ZFPM2 - ZFPM2

ZFPM2
Идентификаторы
ПсевдонимыZFPM2, DIH3, FOG2, ZC2HC11B, ZNF89B, hFOG-2, SRXY9, белок цинкового пальца, член семейства FOG 2
Внешние идентификаторыOMIM: 603693 MGI: 1334444 ГомолоГен: 8008 Генные карты: ZFPM2
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение ZFPM2
Геномное расположение ZFPM2
Группа8q23.1Начните104,590,733 бп[1]
Конец105,804,539 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ZFPM2 219778 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_012082
NM_001362836
NM_001362837

NM_011766
NM_001356998

RefSeq (белок)

NP_036214
NP_001349765
NP_001349766

NP_035896
NP_001343927

Расположение (UCSC)Chr 8: 104,59 - 105,8 МбChr 15: 40.66 - 41.1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Цинк-пальцевый белок ZFPM2, т.е. белок цинковых пальцев, член семейства FOG 2, но также называется Друг GATA2, Друг GATA-2, FOG2, или же ТУМАН-2, это белок что у людей кодируется ZFPM2 и у мышей Zfpm2 ген.[5][6][7]

В цинковый палец -содержащий белок, кодируемый этим геном, является широко экспрессируемым членом семейства FOG регуляторы из факторы транскрипции. Семья состоит из ZFPM1 и ZFPM2 гены у людей и Zfpm1 и Zfpm2 гены у мышей. Его члены могут действовать как коактиваторы и / или корепрессоры модулировать активность Факторы транскрипции GATA. То есть белок ZFPM2, по-видимому, способен напрямую взаимодействовать с и тем самым либо усиливать, либо репрессировать способность факторов транскрипции GATA стимулировать экспрессию их генов-мишеней; направление действий ZFPM2 зависит от контекстов промоутер секции различных генов-мишеней GATA.[7]

Белок ZFPM2 взаимодействует в первую очередь с GATA4 но также с GATA2, GATA5, и GATA6 факторы транскрипции. Взаимодействие белка ZFPM2 с GATA4 примечательно тем, что контролирует эмбриональное развитие различных тканей, особенно сердца, диафрагмы и гонады. Соответственно, ZFPM2 мутации ответственны за определенные формы врожденные пороки сердца, врожденные диафрагмальные грыжи,[8] и неоднозначные гениталии[9] у мышей, а также у людей.

Ген

В ZFPM2 ген встречается у самых разных видов животных от мухи людям. Человеческий ген расположен на длинном или q плече хромосомы 8 в положении 23.1 (т.е. 8q23.1) и состоит из 9 экзоны.[10] Эквивалентный ген мыши, Zfpm2, расположен на хромосоме 15 и состоит из 8 экзонов.[11] Нокаутировать из ZFPM2 является эмбриональным летальным исходом для мышей, при этом мыши умирают на 12,5-15,5 дня эмбриона из-за врожденных пороков сердца (тонкие желудочковая мышца сердца, общий атриовентрикулярный канал, а тетралогия Фалло порок развития.[12] ZFPM2 экспрессия у мышей также необходима для нормального развития гонады, легкое и диафрагма.[13]

Протеин

Белки ZFPM2 человека и мыши состоят из 1151 аминокислоты и экспрессируются в различных тканях. Человеческий белок экспрессируется на относительно высоком уровне в яичниках и матке взрослых. эндометрий в то время как мышиный белок экспрессируется на относительно высоком уровне в центральной нервной системе. мозжечок и, на ранних стадиях его развития, сердце. ZFPM2 человека содержит 8 цинковый палец структурные мотивы и напрямую взаимодействует с различными членами Фактор транскрипции GATA семьи, чтобы изменить их способность стимулировать экспрессию своих генов-мишеней. Например, было показано, что он напрямую связывается с N-концевым цинковым пальцем GATA4 фактор транскрипции ингибировать его способность стимулировать экспрессию целевого гена в in vitro модельная система.[13][14][11][10]

Крайний N терминал конец белка ZFPM2 содержит два домена, один из которых непосредственно взаимодействует с Комплекс Ми-2 / NuRD (т.е. ремоделирование нуклеосом и комплекс гистондеацетилазы или комплекс NuRD) и другие из которых связываются CTBP1 или CTBP2 белки. Комплекс NuRD и CtBP классифицируются как корепрессоры. которые действуют, повышая способность ZFPM2 ингибировать способность белков GATA стимулировать экспрессию своих генов-мишеней.[13]

Патофизиология

ZFPM2 регулирует экспрессию определенных генов-мишеней GATA посредством повышающей или понижающей регуляции способности факторов транскрипции GATA, в первую очередь GATA3, GATA4, GATA5, и GATA6, чтобы стимулировать экспрессию своих генов-мишеней. Взаимодействие с комплексом NuRD или CTBP может привести к тому, что ZFPM2 подавит способность белков GATA3-6 стимулировать экспрессию их генов-мишеней.[13]

