COX10 - COX10

COX10
Идентификаторы
ПсевдонимыCOX10, гем A: фактор сборки цитохром с оксидазы фарнезилтрансферазы, фактор сборки цитохром с оксидазы гем A: фарнезилтрансфераза COX10
Внешние идентификаторыOMIM: 602125 MGI: 1917633 ГомолоГен: 80170 Генные карты: COX10
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение COX10
Геномное расположение COX10
Группа17p12Начинать14,069,490 бп[1]
Конец14,231,736 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE COX10 203858 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001303

NM_178379

RefSeq (белок)

NP_001294

NP_848466

Расположение (UCSC)Chr 17: 14.07 - 14.23 МбChr 11: 63.96 - 64.08 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фарнезилтрансфераза протогема IX, митохондриальная является фермент что у людей кодируется COX10 ген.[5][6] Цитохром с оксидаза (COX), конечный компонент митохондриальная дыхательная цепь, катализирует в перенос электронов из уменьшенный цитохром с к кислород. Этот компонент является гетеромерный сложный состоящий из 3 каталитических подразделения закодировано митохондриальные гены и множественные структурные субъединицы, кодируемые ядерные гены. Субъединицы, кодируемые митохондриями, участвуют в переносе электронов, а субъединицы, кодируемые ядром, могут функционировать в регуляции и сборке сложный. Этот ядерный ген, COX10, кодирует гем А: фарнезилтрансфераза, который не является структурной единицей, но необходим для выражение функциональных ЦОГ и функций в созревании простетической группы гема А ЦОГ. Ген мутация, что приводит к замена из лизин для аспарагин (N204K), как установлено, отвечает за дефицит цитохром с оксидазы. Кроме того, этот ген нарушен у пациентов с CMT1A (Шарко-Мари-Зуб тип 1А) дублирование и с HNPP (наследственная невропатия со склонностью к параличам от давления) удаление.[6]

Структура

В COX10 ген расположен на p-плече хромосома 17 в положении 12 и охватывает 139 277 пар оснований.[6] Ген производит белок 48,9 кДа, состоящий из 443 аминокислоты.[7][8] Этот ген имеет необычно длинный 3 'непереведенный регион измерение 1426 пар оснований, по сравнению с 1329 парами оснований открытая рамка чтения.[9] В COX10 ген имеет 7 экзоны всего 135 килобаз в длину.[10] Предполагается, что этот белок содержит 7-9 трансмембранные домены локализованный в митохондриальная внутренняя мембрана.[6] Есть гидрофильный петли между трансмембранными доменами II / III и VI / VII.[11] Этот белок считается составляющая внутренней мембраны митохондрий.[12]

Функция

Белок, кодируемый COX10 фактор сборки, необходимый для синтеза ЦОГ, участвующий в первой стадии митохондриального гема А биосинтетический путь. Это катализирует фарнезилирование из виниловая группа в позиции C2 протогемы (гем B ) и преобразует его в гем O.[10][11]

Клиническое значение

Мутации в COX10 ген может привести к многочисленным клиническим фенотипы, из тубулопатия и лейкодистрофия к Синдром Ли к фатальному инфантильному кардиомиопатия к французско-канадской форме синдрома Ли. Сообщалось о большом разнообразии симптомов, охватывающих весь спектр симптомов дефицита ЦОГ, включая атаксия, гипотония, птоз, лактоацидоз, проксимальная тубулопатия, анемия, миопатия, гипертрофическая кардиомиопатия, нейросенсорная тугоухость, и лейкодистрофия.[11][9]

Кроме того, этот ген нарушен у пациентов с дупликацией CMT1A (тип 1А Шарко-Мари-Тута) и с делецией HNPP (наследственная невропатия со склонностью к параличам от сдавливания).[6]

Взаимодействия

Этот белок взаимодействует с FAM136A.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000006695 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042148 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Мураками Т., Рейтер Л.Т., Лупски-младший (май 1997 г.). «Геномная структура и экспрессия гена человеческого гема А: фарнезилтрансферазы (COX10)». Геномика. 42 (1): 161–4. Дои:10.1006 / geno.1997.4711. PMID  9177788.
  6. ^ а б c d е «Ген Entrez: гомолог COX10 COX10, сборочный белок цитохром с оксидазы, гем A: фарнезилтрансфераза (дрожжи)». Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
  7. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
  8. ^ «СОХ10 - фарнезилтрансфераза протогема IX, митохондриальная». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).[постоянная мертвая ссылка ]
  9. ^ а б Валнот I, фон Клейст-Рецов Дж. К., Барриентос А., Горбатюк М., Таанман Дж. В., Мехай Б., Растин П., Цаголофф А., Мюнних А., Ретиг А. (май 2000 г.). «Мутация в гене гема А: фарнезилтрансферазы человека (COX10) вызывает дефицит цитохром с оксидазы». Молекулярная генетика человека. 9 (8): 1245–9. Дои:10.1093 / hmg / 9.8.1245. PMID  10767350.
  10. ^ а б Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): Сборочный фактор цитохром с оксидазы COX10 - 602125
  11. ^ а б c Антоника Х., Лири С.К., Гверчин Г.Х., Агар Дж. Н., Хорват Р., Кеннауэй Н.Г., Хардинг СО, Якш М., Шубридж Е.А. (октябрь 2003 г.). «Мутации в COX10 приводят к нарушению биосинтеза митохондриального гема A и объясняют множественные клинические фенотипы с ранним началом, связанные с изолированным дефицитом COX». Молекулярная генетика человека. 12 (20): 2693–702. Дои:10.1093 / hmg / ddg284. PMID  12928484.
  12. ^ Уильямс С.Л., Валнот I, Растин П., Таанман Дж. У. (февраль 2004 г.). «Подгруппы цитохром с оксидазы в культурах фибробластов от пациентов, несущих мутации в COX10, SCO1 или SURF1». Журнал биологической химии. 279 (9): 7462–9. Дои:10.1074 / jbc.M309232200. PMID  14607829.
  13. ^ Тайерс М. "Резюме результатов COX10 | BioGRID". thebiogrid.org сущ. Получено 2018-08-07.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.