ПТПРБ - PTPRB

ПТПРБ
Белок PTPRB PDB 2ahs.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыПТПРБ, HPTP-BETA, HPTPB, PTPB, R-PTP-BETA, VEPTP, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа B, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа B
Внешние идентификаторыOMIM: 176882 MGI: 97809 ГомолоГен: 2125 Генные карты: ПТПРБ
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение PTPRB
Геномное расположение PTPRB
Группа12q15Начните70,515,866 бп[1]
Конец70,637,440 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PTPRB 205846 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001109754
NM_001206971
NM_001206972
NM_002837
NM_001330204

NM_029928

RefSeq (белок)

NP_001103224
NP_001193900
NP_001193901
NP_001317133
NP_002828

NP_084204

Расположение (UCSC)Chr 12: 70,52 - 70,64 МбChr 10: 116.28 - 116.39 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Бета-тирозин-протеинфосфатаза рецепторного типа или VE-PTP является фермент конкретно выражено в эндотелиальные клетки что у людей кодируется ПТПРБ ген.[5][6]

Функция

VE-PTP является членом классической протеинтирозинфосфатаза (PTP) семья. Было показано, что делеция гена на моделях мышей приводит к эмбриональной летальности,[7] таким образом указывая, что это важно для васкулогенез и развитие кровеносных сосудов. Кроме того, было показано участие в прилипает к стыкам сложный и регулируемый сосудистая проницаемость.[8][9] Недавно Soni et al. показали, что фосфорилирование тирозина VE-PTP через Pyk2 киназа после STIM1 -индуцированное проникновение кальция опосредует разборку эндотелия прилипает к стыкам.[9]

Взаимодействия

VE-PTP содержит внеклеточный домен, состоящий из нескольких повторов фибронектина типа_III, одного трансмембранного сегмента и одного внутрицитоплазматического каталитического домена, таким образом, он принадлежит к PTP подтипа рецептора R3. Было показано, что внеклеточная область взаимодействует с ангиопоэтин рецептор Галстук-2[6] и с белком адгезии VE-кадгерин.[9][10]

Также было обнаружено, что VE-PTP взаимодействует с Grb2 и плакоглобин через свой цитоплазматический домен.

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127329 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020154 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRB, рецепторный тип, B».
  6. ^ а б Fachinger G, Deutsch U, Risau W (октябрь 1999 г.). «Функциональное взаимодействие эндотелиальной протеинтирозинфосфатазы сосудов с рецептором ангиопоэтина Tie-2». Онкоген. 18 (43): 5948–5953. Дои:10.1038 / sj.onc.1202992. PMID  10557082.
  7. ^ Bäumer S, Keller L, Holtmann A, Funke R, August B, Gamp A, Wolburg H, Wolburg-Buchholz K, Deutsch U, Vestweber D (июнь 2006 г.). «Для развития кровеносных сосудов необходима активность фосфотирозинфосфатазы (VE-PTP), специфичной для клеток эндотелия сосудов». Кровь. 107 (12): 4754–62. Дои:10.1182 / кровь-2006-01-0141. PMID  16514057.
  8. ^ Broermann A, Winderlich M, Block H, Frye M, Rossaint J, Zarbock A, Cagna G, Linnepe R, Schulte D, Nottebaum AF, Vestweber D (ноябрь 2011 г.). «Диссоциация VE-PTP от VE-кадгерина необходима для экстравазации лейкоцитов и для VEGF-индуцированной проницаемости сосудов in vivo». Журнал экспериментальной медицины. 208 (12): 2393–401. Дои:10.1084 / jem.20110525. ЧВК  3256962. PMID  22025303.
  9. ^ а б c Soni D, Regmi SC, Wang DM, DebRoy A, Zhao YY, Vogel SM, Malik AB, Tiruppathi C (апрель 2017 г.). «Pyk2-фосфорилирование VE-PTP ниже STIM1-индуцированного входа Ca2 + регулирует разборку слипчивых соединений». Американский журнал физиологии. Клеточная и молекулярная физиология легких. 312 (6): L1003 – L1017. Дои:10.1152 / ajplung.00008.2017. ЧВК  5495943. PMID  28385807.
  10. ^ Nawroth R, Poell G, Ranft A, Kloep S, Samulowitz U, Fachinger G, Golding M, Shima DT, Deutsch U, Vestweber D (сентябрь 2002 г.). «Эктодомены VE-PTP и VE-кадгерина взаимодействуют для облегчения регуляции фосфорилирования и межклеточных контактов». Журнал EMBO. 21 (18): 4885–4895. Дои:10.1093 / emboj / cdf497. ЧВК  126293. PMID  12234928.

дальнейшее чтение