Молекулярная диагностика - Википедия - Molecular diagnostics

Специалист, использующий платформу автоматизации молекулярных диагностических тестов "Qiasymphony".

Молекулярная диагностика представляет собой набор методов, используемых для анализа биологические маркеры в геном и протеом - индивидуальный генетический код и как их клетки выражают свои гены как белки —Применяя молекулярная биология к медицинское обследование. Этот метод используется для диагностики и мониторинга заболевания, выявления риска и принятия решения о том, какие методы лечения лучше всего подходят для отдельных пациентов.[1][2](предисловие)

Анализируя особенности пациента и его заболевания, молекулярная диагностика предлагает перспективу персонализированная медицина.[3]

Эти тесты полезны в различных медицинских областях, включая: инфекционное заболевание, онкология, человеческий лейкоцитарный антиген набор текста (который исследует и предсказывает иммунная функция ), коагуляция, и фармакогеномика - генетическое предсказание того, какие лекарства будут работать лучше всего.[4](v-vii) Они пересекаются с клиническая химия (медицинские тесты жидкостей организма).

История

Молекулярная диагностика использует такие методы, как масс-спектрометрия и генные чипы, для определения паттернов экспрессии генов и белков.

Область молекулярной биологии выросла в конце двадцатого века, так же как и ее клиническое применение. В 1980 г. Юет Вай Кан и другие. предложил пренатальный генетический тест на Талассемия который не полагался на Секвенирование ДНК - тогда в зачаточном состоянии - но на рестрикционные ферменты которые разрезают ДНК там, где они распознают определенные короткие последовательности, создавая разную длину цепи ДНК в зависимости от того, какая аллель (генетическая вариация), которой обладал плод.[5] В 1980-х это словосочетание использовалось в названиях таких компаний, как Molecular Diagnostics Incorporated[6] и Исследовательские лаборатории Бетседа Молекулярная диагностика.[7][8]

В течение 1990-х годов идентификация недавно открытых генов и новые методы секвенирования ДНК привели к появлению отдельной области молекулярной и геномной лабораторной медицины; в 1995 г. Ассоциация молекулярной патологии (AMP) был создан, чтобы придать ему структуру. В 1999 году AMP стал соучредителем Журнал медицинской диагностики.[9] Informa Healthcare запущен Обзоры экспертов в области медицинской диагностики в 2001.[1] С 2002 г. Проект HapMap агрегированная информация о однобуквенных генетических различиях, повторяющихся в человеческой популяции - однонуклеотидный полиморфизм - и их отношение к болезни.[2](ch 37) В 2012 году молекулярные методы диагностики талассемии генетическая гибридизация тесты для выявления конкретных однонуклеотидный полиморфизм вызывая заболевание человека.[10]

Поскольку коммерческое применение молекулярной диагностики стало более важным, споры о патентовании генетических открытий, лежащих в основе. В 1998 г. Евросоюз с Директива 98/44 / EC разъяснена что патенты на последовательности ДНК допустимы.[11] В 2010 году в США AMP подала в суд на Мириады генетики оспорить патенты последнего на два гена, BRCA1, BRCA2, которые связаны с раком груди. В 2013, Верховный суд США частично согласился, постановив, что последовательность природного гена не может быть запатентована.[12][13]

Методы

Affymetrix 5.0, микрочип

Разработка с помощью инструментов исследования

Индустриализация инструментов молекулярной биологии сделала их практическим применением в клиниках.[2](предисловие) Миниатюризация в одно портативное устройство может принести медицинскую диагностику в клинику, в офис или домой.[2](предисловие) В клиническая лаборатория требует высоких стандартов надежности; диагностика может потребовать аккредитации или подпадать под действие правил медицинского оборудования.[14] По состоянию на 2011 г., тем не менее, некоторые клинические лаборатории США использовали анализы, продаваемые «только для исследовательских целей».[15]

Лабораторные процессы должны соответствовать нормам, таким как Поправки по улучшению клинической лаборатории, Медицинское страхование Портативность и Акт об ответственности, Надлежащая лабораторная практика, и Управление по контролю за продуктами и лекарствами спецификации в США. Системы управления лабораторной информацией помочь, отслеживая эти процессы.[16] Регламент применяется как к персоналу, так и к расходным материалам. По состоянию на 2012 год, двенадцать штатов США требуют наличия лицензии у молекулярных патологов; несколько досок, таких как Американский совет по медицинской генетике и Американский совет патологии сертифицировать технологов, супервайзеров и директоров лабораторий.[17]