Клиническая значимость

Врожденный порок сердца

Мутации в ZFPM2 ген ответственны за редкие и спорадические случаи врожденный порок сердца. К ним относятся случаи Тетралогия Фалло, артериальный ствол, недостаточность клапана легочной артерии в сочетании с дефект межжелудочковой перегородки, двойной выход правого желудочка, транспозиция магистральных артерий, и прерванная дуга аорты.[14] Спорадические случаи тетралогии Фалло были также обнаружены в тех случаях, когда уровни Гиперметилирование в CpG сайты в ZFPM2 ген промоутер были значительно возвышены; эти случаи были связаны со снижением уровней сердечной ткани мРНК за ZFPM2.[15] Эти случаи, вероятно, отражают роль ZFPM2 в обеспечении функции GATA4 в эмбриональном развитии сердца.[12][13]

Врожденная диафрагмальная грыжа

ZFPM2 гетерозиготный генные мутации ответственны за спорадические случаи врожденные диафрагмальные грыжи. Это нарушение развития может быть основной причиной развития врожденного легкого. дисплазия и легочно-сосудистое заболевание, которое приводит к легочная гипертония. Эти дефекты считаются следствием гаплонедостаточность в белке ZFPM2 и, как следствие, неспособность GATA4 способствовать нормальному развитию легких.[8][16]

Половое развитие

Гетерозиготный мутации в ZFPM2 ген ответственны за спорадические, очень редкие случаи семейной формы нарушения полового развития, неоднозначные гениталии. Расстройство, вероятно, отражает гаплонедостаточность белка ZFPM2 и, как следствие, снижение регуляции GATA4, способствуя нормальному развитию гонад.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169946 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022306 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Свенссон ЕС, Тафтс Р.Л., Полк К.Э., Лейден Дж. М. (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование FOG-2: модулятор фактора транскрипции GATA-4 в кардиомиоцитах». Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (3): 956–61. Дои:10.1073 / пнас.96.3.956. ЧВК  15332. PMID  9927675.
  6. ^ Холмс М., Тернер Дж., Фокс А., Чизолм О, Кроссли М., Чонг Б. (сентябрь 1999 г.). «hFOG-2, новый белок цинкового пальца, связывает ко-репрессор mCtBP2 и модулирует GATA-опосредованную активацию». J Biol Chem. 274 (33): 23491–8. Дои:10.1074 / jbc.274.33.23491. PMID  10438528.
  7. ^ а б «Ген Entrez: белок цинковых пальцев ZFPM2, мультитип 2».
  8. ^ а б Брэди П.Д., Ван Хаудт Дж., Каллеварт Б., Депрест Дж., Девриндт К., Вермиш Дж. Р. (2014). «Секвенирование экзома идентифицирует ZFPM2 как причину изолированной семейной врожденной диафрагмальной грыжи и, возможно, сердечно-сосудистых пороков развития». Европейский журнал медицинской генетики. 57 (6): 247–52. Дои:10.1016 / j.ejmg.2014.04.006. PMID  24769157.
  9. ^ а б Браунер Р., Пикард-Диваль Ф., Лоттманн Х., Руже С., Биньон-Топалович Дж., Башамбу А., МакЭлриви К. (ноябрь 2016 г.). «Семейные формы нарушений полового развития могут быть обычным явлением, если бесплодие считается сопутствующим заболеванием». BMC Педиатрия. 16 (1): 195. Дои:10.1186 / s12887-016-0737-0. ЧВК  5129225. PMID  27899089.
  10. ^ а б https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/23414
  11. ^ а б https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/22762
  12. ^ а б Кантор А.Б., Оркин С.Х. (февраль 2005 г.). «Корегуляция факторов GATA с помощью семейства« Друг GATA »(FOG) многотипных белков цинкового пальца». Семинары по клеточной биологии и биологии развития. 16 (1): 117–28. Дои:10.1016 / j.semcdb.2004.10.006. PMID  15659346.
  13. ^ а б c d е Chlon TM, Crispino JD (ноябрь 2012 г.). «Комбинаторная регуляция спецификации тканей факторами GATA и FOG». Разработка. 139 (21): 3905–16. Дои:10.1242 / dev.080440. ЧВК  3472596. PMID  23048181.
  14. ^ а б Пу Т, Лю И, Сюй Р., Ли Ф, Чен С., Сун К. (февраль 2018 г.). «Выявление мутаций ZFPM2 у пациентов со спорадическим конотрункальным пороком сердца». Молекулярная генетика и геномика: MGG. 293 (1): 217–223. Дои:10.1007 / s00438-017-1373-6. PMID  29018978. S2CID  23888323.
  15. ^ Шэн В., Чен Л., Ван Х, Ма Х, Ма Д., Хуан Г. (июль 2016 г.). «CpG-островное метилирование ZFPM2 идентифицировано в тетралогии образцов фалло». Педиатрические исследования. 80 (1): 151–8. Дои:10.1038 / пр.2016.42. PMID  26959486.
  16. ^ Kardon G, Ackerman KG, McCulley DJ, Shen Y, Wynn J, Shang L, Bogenschutz E, Sun X, Chung WK ​​(август 2017 г.). «Врожденные диафрагмальные грыжи: от генов до механизмов и методов лечения». Модели и механизмы заболеваний. 10 (8): 955–970. Дои:10.1242 / дмм.028365. ЧВК  5560060. PMID  28768736.

дальнейшее чтение