ПТПРН - PTPRN

ПТПРН
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2I1Y, 2QT7, 3N01, 3N4W, 3NG8, 3НП5
Идентификаторы
Псевдонимы	ПТПРН, IA-2, IA-2 / PTP, IA2, ICA512, R-PTP-N, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа N, протеинтирозинфосфатазный рецептор типа N
Внешние идентификаторы	OMIM: 601773 MGI: 102765 ГомолоГен: 48142 Генные карты: ПТПРН
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 2 (человек)
Конец	219,309,648 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 1 (мышь)
Конец	75,264,502 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание спектрина; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность протеинтирозинфосфатазы; • связывание фактора транскрипции; • связывание убиквитин-подобной протеинлигазы; • Связывание GTPase; • фосфатазная активность; • гидролазная активность;
Сотовый компонент	• конец аксона; • неотъемлемый компонент мембраны; • перикарион; • эндосома; • аппарат Гольджи; • проекция клетки; • мембрана; • синаптический пузырек; • клеточная мембрана; • мембрана транспортных везикул; • синапс; • секреторная гранула; • аксон; • соединение клеток; • тело нейрональной клетки; • цитоплазматический пузырек; • ядро клетки;
Биологический процесс	• лютеинизация; • цитокин-опосредованный сигнальный путь; • реакция на активные формы кислорода; • секреция инсулина; • ответ на глюкозу; • ответ на эстроген; • ответ на инсулин; • ответ на цАМФ; • созревание плотной сердцевины гранул; • секреция инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы; • транскрипция, ДНК-шаблон; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительное регулирование пролиферации клеток поджелудочной железы типа B; • дефосфорилирование пептидилтирозина; • дефосфорилирование белков; • дефосфорилирование;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5798
	19275
	ENSG00000054356
	ENSMUSG00000026204
	Q16849
	Q60673
	NM_001199763; NM_001199764; NM_002846
	NM_008985; NM_001359281
	NP_001186692; NP_001186693; NP_002837
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатазоподобный N рецепторного типа является фермент что у людей кодируется ПТПРН ген.^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом протеинтирозинфосфатаза (PTP) семья и ПТПРН подсемейство. PTP известны как сигнальные молекулы это регулировать различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференциация, митотический цикл, и онкогенный трансформация. Этот PTP обладает внеклеточный регион, единый трансмембранная область, и один каталитический домен, и, таким образом, представляет собой рецептор -типа PTP. Этот PTP оказался аутоантиген что реагирует с инсулинозависимый сахарный диабет (IDDM) пациент сыворотка, и поэтому может быть потенциальной целью аутоиммунитет при сахарном диабете.^[6]

Взаимодействия

ПТПРН был показан взаимодействовать с участием СПТБН4.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000054356 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026204 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Лан М.С., Лу Дж., Гото Й., Ноткинс А.Л. (август 1994 г.). «Молекулярное клонирование и идентификация протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа, IA-2, из инсулиномы человека». ДНК клетки биол. 13 (5): 505–14. Дои:10.1089 / dna.1994.13.505. PMID 8024693.
^ ^а ^б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRN, рецепторный тип, N».
^ Бергс С., Аггужаро Д., Дирккс Р., Максимова Э., Стабах П., Хермел Дж. М., Чжан Дж. П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (ноябрь 2000 г.). «βiv Spectrin, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе». J. Cell Biol. 151 (5): 985–1002. Дои:10.1083 / jcb.151.5.985. ЧВК 2174349. PMID 11086001.