Автоматизация и штрих-кодирование образцов увеличивают производительность и снижают вероятность ошибки или загрязнения во время ручной обработки и отчетности о результатах. Теперь доступны отдельные устройства для проведения анализа от начала до конца.[14]

Анализы

Основные статьи: Анализ и Биологический анализ

Молекулярная диагностика использует in vitro биологические анализы такие как ПЦР-ELISA или же Флуоресцентная гибридизация in situ.[18][19] Анализ обнаруживает молекулу, часто в низких концентрациях, то есть маркер заболевания или риска в образце, взятом у пациента. Сохранение образца перед анализом имеет решающее значение. Следует минимизировать ручное обращение.[20] Хрупкий РНК молекула создает определенные проблемы. Как часть клеточного процесса экспрессии генов в виде белков, он предлагает определенную степень экспрессии генов, но уязвим для гидролиз и разбивка на вездесущие Ферменты РНКазы. Образцы можно быстро заморозить в жидком азоте или инкубировать в консервантах.[2](ch 39)

Поскольку методы молекулярной диагностики могут обнаруживать чувствительные маркеры, эти тесты менее навязчивы, чем традиционные биопсия. Например, потому что бесклеточные нуклеиновые кислоты существуют в организме человека. плазма, простого образца крови может быть достаточно для получения генетической информации из опухолей, трансплантатов или еще не родившегося плода.[2](ch 45) Многие, но не все методы молекулярной диагностики, основанные на нуклеиновые кислоты использование обнаружения полимеразной цепной реакции (ПЦР) для значительного увеличения количества молекул нуклеиновой кислоты, тем самым амплифицируя целевую последовательность (последовательности) в образце пациента.[2](предисловие) ПЦР - это метод амплификации ДНК-матрицы с использованием синтетических праймеров, ДНК-полимеразы и dNTP. Смесь подвергают циклическому изменению, по крайней мере, между двумя температурами: высокой температурой для денатурирования двухцепочечной ДНК в одноцепочечные молекулы и низкой температурой для гибридизации праймера с матрицей и для полимеразы для удлинения праймера. Каждый температурный цикл теоретически удваивает количество целевой последовательности. Обнаружение вариаций последовательности с помощью ПЦР обычно включает разработку и использование олигонуклеотидных реагентов, которые амплифицируют интересующий вариант более эффективно, чем последовательность дикого типа. ПЦР в настоящее время является наиболее широко используемым методом обнаружения последовательностей ДНК.[21] Для обнаружения маркера можно использовать ПЦР в реальном времени, прямое секвенирование,[2](ch 17) микрочипы - сборные чипы, которые проверяют сразу несколько маркеров,[2](ch 24) или MALDI-TOF[22] Тот же принцип применяется к протеом и геном. Белковые массивы с высокой пропускной способностью могут использовать комплементарная ДНК или же антитела связываться и, следовательно, может обнаруживать много разных белков параллельно.[23] Молекулярные диагностические тесты широко различаются по чувствительности, времени, стоимости, охвату и разрешению регулирующих органов. Они также различаются по уровню валидации, применяемой в лабораториях, которые их используют. Следовательно, требуется надежная местная валидация в соответствии с нормативными требованиями и использование соответствующих средств контроля, особенно в тех случаях, когда результат может быть использован для принятия решения о лечении пациента.[24]

Приложения

Чип микроматрицы содержит комплементарную ДНК (кДНК) многим интересующим последовательностям. КДНК флуоресцирует при гибридизации с соответствующим фрагментом ДНК в образце.

Дородовой

Смотрите также: Категория: Анализы при беременности.

Обычные пренатальные тесты на хромосомные аномалии Такие как Синдром Дауна полагаться на анализ количества и внешнего вида хромосом - кариотип. Молекулярные диагностические тесты, например, сравнительный анализ микрочипов. геномная гибридизация Вместо этого протестируйте образец ДНК, и из-за внеклеточной ДНК в плазме может быть менее инвазивным, но по состоянию на 2013 год он все еще является дополнением к обычным тестам.[25]

Уход

Основная статья: Фармакогеномика

Некоторые из пациентов однонуклеотидный полиморфизм - незначительные различия в их ДНК - могут помочь предсказать, как быстро они будут метаболизировать определенные лекарства; это называется фармакогеномика.[26] Например, фермент CYP2C19 метаболизирует несколько лекарств, таких как средство против свертывания крови Клопидогрель, в их активные формы. Некоторые пациенты обладают полиморфизмами в определенных местах гена 2C19, которые вызывают плохие метаболизаторы этих наркотиков; врачи могут проверить эти полиморфизмы и выяснить, будут ли препараты полностью эффективны для этого пациента.[27] Достижения в молекулярной биологии помогли показать, что некоторые синдромы, которые ранее классифицировались как единое заболевание, на самом деле представляют собой несколько подтипов с совершенно разными причинами и методами лечения. Молекулярная диагностика может помочь диагностировать подтип - например, инфекции и рак - или генетический анализ заболевания с унаследованным компонентом, например Синдром Сильвера-Рассела.[1][28]

Инфекционное заболевание

Смотрите также: Патогеномика

Молекулярная диагностика используется для выявления инфекционных заболеваний, таких как: хламидиоз,[29] грипп вирус[30] и туберкулез;[31] или специфические штаммы, такие как Вирус H1N1.[32] Генетическая идентификация может быть быстрой; например петлевое изотермическое усиление тест диагностирует малярийный паразит и достаточно прочен для развивающихся стран.[33] Но, несмотря на эти достижения в области анализа генома, в 2013 году инфекции все еще чаще выявляются другими способами - их протеомом, бактериофаг, или же хроматографический профиль.[34] Молекулярная диагностика также используется для определения конкретного штамма патогена, например, путем определения того, какой устойчивость к лекарству гены, которыми он обладает, и, следовательно, методы лечения, которых следует избегать.[34]

Управление рисками заболеваний

Смотрите также: Скрининг (медицина) и Генетическое тестирование

Геном пациента может включать наследственную или случайную мутацию, которая влияет на вероятность развития заболевания в будущем.[26] Например, Синдром Линча это генетическое заболевание что предрасполагает пациентов к колоректальный и другие виды рака; Раннее обнаружение может привести к тщательному мониторингу, который увеличивает шансы пациента на хороший результат.[35] Сердечно-сосудистый риск указывается биологическими маркерами, и скрининг может измерить риск того, что ребенок родится с генетическим заболеванием, таким как Кистозный фиброз.[36] Генетическое тестирование является сложным с этической точки зрения: пациенты могут не хотеть стресса от осознания своего риска.[37] В странах без всеобщего здравоохранения известный риск может привести к увеличению страховых взносов.[38]

Рак

Смотрите также: Метаболом опухоли

Рак это изменение клеточных процессов, из-за которого опухоль выходит из-под контроля.[26] Раковые клетки иногда имеют мутации в онкогены, Такие как KRAS и CTNNB1 (β-катенин).[39] Анализ молекулярной сигнатуры раковых клеток - ДНК и уровней ее экспрессии через информационная РНК - позволяет врачам охарактеризовать рак и выбрать лучшую терапию для своих пациентов.[26] По состоянию на 2010 г. новой технологией являются анализы, включающие набор антител против определенных молекул белковых маркеров; есть надежда на эти мультиплексные анализы, которые могут измерять сразу несколько маркеров.[40] Другие потенциальные биомаркеры будущего включают: молекулы микро РНК, раковые клетки которых экспрессируют больше, чем здоровые.[41]

Рак - это болезнь с чрезмерно молекулярными причинами и постоянной эволюцией. Также существует неоднородность заболевания даже у отдельного человека. Молекулярные исследования рака доказали важность мутаций-драйверов в росте и метастазировании опухолей.[42] Для исследования рака было разработано множество технологий обнаружения вариаций последовательностей. Эти технологии обычно можно разделить на три подхода: полимеразная цепная реакция (ПЦР), гибридизация и секвенирование следующего поколения (NGS).[21] В настоящее время многие методы ПЦР и гибридизации были одобрены FDA для диагностики in vitro.[43] Однако тесты NGS все еще находятся на ранней стадии клинической диагностики.[44]

При проведении молекулярного диагностического теста на рак одной из важных задач является обнаружение вариаций последовательности ДНК. Образцы биопсии опухоли, используемые для диагностики, всегда содержат всего 5% целевого варианта по сравнению с последовательностью дикого типа. Кроме того, для неинвазивных исследований периферической крови или мочи ДНК-тест должен быть достаточно специфичным, чтобы обнаруживать мутации при частотах вариантных аллелей менее 0,1%.[21]

В настоящее время путем оптимизации традиционной ПЦР появилось новое изобретение - система мутаций, устойчивых к амплификации (ARMS), представляет собой метод обнаружения вариантов последовательности ДНК при раке. Принцип, лежащий в основе ARMS, заключается в том, что активность ферментативного удлинения ДНК-полимераз очень чувствительна к несоответствиям вблизи 3'-конца праймера.[21] Многие компании разработали диагностические тесты на основе праймеров ARMS PCR. Например, Qiagen therascreen,[45] Рош Кобас[46] и Biomerieux THxID[47] разработали одобренные FDA тесты ПЦР для обнаружения рака легких, рака толстой кишки и метастатической меланомы мутаций в генах KRAS, EGFR и BRAF. Их наборы для диагностики in vitro были в основном проверены на геномной ДНК, выделенной из ткани FFPE.

