XPNPEP3 - XPNPEP3
Xaa-Pro аминопептидаза 3, также известен как аминопептидаза P3, является фермент что у людей кодируется XPNPEP3 ген.[1][2] XPNPEP3 локализуется на митохондрии в почечных клетках и почечные канальцы в шаблоне, зависящем от типа ячейки. Мутации в XPNPEP3 ген был идентифицирован как причина нефронофтиз -подобная болезнь.[2]
Структура
Ген
В XPNPEP3 ген расположен в хромосома 22q 13.2, состоящий из 12 экзоны. Два варианта сплайсинга XPNPEP3, APP3m и APP3c, существуют в митохондриях и цитозоль соответственно.[3][4]
Протеин
APP3m имеет N-концевой домен направленной на митохондрии последовательности (MTS), импортирующий APP3m в митохондрии, где домен удаляется протеолитически, а APP3m функционирует как зрелый белок массой 51 кДа. Напротив, APP3c лишен MTS и экспрессируется в цитозоле.[3] Аргинин в MTS требуется для митохондриального транспорта.[5]
Функция
XPNPEP3 принадлежит к семейству Х-проаминопептидазы (EC 3.4.11.9), которые используют кофактор металла и удаляют N-концевую аминокислоту из пептидов с пролин остаток в предпоследней позиции.[4] Было обнаружено, что при стимуляции фактором некроза опухоли XPNPEP3 высвобождается из митохондрий. XPNPEP3 является новым членом сигнального комплекса TNF-TNFR2 и играет роль в механизме трансдукции TNFR2 сигнал, который активирует оба JNK1 и JNK2 пути. Также наблюдается, что гибель клеток увеличивается при подавлении XPNPEP3, что позволяет предположить, что XPNPEP3 оказывает анти-апоптотический функция.[3] Делеция icp55, ортолога XPNPEP3 S. cerevisiae, увеличивает протеолитическую скорость его субстратов за счет пути деградации белка, характеризуемого правилом N-конца.[6][7]
Клиническое значение
Мутации в XPNPEP3 ген связаны с цилиопатия.[8] Рецессивный мутации в XPNPEP3 ген был идентифицирован как причина нефронофтозоподобного заболевания, характеризующегося почечной интерстициальной инфильтрацией с фиброзом, атрофией канальцев с разрушением базальной мембраны и развитием кисты на кортикомедуллярной границе почек.[9] Фенотипическая изменчивость может быть объяснена разной степенью потери функции у двух разных гомозиготный XPNPEP3 аллели.[2] Фенотипы ресничек, не маскируемые потерей XPNPEP3, могут возникать из-за потери XPNPEP3-зависимого процессинга цилиарных белков.
Взаимодействия
использованная литература
- ^ «Ген Entrez: X-пролиламинопептидаза (аминопептидаза P) 3».
- ^ а б c О'Тул Дж. Ф., Лю Й., Дэвис Э. Э. и др. (Март 2010 г.). «У лиц с мутациями в XPNPEP3, который кодирует митохондриальный белок, развивается нефронофтизоподобная нефропатия». J. Clin. Вкладывать деньги. 120 (3): 791–802. Дои:10.1172 / JCI40076. ЧВК 2827951. PMID 20179356.
- ^ а б c d Иноуэ, Масаки; Камада, Харухико; Абэ, Ясухиро; Хигасисака, Кадзума; Нагано, Казуя; Мукаи, Йохей; Йошиока, Ясуо; Цуцуми, Ясуо; Цунода, Син-Ичи (15.02.2015). «Аминопептидаза P3, новый член сигнального комплекса TNF-TNFR2, индуцирует фосфорилирование JNK1 и JNK2». Журнал клеточной науки. 128 (4): 656–669. Дои:10.1242 / jcs.149385. ISSN 1477-9137. PMID 25609706.
- ^ а б Эршахин, К; Szpaderska, AM; Оравски, AT; Симмонс, штат Вашингтон (15 марта 2005 г.). «Экспрессия изофермента аминопептидазы P в тканях человека и фракциях мононуклеарных клеток периферической крови». Архивы биохимии и биофизики. 435 (2): 303–10. Дои:10.1016 / j.abb.2004.12.023. PMID 15708373.
- ^ Whatcott, Клиффорд Дж .; Meyer-Ficca, Mirella L .; Мейер, Ральф Дж .; Джейкобсон, Майрон К. (10 декабря 2009 г.). «Специфическая изоформа поли (АДФ-рибоза) гликогидролазы нацелена на митохондриальный матрикс N-концевой митохондриальной целевой последовательностью». Экспериментальные исследования клеток. 315 (20): 3477–3485. Дои:10.1016 / j.yexcr.2009.04.005. ISSN 1090-2422. ЧВК 2787692. PMID 19389396.
- ^ Веллер, Майкл (01.10.2010). «Химиотерапия глиом низкой степени злокачественности: когда? Как? Как долго?». Нейроонкология. 12 (10): 1013. Дои:10.1093 / neuonc / noq137. ISSN 1522-8517. ЧВК 3018930. PMID 20861092.
- ^ Варшавский, Александр (01.08.2011). «Путь правила N-конца и регуляция протеолизом». Белковая наука. 20 (8): 1298–1345. Дои:10.1002 / pro.666. ISSN 1469-896X. ЧВК 3189519. PMID 21633985.
- ^ Херд Т.В., Хильдебрандт Ф (2011). «Механизмы нефронофтоза и родственных цилиопатий». Нефрон Эксп. Нефрол. 118 (1): e9 – e14. Дои:10.1159/000320888. ЧВК 2992643. PMID 21071979.
- ^ Hildebrandt, F; Чжоу, Вт (июнь 2007 г.). «Цилиопатии, связанные с нефронофтисом». Журнал Американского общества нефрологов. 18 (6): 1855–71. Дои:10.1681 / asn.2006121344. PMID 17513324.
- ^ Ханна, Хемант; Дэвис, Эрика Э .; Мурга-Замаллоа, Карлос А .; Эстрада-Кускано, Алехандро; Лопес, Ирма; ден Холландер, Аннеке I .; Zonneveld, Marijke N .; Осман, Мохаммад I .; Васим, Наушин (01.06.2009). «Общий аллель в RPGRIP1L является модификатором дегенерации сетчатки при цилиопатиях». Природа Генетика. 41 (6): 739–745. Дои:10,1038 / нг.366. ISSN 1546-1718. ЧВК 2783476. PMID 19430481.
- ^ Баала, Лекбир; Audollent, Софи; Мартинович, Джелена; Озилу, Екатерина; Баброн, Мари-Клод; Шиванандамурти, Шивантини; Сонье, Софи; Саломон, Реми; Гонзалес, Мари (01.07.2007). «Плейотропные эффекты мутаций CEP290 (NPHP6) распространяются на синдром Меккеля». Американский журнал генетики человека. 81 (1): 170–179. Дои:10.1086/519494. ISSN 0002-9297. ЧВК 1950929. PMID 17564974.
дальнейшее чтение
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2004). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК 545604. PMID 15461802.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216.
- Барбе Л., Лундберг Э., Оксволд П. и др. (2008). «К конфокальному субклеточному атласу протеома человека». Мол. Cell. Протеомика. 7 (3): 499–508. Дои:10.1074 / mcp.M700325-MCP200. PMID 18029348.
Эта статья о ген на хромосома человека 22 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |