D-аминокислота - D-Amino acid
D-аминокислоты находятся аминокислоты где стереогенный углерод альфа к аминогруппе имеет D-конфигурацию. Для большинства встречающихся в природе аминокислот этот углерод имеет L-конфигурацию. D-аминокислоты чаще всего встречаются в природе в виде остатков в белках. Они образованы из остатков D-аминокислот, полученных из рибосом.
Структура и общие свойства
D-аланин.
L-аланин.
L- и D-аминокислоты обычно являются энантиомерами. Исключение составляют две аминокислоты с двумя стереогенными центрами, треонин и изолейцин. За исключением этих двух особых случаев, L- и D-аминокислоты имеют идентичные свойства (цвет, растворимость, температура плавления) во многих условиях. Однако в биологическом контексте, который является хиральным, эти энатиомеры могут вести себя по-разному. Таким образом, D-аминокислоты имеют низкую питательную ценность, отчасти потому, что они плохо перевариваются.[1]
Биосинтез
Два фермента превращают L-аминокислоты в D-аминокислоты. D-Аминокислотная рацемаза, PLP-зависимый фермент, рацемизирует аминокислоты за счет образования альфа-иминокислот, при этом стереогенный центр теряется. L-аминокислотные оксидазы преобразовать L-аминокислоты в альфа-кетокислоты, которые подвержены восстановительному аминированию. Некоторые аминокислоты склонны к рацемизации, например, лизин, который рацемизируется за счет образования пипеколиновая кислота.
В пептидах остатки L-аминокислот медленно рацемизируются, что приводит к образованию некоторых остатков D-аминокислот. Рацемизация происходит путем депротонирования метилена, который является альфа-амидогруппой. Скорость повышается с увеличением pH.
Многие D-аминокислоты, обнаруженные в высших организмах, происходят из микробных источников. D-аланин в пептидогликанах, которые составляют стенки бактериальных клеток, помогает хозяину противостоять атакам протеолитических ферментов. Несколько антибиотики, например бацитрацин, содержат остатки D-аминокислот.[1]