Существуют также микроматрицы, которые используют механизм гибридизации для диагностики рака. С помощью технологии Affymetrix Genechip можно синтезировать более миллиона различных зондов на массиве с пределом обнаружения от одной до десяти копий мРНК на лунку.[21] Оптимизированные микроматрицы обычно рассматриваются для получения повторяемого относительного количественного определения различных мишеней.[48] В настоящее время FDA уже одобрило ряд диагностических тестов, использующих микроматрицы: тесты MammaPrint от Agendia могут информировать о риске рецидива рака молочной железы, анализируя экспрессию 70 генов, связанных с раком груди;[49] Аутогеномический анализ INFNITI CYP2C19 может определять генетические полиморфизмы, чье влияние на терапевтический ответ на антидепрессанты велико;[50] CytoScan Dx от Affymetrix может оценивать умственную отсталость и врожденные нарушения путем анализа хромосомных мутаций.[51]

В будущем диагностические инструменты для рака, вероятно, будут сосредоточены на секвенировании следующего поколения (NGS). Благодаря использованию секвенирования ДНК и РНК для диагностики рака технологии в области инструментов молекулярной диагностики будут развиваться лучше. Хотя производительность и цена NGS резко снизились за последние 10 лет примерно в 100 раз, мы все еще как минимум на 6 порядков отдаляемся от выполнения глубокого секвенирования на уровне всего генома.[52] В настоящее время Ion Torrent разработал несколько панелей NGS на основе трансляционного AmpliSeq, например, Oncomine Comprehensive Assay.[53] Они сосредоточены на использовании глубокого секвенирования генов, связанных с раком, для обнаружения редких вариантов последовательности.

Инструмент молекулярной диагностики можно использовать для оценки риска рака. Например, тест BRCA1 / 2 Myriad Genetics оценивает риск рака груди у женщин на протяжении всей жизни.[21] Кроме того, некоторые виды рака не всегда сопровождаются четкими симптомами. Полезно анализировать людей, когда они не проявляют явных симптомов и, таким образом, могут обнаружить рак на ранних стадиях. Например, тест ColoGuard может использоваться для проверки людей старше 55 лет на колоректальный рак.[54] Рак - это долговременное заболевание с различными стадиями прогрессирования, инструменты молекулярной диагностики могут использоваться для прогнозирования прогрессирования рака. Например, тест OncoType Dx от Genomic Health может оценить риск рака груди. Их технология может информировать пациентов о необходимости пройти курс химиотерапии, когда это необходимо, путем изучения уровней экспрессии РНК в ткани биопсии рака груди.[55]

