pakendorf, B .; Castri, L .; Sudoyo, H .; Marzuki, S .; Barnes, R.H .; Шмидтке, Дж. (2009). «История генетических примесей Восточной Индонезии, выявленная анализом Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». Молекулярная биология и эволюция. 26 (8): 1865–77. Дои:10.1093 / molbev / msp097. PMID 19414523.
- ^ Триведи, Раджни; Sitalaximi, T .; Банерджи, Джилам; и другие. (2006). «Молекулярное понимание происхождения Шомпена, сокращающегося населения Никобарского архипелага». J Hum Genet. 51 (3): 217–226. Дои:10.1007 / s10038-005-0349-2. PMID 16453062.
- ^ Пэн, Мин-Шэн; Хо Куанг, Хай; Фам Данг, Кхоа; и другие. (2010). «Прослеживание австронезийского следа в континентальной части Юго-Восточной Азии: взгляд на митохондриальную ДНК». Мол. Биол. Evol. 27 (10): 2417–2430. Дои:10.1093 / молбев / msq131. PMID 20513740.
- ^ а б Форнарино, Симона; Пала, Мария; Батталья, Винченца; Маранта, Рамона; Ахилли, Алессандро; Модиано, Гвидо; Торрони, Антонио; Семино, Орнелла; Сантачиара-Бенеречетти, Сильвана А (2009). «Разнообразие митохондрий и Y-хромосомы у Tharus (Непал): резервуар генетической изменчивости». BMC Эволюционная биология. 9: 154. Дои:10.1186/1471-2148-9-154. ЧВК 2720951. PMID 19573232.
- ^ а б c Friedlaender, J .; Schurr, T; Gentz, F; Коки, G; Friedlaender, F; Хорват, Г; Бабб, П; Cerchio, S; Kaestle, F (2005). «Расширение митохондриальных гаплогрупп P и Q в юго-западной части Тихого океана». Молекулярная биология и эволюция. 22 (6): 1506–17. Дои:10.1093 / molbev / msi142. PMID 15814828.
- ^ Kayser, M .; Брауэр, S; Cordaux, R; Касто, А; Лао, О; Животовский, Л.А.; Мойз-Фори, К; Рутледж, РБ; Schiefenhoevel, W. (2006). «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: мтДНК и градиенты Y-хромосомы через Тихий океан». Молекулярная биология и эволюция. 23 (11): 2234–44. Дои:10.1093 / molbev / msl093. PMID 16923821.
- ^ Хардинг, Розалинд 2006, Анализ генов австралийских аборигенов. В архиве 2009-09-20 на Wayback Machine Оксфордский университет
- ^ Худжашов, Г .; Кивисилд, Т .; Андерхилл, П. А .; Endicott, P .; Sanchez, J. J .; Lin, A. A .; Shen, P .; Oefner, P .; Renfrew, C .; и другие. (2007). «Выявление доисторического поселения Австралии с помощью анализа Y-хромосомы и мтДНК». Труды Национальной академии наук. 104 (21): 8726–30. Bibcode:2007PNAS..104.8726H. Дои:10.1073 / pnas.0702928104. JSTOR 25427741. ЧВК 1885570. PMID 17496137.
- ^ Страница мтДНК гаплогруппы U1a на сайте cagetti.com[ненадежный источник? ]
- ^ Карима Фадхлауи-Зид; Лаура Родригес-Ботиге; Неджиб Науи; Амель Бенаммар-Эльгаайед; Франческ Калафель; Дэвид Комас (май 2011 г.). «Структура митохондриальной ДНК в Северной Африке выявляет генетический разрыв в долине Нила» (PDF). Американский журнал физической антропологии. 145 (1): 107–117. Дои:10.1002 / ajpa.21472. HDL:10261/42802. PMID 21312180. Получено 22 апреля 2016.
- ^ Мака-Мейер, Николь; Гонсалес, Ана М; Пестано, Хосе; Флорес, Карлос; Ларруга, Хосе М.; Кабрера, Висенте М (2003). «Транзит митохондриальной ДНК между Западной Азией и Северной Африкой, выведенный из филогеографии U6». BMC Genetics. 4: 15. Дои:10.1186/1471-2156-4-15. ЧВК 270091. PMID 14563219.
- ^ Мохамед, Хишам Юсиф Хасан. «Генетические закономерности вариации Y-хромосомы и митохондриальной ДНК с последствиями для населения Судана» (PDF). Хартумский университет. Получено 22 апреля 2016.
- ^ Бернард Секер; Роза Фрегель; Хосе М. Ларруга; Висенте М. Кабрера; Филипп Эндикотт; Хосе Дж. Пестано; Ана М. Гонсалес (2014). «История потока гена гаплогруппы U6 митохондриальной ДНК Северной Африки на африканский, евразийский и американский континенты». BMC Эволюционная биология. 14: 109. Дои:10.1186/1471-2148-14-109. ЧВК 4062890. PMID 24885141.
- ^ а б c Ошибка цитирования: указанная ссылка
Кутанан2016
был вызван, но не определен (см. страница помощи).
внешняя ссылка
- Манниса ван Овена PhyloTree.org - поддерево мтДНК R
- Яна Логана Сайт митохондриальной ДНК
Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная Ева (L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | грамм | Q | О | А | S | р | я | W | Икс | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pre-JT | п | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ЧАС | V | J | Т |