Caspase 7 - Википедия - Caspase 7

CASP7
Белок CASP7 PDB 1f1j.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCASP7, CASP-7, CMH-1, ICE-LAP3, LICE2, MCH3, каспаза 7
Внешние идентификаторыOMIM: 601761 MGI: 109383 ГомолоГен: 11168 Генные карты: CASP7
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение CASP7
Геномное расположение CASP7
Группа10q25.3Начинать113,679,162 бп[1]
Конец113,730,907 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CASP7 207181 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

840

12369

Ансамбль

ENSG00000165806

ENSMUSG00000025076

UniProt

P55210

P97864

RefSeq (мРНК)

NM_007611

RefSeq (белок)

NP_031637

Расположение (UCSC)Chr 10: 113.68 - 113.73 МбChr 19: 56,4 - 56,44 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Каспаза-7, цистеинпептидаза, связанная с апоптозом, также известный как CASP7, представляет собой белок человека, кодируемый CASP7 ген.CASP7 ортологи [5] были выявлены почти во всех млекопитающие для которого доступны полные данные о геноме. Уникальные ортологи также присутствуют в птицы, ящерицы, лиссамфибии, и костистые кости.

Функция

Caspase-7 является членом каспаза (cИстин жерехartate proteас) семейства белков, и было показано, что он является белком-палачом апоптоз. Последовательная активация каспаз играет центральную роль в фазе выполнения клетки. апоптоз. Каспазы существуют как неактивные проферменты которые подвергаются протеолитическому процессингу вышестоящими каспазами (каспаза-8, -9) в консервативных аспарагиновых остатках с образованием двух субъединиц, большой и малой, которые димеризуются с образованием активного фермента в форме гетеротетрамера. Предшественник этой каспазы расщепляется каспаза 3, каспаза 10, и каспаза 9. Он активируется при стимуляции гибели клеток и вызывает апоптоз. Альтернативная сварка приводит к четырем вариантам транскрипции, кодирующим три различных изоформы.[6]

Взаимодействия

Было показано, что каспаза 7 взаимодействовать с:

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165806 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025076 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность CASP7». Архивировано из оригинал на 2016-03-04. Получено 2009-12-20.
  6. ^ «Ген Entrez: каспаза 7 CASP7, цистеинпептидаза, связанная с апоптозом».
  7. ^ Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T., Alnemri ES (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 вызывает апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий». J. Biol. Chem. 277 (16): 13430–7. Дои:10.1074 / jbc.M108029200. PMID  11832478.
  8. ^ Сринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Алнемри Т., Литвак Г., Алнемри Е.С. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное упорядочение Fas-апоптотического пути: протеаза Fas / APO-1 Mch5 представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая активирует несколько Ced-3 / ICE-подобных цистеиновых протеаз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (25): 14486–91. Дои:10.1073 / pnas.93.25.14486. ЧВК  26159. PMID  8962078.
  9. ^ Тамм I, Ван И, Сосвилл Э., Скудьеро Д.А., Винья Н., Олтерсдорф Т., Рид Дж.С. (декабрь 1998 г.). «Белок семейства IAP сурвивин ингибирует активность каспаз и апоптоз, вызванный Fas (CD95), Bax, каспазами и противоопухолевыми препаратами». Рак Res. 58 (23): 5315–20. PMID  9850056.
  10. ^ Shin S, Sung BJ, Cho YS, Kim HJ, Ha NC, Hwang JI, Chung CW, Jung YK, Oh BH (январь 2001 г.). «Антиапоптотический белок сурвивин человека является прямым ингибитором каспазы-3 и -7». Биохимия. 40 (4): 1117–23. Дои:10.1021 / bi001603q. PMID  11170436.
  11. ^ Riedl SJ, Renatus M, Schwarzenbacher R, Zhou Q, Sun C., Fesik SW, Liddington RC, Salvesen GS (март 2001 г.). «Структурные основы ингибирования каспазы-3 с помощью XIAP». Клетка. 104 (5): 791–800. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00274-4. PMID  11257232. S2CID  17915093.
  12. ^ Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р., Сальвесен Г.С., Рид Дж.С. (декабрь 1997 г.). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами конкретных каспаз». EMBO J. 16 (23): 6914–25. Дои:10.1093 / emboj / 16.23.6914. ЧВК  1170295. PMID  9384571.
  13. ^ Deveraux QL, Takahashi R, Salvesen GS, Reed JC (июль 1997 г.). «Х-связанный IAP является прямым ингибитором протеаз гибели клеток». Природа. 388 (6639): 300–4. Дои:10.1038/40901. PMID  9230442. S2CID  4395885.
  14. ^ Судзуки Ю., Накабаяши Ю., Наката К., Рид Дж. К., Такахаши Р. (июль 2001 г.). «Х-связанный ингибитор белка апоптоза (XIAP) ингибирует каспазу-3 и -7 разными способами». J. Biol. Chem. 276 (29): 27058–63. Дои:10.1074 / jbc.M102415200. PMID  11359776.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: C14.004
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P55210 (Человеческая каспаза-7) на PDBe-KB.