Ожидается, что с ростом государственной поддержки в области молекулярной диагностики ДНК в ближайшее время станет доступным все большее количество клинических анализов для обнаружения рака. В настоящее время исследования в области диагностики рака быстро развиваются с целью снижения затрат, меньших затрат времени и более простых методов для врачей и пациентов.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c Poste G (май 2001 г.). «Молекулярная диагностика: новый мощный компонент цепочки создания стоимости в здравоохранении». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 1 (1): 1–5. Дои:10.1586/14737159.1.1.1. PMID  11901792.
  2. ^ а б c d е ж грамм час я Буртис CA, Ashwood ER, Bruns DE (2012). Учебник Титца по клинической химии и молекулярной диагностике. Эльзевир. ISBN  978-1-4557-5942-2.
  3. ^ Гамбург, Массачусетс, Коллинз Ф.С. (июль 2010 г.). «Путь к персонализированной медицине». Медицинский журнал Новой Англии. 363 (4): 301–4. Дои:10.1056 / NEJMp1006304. PMID  20551152.
  4. ^ Grody WW, Nakamura RM, Strom CM, Kiechle, Frederick L. (2010). Молекулярная диагностика: методы и приложения для клинической лаборатории. Бостон Массачусетс: Academic Press Inc. ISBN  978-0-12-369428-7.
  5. ^ Кан Ю.В., Ли К.Ю., Фурбетта М., Ангиус А., Цао А. (январь 1980 г.). «Полиморфизм последовательности ДНК в области гена бета-глобина. Применение для пренатальной диагностики талассемии бета 0 в Сардинии». Медицинский журнал Новой Англии. 302 (4): 185–8. Дои:10.1056 / NEJM198001243020401. PMID  6927915.
  6. ^ Кон Д.В., Элтинг Дж. Дж., Фрик М., Элде Р. (июнь 1984 г.). «Селективная локализация секреторного белка паращитовидной железы-I / хромогранина А в мозговом веществе надпочечников в большом количестве эндокринных клеток крысы». Эндокринология. 114 (6): 1963–74. Дои:10.1210 / эндо-114-6-1963. PMID  6233131.
  7. ^ Перселин JE, Стивенс RH (август 1985). «Анти-Fab антитела у людей. Преобладание минорных подклассов иммуноглобулина G при ревматоидном артрите». Журнал клинических исследований. 76 (2): 723–30. Дои:10.1172 / JCI112027. ЧВК  423887. PMID  3928684.
  8. ^ Каплан Г., Гаудернак Г. (октябрь 1982 г.). «Дифференциация моноцитов человека in vitro. Различия в фенотипах моноцитов, индуцированные культивированием на стекле или коллагене». Журнал экспериментальной медицины. 156 (4): 1101–14. Дои:10.1084 / jem.156.4.1101. ЧВК  2186821. PMID  6961188.
  9. ^ Фаусто Н., Каул К.Л. (1999). «Представляем журнал молекулярной диагностики». Журнал молекулярной диагностики. 1 (1): 1. Дои:10.1016 / S1525-1578 (10) 60601-0. ЧВК  1906886.
  10. ^ Атанасовская Б., Божиновский Г., Чакалова Л., Кочева С., Каранфильски О., Пласеска-Каранфиска Д. (декабрь 2012 г.). «Молекулярная диагностика β-талассемии». Балканский журнал медицинской генетики. 15 (Прил.): 61–5. Дои:10.2478 / v10034-012-0021-z. ЧВК  3776673. PMID  24052746.
  11. ^ Шарплз А. (23 марта 2011 г.). «Патенты на гены в Европе относительно стабильны, несмотря на неопределенность в США» Новости генной инженерии и биотехнологии. Получено 13 июн 2013.
  12. ^ Бравин Дж., Кендалл Б. (13 июня 2013 г.). "Судьи отменяют патенты на гены". Журнал "Уолл Стрит. Получено 15 июн 2013.
  13. ^ Барнс Р., Брэди Д. (13 июня 2013 г.). «Верховный суд постановил, что гены человека не могут быть запатентованы». Вашингтон Пост. Получено 15 июн 2013.
  14. ^ а б Гиббс Дж. Н. (1 августа 2008 г.). «Регуляторные пути для молекулярной диагностики. Подробное описание различных доступных вариантов и того, что требуется для каждого». 24 (14). Новости генной инженерии и биотехнологии. Получено 4 сентября 2013. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  15. ^ Гиббс Дж. Н. (1 апреля 2011 г.). «Неопределенность сохраняется в отношении продуктов RUO. FDA, возможно, рассматривает более ограничительный подход с использованием только анализов для исследований». 31 (7). Новости генной инженерии и биотехнологии. Получено 4 сентября 2013. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  16. ^ Томиелло К. (21 февраля 2007 г.). "Соблюдение нормативных требований способствует развитию LIMS". Мир дизайна. Получено 7 ноября 2012.
