CAPN1 - Википедия - CAPN1

CAPN1
Белок CAPN1 PDB 1zcm.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCAPN1, CANP, CANP1, CANPL1, muCANP, muCL, SPG76, кальпаин 1
Внешние идентификаторыOMIM: 114220 MGI: 88263 ГомолоГен: 3800 Генные карты: CAPN1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение CAPN1
Геномное расположение CAPN1
Группа11q13.1Начинать65,180,566 бп[1]
Конец65,212,006 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CAPN1 200752 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001198868
NM_001198869
NM_005186

NM_001110504
NM_007600

RefSeq (белок)

NP_001185797
NP_001185798
NP_005177

NP_001103974
NP_031626

Расположение (UCSC)Chr 11: 65.18 - 65.21 МбChr 19: 5.99 - 6.02 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Каталитическая субъединица кальпаина-1 это белок что у людей кодируется CAPN1 ген.[5][6][7]

Функция

В Calpains, активируемые кальцием нейтральные протеазы, нелизосомальные, внутриклеточные цистеиновые протеазы. Кальпаины млекопитающих включают в себя повсеместно встречающиеся, специфичные для желудка и мышечной ткани белки. Повсеместно распространенные ферменты состоят из гетеродимеров с отдельными большими каталитическими субъединицами, связанными с общей небольшой регуляторной субъединицей. Этот ген кодирует большую субъединицу универсального фермента кальпаина 1.[7]

Взаимодействия

CAPN1 был показан взаимодействовать с PSEN2.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000014216 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024942 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Aoki K, Imajoh S, Ohno S, Emori Y, Koike M, Kosaki G, Suzuki K (октябрь 1986). «Полная аминокислотная последовательность большой субъединицы формы Са2 + -активированной нейтральной протеазы человека с низким содержанием Ca2 + (muCANP), выведенная из ее последовательности кДНК». FEBS Lett. 205 (2): 313–7. Дои:10.1016 / 0014-5793 (86) 80919-X. PMID  3017764. S2CID  36697759.
  6. ^ Оно С., Миносима С., Кудо Дж., Фукуяма Р., Симидзу Й., Оми-Имаджо С., Симидзу Н., Судзуки К. (ноябрь 1990 г.). «Четыре гена семейства кальпаинов расположены на четырех разных хромосомах человека». Cytogenet Cell Genet. 53 (4): 225–9. Дои:10.1159/000132937. PMID  2209092.
  7. ^ а б «Ген Entrez: CAPN1 кальпаин 1, (mu / I) большая субъединица».
  8. ^ Шинозаки К., Маруяма К., Куме Х, Томита Т., Сайдо Т.С., Ивацубо Т., Обата К. (1998). «Домен петли пресенилина 2 взаимодействует с С-концевой областью мю-кальпаина». Int. J. Mol. Med. 1 (5): 797–9. Дои:10.3892 / ijmm.1.5.797. PMID  9852298.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка