Митохондриальный код беспозвоночных - Википедия - Invertebrate mitochondrial code

В митохондриальный код беспозвоночных (таблица перевода 5) это генетический код используется митохондриальный геном беспозвоночные.

Код

   AA = FFLLSSSSYY ** CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSSSVVVVVVAAAADDEEGGGG
Начинается = --- М ---------------------------- ММММ --------------- М ------------
 Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Базы: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (T) или урацил (U).

Аминокислоты: Аланин (Ала, А), Аргинин (Arg, R), Аспарагин (Asn, N), Аспарагиновая кислота (Asp, D), Цистеин (Cys, C), Глютаминовая кислота (Клей), Глутамин (Gln, Q), Глицин (Gly, G), Гистидин (Его, H), Изолейцин (Иль, я), Лейцин (Leu, L), Лизин (Лис, К), Метионин (Met, M), Фенилаланин (Phe, F), Пролин (Pro, P), Серин (Сер, S), Треонин (Thr, T), Триптофан (Трп, Вт), Тирозин (Tyr, Y), Валин (Вал, В).

Отличия от стандартного кода

Кодоны ДНККодоны РНКЭтот код (5)Стандартный код (1)
AGAAGAСер (S)Arg (Р)
AGGAGGСер (S)Arg (Р)
ATAAUAВстретились (М)Иль (Я)
TGAUGATrp (Вт)СТОП = Тер (*)

Примечание: кодон AGG отсутствует в Дрозофила.[1]

Альтернативные кодоны инициации

Систематический диапазон

Другие варианты

  • Некоторые членистоногие переводят кодон AGG как лизин вместо серина (как в Митохондриальный код птеробранхий ) или аргинин (как в стандартный генетический код ).[6]
  • GUG может действовать как инициатор в Дрозофила.[7][8] AUU не используется в качестве инициатора в Mytilus[4]
  • "Исключительный механизм должен действовать для инициации трансляции мРНК субъединицы I цитохромоксидазы в обоих D. melanogaster[9] и Д. Якуба,[10] так как его единственный вероятный кодон инициации, AUA, находится вне рамки с остальной частью гена. Инициирование, по-видимому, требует «чтения» квадруплета AUAA, что было бы эквивалентно инициированию в AUA, за которым немедленно следует определенный рибосомный сдвиг рамки. Другой возможный механизм ... состоит в том, что мРНК «редактируется», чтобы ввести инициацию AUA в рамку ». [11]

Смотрите также

Рекомендации

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.[12]

  1. ^ Сенгупта С., Ян Х, Хиггс П. Г. (июнь 2007 г.). «Механизмы перераспределения кодонов в митохондриальных генетических кодах». Журнал молекулярной эволюции. 64 (6): 662–88. Дои:10.1007 / s00239-006-0284-7. ЧВК  1894752. PMID  17541678.
  2. ^ Crozier RH, Crozier YC (январь 1993 г.). «Митохондриальный геном пчелы Apis mellifera: полная последовательность и организация генома». Генетика. 133 (1): 97–117. ЧВК  1205303. PMID  8417993.
  3. ^ а б Буре Дж. Л., Браун В. М. (октябрь 1994 г.). «Полная последовательность ДНК митохондриального генома черного хитона, Katharina tunicata». Генетика. 138 (2): 423–43. ЧВК  1206160. PMID  7828825.
  4. ^ а б Хоффманн Р. Дж., Буре Дж. Л., Браун В. М. (июнь 1992 г.). «Новая организация митохондриального генома голубой мидии Mytilus edulis». Генетика. 131 (2): 397–412. ЧВК  1205014. PMID  1386586.
  5. ^ Батуекас Б., Гарес Р., Каллея М., Вальверде-младший, Марко Р. (июль 1988 г.). «Геномная организация митохондриальной ДНК артемии». Исследования нуклеиновых кислот. 16 (14A): 6515–29. Дои:10.1093 / nar / 16.14.6515. ЧВК  338311. PMID  3135541.
  6. ^ Абаскаль Ф., Посада Д., Рыцарь Р. Д., Зардоя Р. (май 2006 г.). «Параллельная эволюция генетического кода в митохондриальных геномах членистоногих». PLOS Биология. 4 (5): e127. Дои:10.1371 / journal.pbio.0040127. ЧВК  1440934. PMID  16620150.
  7. ^ Клэри Д.О., Вольстенхолм Д.Р. (1985). «Молекулярная митохондриальная ДНК Drosophila yakuba: нуклеотидная последовательность, генная организация и генетический код». Журнал молекулярной эволюции. 22 (3): 252–71. Дои:10.1007 / BF02099755. PMID  3001325.
  8. ^ Gadaleta G, Pepe G, De Candia G, Quagliariello C, Sbisà E, Saccone C (июль 1988 г.). «Нуклеотидная последовательность субъединицы 1 НАДН-дегидрогеназы митохондрий крысы. GTG, новый инициаторный кодон в митохондриальном геноме позвоночных». Исследования нуклеиновых кислот. 16 (13): 6233. Дои:10.1093 / nar / 16.13.6233. ЧВК  336868. PMID  3399396.
  9. ^ де Брюйн MH (1983). «Митохондриальная ДНК Drosophila melanogaster, новая организация и генетический код». Природа. 304 (5923): 234–41. Дои:10.1038 / 304234a0. PMID  6408489.
  10. ^ Клэри Д. О., Вольстенхолм Д. Р. (июнь 1983 г.). «Нуклеотидная последовательность сегмента митохондриальной ДНК дрозофилы, которая содержит гены субъединиц II и III цитохром с оксидазы и субъединицы 6 АТФазы». Исследования нуклеиновых кислот. 11 (12): 4211–27. Дои:10.1093 / nar / 11.12.4211. ЧВК  326036. PMID  6306579.
  11. ^ Фокс Т.Д. (1987). «Естественная изменчивость генетического кода». Ежегодный обзор генетики. 21: 67–91. Дои:10.1146 / annurev.ge.21.120187.000435. PMID  3327473.
  12. ^ Эльзановский А, Остелл Дж, Лейпе Д., Сусов В. "Генетические коды". Браузер таксономии. Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США. Получено 26 августа 2015.