  17. ^ Mackinnon AC, Wang YL, Sahota A, Yeung CC, Weck KE (ноябрь 2012 г.). «Сертификация в области молекулярной патологии в США: обновленная информация Комитета по обучению и образованию Ассоциации молекулярной патологии». Журнал молекулярной диагностики. 14 (6): 541–9. Дои:10.1016 / j.jmoldx.2012.05.004. PMID  22925695.
  18. ^ Rao, Juluri R .; Флеминг, Колин Крейг; Мур, Джон Э. (7 июля 2006 г.). Молекулярная диагностика: современные технологии и приложения (Horizon Bioscience). п. 97. ISBN  978-1-904933-19-9.
  19. ^ ван Оммен Г.Дж., Бройнинг М.Х., Раап А.К. (июнь 1995 г.). «FISH в исследовании генома и молекулярной диагностике». Текущее мнение в области генетики и развития. 5 (3): 304–8. Дои:10.1016 / 0959-437X (95) 80043-3. PMID  7549423.
  20. ^ Хаммерлинг Дж. А. (2012). «Обзор медицинских ошибок в лабораторной диагностике и где мы находимся сегодня». Лабораторная медицина. 43 (2): 41–44. Дои:10.1309 / LM6ER9WJR1IHQAUY.
  21. ^ а б c d е ж Ходаков Д., Ван Ц., Чжан Д. Ю. (октябрь 2016 г.). «Диагностика, основанная на профилировании вариантов последовательностей нуклеиновых кислот: подходы ПЦР, гибридизация и NGS». Расширенные обзоры доставки лекарств. 105 (Pt A): 3–19. Дои:10.1016 / j.addr.2016.04.005. PMID  27089811.
  22. ^ doi.org/10.1371/journal.pone.0100566
  23. ^ Вальтер Г., Бюссов К., Люкинг А., Глёклер Дж. (Июнь 2002 г.). «Высокопроизводительные белковые матрицы: перспективы молекулярной диагностики». Тенденции в молекулярной медицине. 8 (6): 250–3. Дои:10.1016 / S1471-4914 (02) 02352-3. PMID  12067604.
  24. ^ Шервуд Дж. Л., Браун Х, Реттино А., Шрайек А., Кларк Дж., Клас Б., Агравал Б., Честон Р., Конг Б. С., Чоппа П., Нигрен А. О., Дерас И. Л., Кольманн А. (1 сентября 2017 г.). «Ключевые различия между 13 технологиями обнаружения мутаций KRAS и их актуальность для клинической практики». ESMO Open. 2 (4): e000235. Дои:10.1136 / esmoopen-2017-000235. ЧВК  5623342. PMID  29018576.
  25. ^ "Конференция" Достижения пренатальной молекулярной диагностики (Введение) ". HealthTech. 2013. Получено 28 сентября 2013.
  26. ^ а б c d «Молекулярная диагностика - Национальный институт рака». Cancer.gov. 28 января 2005 г.. Получено 26 сентября 2013.
  27. ^ Деста З., Чжао Х, Шин Дж. Г., Флокхарт Д.А. (2002). «Клиническое значение генетического полиморфизма цитохрома P450 2C19». Клиническая фармакокинетика.. 41 (12): 913–58. Дои:10.2165/00003088-200241120-00002. PMID  12222994.
  28. ^ Эггерманн Т., Шпенглер С., Гогель М., Бегеманн М., Эльбрахт М. (июнь 2012 г.). «Эпигенетическая и генетическая диагностика синдрома Сильвера-Рассела». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 12 (5): 459–71. Дои:10.1586 / erm.12.43. PMID  22702363.
  29. ^ Тонг CY, Маллинсон H (май 2002 г.). «Переход к обнаружению генитального Chlamydia trachomatis на основе нуклеиновых кислот». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 2 (3): 257–66. Дои:10.1586/14737159.2.3.257. PMID  12050864.
  30. ^ Дейде В.М., Сампатх Р., Губарева Л.В. (январь 2011 г.). «Метод RT-PCR / масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением в обнаружении и характеристике вирусов гриппа». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 11 (1): 41–52. Дои:10.1586 / erm.10.107. PMID  21171920.
  31. ^ Пай М., Калантри С., Дхеда К. (май 2006 г.). «Новые инструменты и новейшие технологии для диагностики туберкулеза: часть I. Скрытый туберкулез» (PDF). Экспертный обзор молекулярной диагностики. 6 (3): 413–22. Дои:10.1586/14737159.6.3.413. PMID  16706743.
  32. ^ Burkardt HJ (январь 2011 г.). «Пандемия H1N1 2009 (« свиной грипп »): диагностика и другие проблемы». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 11 (1): 35–40. Дои:10.1586 / erm.10.102. PMID  21171919.
  33. ^ Хан ЕТ (март 2013 г.). «Петлевой изотермический тест амплификации для молекулярной диагностики малярии». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 13 (2): 205–18. Дои:10.1586 / erm.12.144. PMID  23477559.
  34. ^ а б Тан Ю.В., Прокоп Г.В., Персинг Д.Х. (ноябрь 1997 г.). «Молекулярная диагностика инфекционных болезней». Клиническая химия. 43 (11): 2021–38. Дои:10.1093 / Clinchem / 43.11.2021. PMID  9365385.
  35. ^ ван Лиер М.Г., Вагнер А., ван Леердам М.Э., Бирманн К., Койперс Е.Дж., Штайерберг Е.В., Дуббинк Г.Дж., Диндженс В.Н. (январь 2010 г.). «Обзор молекулярной диагностики синдрома Линча: центральная роль лаборатории патологии». Журнал клеточной и молекулярной медицины. 14 (1–2): 181–97. Дои:10.1111 / j.1582-4934.2009.00977.x. ЧВК  3837620. PMID  19929944.
  36. ^ Shrimpton AE (май 2002 г.). «Молекулярная диагностика муковисцидоза». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 2 (3): 240–56. Дои:10.1586/14737159.2.3.240. PMID  12050863.
  37. ^ Андорно Р. (октябрь 2004 г.). «Право не знать: подход, основанный на автономии». Журнал медицинской этики. 30 (5): 435–9, обсуждение 439–40. Дои:10.1136 / jme.2002.001578. ЧВК  1733927. PMID  15467071.
  38. ^ Хармон, Эми (2008-02-24) Страхи при страховании приводят к тому, что многие избегают тестов ДНК. Нью-Йорк Таймс
  39. ^ Минамото Т., Уголков А.В., Май М. (ноябрь 2002 г.). «Обнаружение онкогенов в диагностике рака с активной онкогенной сигнализацией». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 2 (6): 565–75. Дои:10.1586/14737159.2.6.565. PMID  12465453.
  40. ^ Бреннан Д.Д., О'Коннор Д.П., Рекшепадж Э., Понтен Ф., Галлахер В.М. (сентябрь 2010 г.). «Протеомика на основе антител: быстрая молекулярная диагностика в онкологии». Обзоры природы. Рак. 10 (9): 605–17. Дои:10.1038 / nrc2902. PMID  20720569.
  41. ^ Феррачин М., Веронезе А., Негрини М. (апрель 2010 г.). «Микромаркеры: миРНК в диагностике и прогнозе рака». Экспертный обзор молекулярной диагностики. 10 (3): 297–308. Дои:10.1586 / erm.10.11. PMID  20370587.
  42. ^ Misale S, Yaeger R, Hobor S, Scala E, Janakiraman M, Liska D, Valtorta E, Schiavo R, Buscarino M, Siravegna G, Bencardino K, Cercek A, Chen CT, Veronese S, Zanon C, Sartore-Bianchi A, Gambacorta M, Gallicchio M, Vakiani E, Boscaro V, Medico E, Weiser M, Siena S, Di Nicolantonio F, Solit D, Bardelli A (июнь 2012 г.). «Возникновение мутаций KRAS и приобретенная устойчивость к терапии против EGFR при колоректальном раке». Природа. 486 (7404): 532–6. Bibcode:2012Натура 486..532M. Дои:10.1038 / природа11156. ЧВК  3927413. PMID  22722830.
  43. ^ Emmadi R, Boonyaratanakornkit JB, Selvarangan R, Shyamala V, Zimmer BL, Williams L, Bryant B, Schutzbank T, Schoonmaker MM, Amos Wilson JA, Hall L, Pancholi P, Bernard K (ноябрь 2011 г.). «Молекулярные методы и платформы для тестирования на инфекционные заболевания - обзор одобренных и одобренных FDA анализов». Журнал молекулярной диагностики. 13 (6): 583–604. Дои:10.1016 / j.jmoldx.2011.05.011. ЧВК  3194051. PMID  21871973.
  44. ^ Одобренная FDA система секвенирования следующего поколения может расширить клиническое геномное тестирование: эксперты прогнозируют, что платформа MiSeqDx сделает генетическое тестирование более доступным для небольших лабораторий. ЯВЛЯЮСЬ. J. Med. Genet. А 164, X-XI.
  45. ^ Ангуло Б, Конде Э, Суарес-Готье А, Плаза С, Мартинес Р., Редондо П., Искьердо Э, Рубио-Викейра Б., Пас-Арес Л., Идальго М., Лопес-Риос Ф (27 августа 2012 г.). «Сравнение методов тестирования мутации EGFR при карциноме легких: прямое секвенирование, ПЦР в реальном времени и иммуногистохимия». PLOS One. 7 (8): e43842. Bibcode:2012PLoSO ... 743842A. Дои:10.1371 / journal.pone.0043842. ЧВК  3428292. PMID  22952784.
  46. ^ Гонсалес де Кастро Д., Ангуло Б., Гомес Б., Маир Д., Мартинес Р., Суарес-Готье А., Шие Ф., Велес М., Брофи В. Х., Лоуренс Г. Дж., Лопес-Риос Ф (июль 2012 г.). «Сравнение трех методов обнаружения мутаций KRAS в образцах фиксированного формалином колоректального рака». Британский журнал рака. 107 (2): 345–51. Дои:10.1038 / bjc.2012.259. ЧВК  3394984. PMID  22713664.
  47. ^ Маршан Дж., Манж А., Ларрие М., Костес В., Солассол Дж. (Июль 2014 г.). «Сравнительная оценка нового одобренного FDA теста THxID ™ -BRAF с плавлением в высоком разрешении и секвенированием по Сэнгеру». BMC Рак. 14: 519. Дои:10.1186/1471-2407-14-519. ЧВК  4223712. PMID  25037456.
  48. ^ Салазар Р., Роепман П., Капелла Дж., Морено V, Саймон I, Дризен С., Лопес-Дорига А., Сантос С., Марийнен К., Вестерга Дж., Брюин С., Керр Д., Куппен П., ван де Велде С., Морро Х., Ван Velthuysen L, Glas AM, Van't Veer LJ, Tollenaar R (январь 2011 г.). «Сигнатура экспрессии генов для улучшения прогноза колоректального рака II и III стадии». Журнал клинической онкологии. 29 (1): 17–24. Дои:10.1200 / JCO.2010.30.1077. PMID  21098318.
  49. ^ Виттнер Б.С., Сгрой округ Колумбия, Райан П.Д., Брюинсма Т.Дж., Глас А.М., Мужчина А, Дахия С., Хабин К., Бернардс Р., Хабер Д.А., Вант Вир Л.Дж., Рамасвами С. (май 2008 г.). «Анализ теста на рак груди MammaPrint в преимущественно постменопаузальной когорте». Клинические исследования рака. 14 (10): 2988–93. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-07-4723. ЧВК  3089800. PMID  18483364.
  50. ^ Ли СС, Макмиллин Г.А., Бабич Н., Мелис Р., Йео К.Т. (май 2011 г.). «Оценка панели генотипа CYP2C19 на платформе GenMark eSensor® и сравнение с панелями Autogenomics Infiniti ™ и Luminex CYP2C19». Clinica Chimica Acta; Международный журнал клинической химии. 412 (11–12): 1133–7. Дои:10.1016 / j.cca.2011.03.001. PMID  21385571.
  51. ^ Pfundt R, Kwiatkowski K, Roter A, Shukla A, Thorland E, Hockett R, DuPont B, Fung ET, Chaubey A (февраль 2016 г.). «Клинические характеристики CytoScan Dx Assay в диагностике задержки развития / умственной отсталости». Генетика в медицине. 18 (2): 168–73. Дои:10.1038 / гим.2015.51. PMID  25880438.
  52. ^ Ходаков Дмитрий; Ван, Чуньян; Ю Чжан, Давид (1 апреля 2016 г.). «Диагностика, основанная на профилировании вариантов последовательностей нуклеиновых кислот: подходы ПЦР, гибридизация и NGS». Расширенные обзоры доставки лекарств. 105 (Pt A): 3–19. Дои:10.1016 / j.addr.2016.04.005. PMID  27089811.
  53. ^ Ховелсон Д.Х., МакДэниел А.С., Кани А.К., Джонсон Б., Родс К., Уильямс П.Д. и др. (Апрель 2015 г.). «Разработка и проверка масштабируемой системы секвенирования нового поколения для оценки соответствующих соматических вариантов в солидных опухолях». Неоплазия. 17 (4): 385–99. Дои:10.1016 / j.neo.2015.03.004. ЧВК  4415141. PMID  25925381.
  54. ^ Imperiale TF, Ransohoff DF, Itzkowitz SH (июль 2014 г.). «Многоцелевой анализ ДНК стула для скрининга колоректального рака». Медицинский журнал Новой Англии. 371 (2): 187–8. Дои:10.1056 / NEJMc1405215. PMID  25006736.
  55. ^ Ракович Э., Нофек-Мозес С., Ханна В., Баенер Флорида, Саскин Р., Батлер С. М., Так А., Сенгупта С., Элаватил Л., Яни П. А., Бонин М., Чанг М. С., Робертсон С. Дж., Слодковска Е., Фонг С., Андерсон Дж. М., Джамшидиан Ф., Миллер Д.П., Чербаваз ДБ, Шак С., Пазат Л. (июль 2015 г.). «Популяционное исследование оценки DCIS Score, прогнозирующее риск рецидива у лиц, получавших только операцию по сохранению груди». Исследования и лечение рака груди. 152 (2): 389–98. Дои:10.1007 / s10549-015-3464-6. ЧВК  4491104. PMID  26119102.