дальнейшее чтение

Рабин Д.Ю., Плеасик С.М., Шапиро Дж.А., Ю-Уоррен Х., Олес Дж., Хикс Дж. М., Голдштейн Д.Э., Рэй П.М. (1994). «Антиген 512 островковых клеток представляет собой специфический для диабета островковый аутоантиген, связанный с протеинтирозинфосфатазами». J. Immunol. 152 (6): 3183–8. PMID 8144912.
Солимена М., Диркс Р., Хермел Дж. М., Плезик-Уильямс С., Шапиро Дж. А., Карон Л., Рабин Д. У. (1996). «ICA 512, аутоантиген диабета типа I, является внутренним мембранным белком нейросекреторных гранул». EMBO J. 15 (9): 2102–14. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00564.x. ЧВК 450132. PMID 8641276.
ван ден Маагденберг AM, Olde Weghuis D, Rijss J, van de Wetering RA, Wieringa B, Geurts van Kessel A, Hendriks WJ (1996). «Отнесение человеческого гена для рецепторного протеина тирозинфосфатазы IA-2 (PTPRN) к области хромосомы 2q35 -> q36.1 и идентификация внутригенного генетического маркера». Cytogenet. Cell Genet. 73 (1–2): 145–8. Дои:10.1159/000134327. PMID 8646884.
Цуй Л., Ю. В. П., ДеАизпуруа Х. Дж., Шмидли Р. С., Паллен С. Джей (1996). «Клонирование и характеристика антиген-связанной протеин-тирозинфосфатазы (PTP) островковых клеток, нового рецептор-подобного PTP и аутоантигена при инсулинозависимом диабете». J. Biol. Chem. 271 (40): 24817–23. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24817. PMID 8798755.
Се Дж, Чжан Б., Лан М.С., Ноткинс А.Л. (1999). «Геномная структура и промоторная последовательность аутоантигена инсулинозависимого сахарного диабета, IA-2 (PTPRN)». Геномика. 54 (2): 338–43. Дои:10.1006 / geno.1998.5583. PMID 9828138.
Орт Т., Максимова Э., Диркс Р., Качинский А.М., Бергс С., Фроенер С.К., Солимена М. (2001). «Рецепторный тирозинфосфатазоподобный белок ICA512 связывает PDZ-домены бета2-синтрофина и nNOS в бета-клетках поджелудочной железы». Евро. J. Cell Biol. 79 (9): 621–30. Дои:10.1078/0171-9335-00095. PMID 11043403.
Парк Ю.С., Кавасаки Э., Келемен К., Ю. Л., Шиллер М. Р., Реверс М., Мизута М., Эйзенбарт Г. С., Хаттон Дж. С. (2001). «Гуморальная аутореактивность к альтернативно сплайсированному варианту ICA512 / IA-2 при диабете I типа». Диабетология. 43 (10): 1293–301. Дои:10.1007 / s001250051525. PMID 11079748.
Бергс С., Аггужаро Д., Дирккс Р., Максимова Э., Стабах П., Хермел Дж. М., Чжан Дж. П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (2001). «βiv Spectrin, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе». J. Cell Biol. 151 (5): 985–1002. Дои:10.1083 / jcb.151.5.985. ЧВК 2174349. PMID 11086001.
Диц Дж., Парк Й., Зеллер М., Браун Д., Гарза Д., Рикорди С., Хаттон Дж., Эйзенбарт Г. С., Пульезе А. (2001). «Дифференциальный сплайсинг мРНК IA-2 в поджелудочной железе и лимфоидных органах как разрешающий генетический механизм аутоиммунитета против аутоантигена диабета IA-2 типа 1». Сахарный диабет. 50 (4): 895–900. Дои:10.2337 / диабет.50.4.895. PMID 11289059.
Орт Т., Воронов С., Го Дж., Завалич К., Фроенер С.К., Завалич В., Солимена М. (2001). «Дефосфорилирование β2-синтрофина и Ca2 + / µ-кальпаин-опосредованное расщепление ICA512 при стимуляции секреции инсулина». EMBO J. 20 (15): 4013–23. Дои:10.1093 / emboj / 20.15.4013. ЧВК 149140. PMID 11483505.
Микулецкий М., Михалкова Д. (2002). «Светские и сезонные циклы аутоантител IA2-ab у словацких детей с диабетом». Биомед. Фармаколог. 55 Дополнение 1: 106с – 109с. Дои:10.1016 / s0753-3322 (01) 90014-9. PMID 11774856.
Мяо Д., Ю. Л., Тиберти С., Катбертсон Д. Д., Реверс М., Ди Марио Ю., Эйзенбарт Г. С., Дотта Ф (2002). «Тесты на специфичность эпитопа ICA512 (IA-2) позволяют отличить преходящие аутоантитела от связанных с диабетом». J. Аутоиммунный. 18 (2): 191–6. Дои:10.1006 / jaut.2001.0577. PMID 11908951.
Кавасаки Э., Ямагути Х., Хаттори Х., Эгашира Т., Эгучи К. (2002). «Аутоантитела к IA-2 при диабете 1 типа: измерения с помощью нового иммуноферментного анализа». Анна. Акад. Наука. 958: 241–6. Дои:10.1111 / j.1749-6632.2002.tb02978.x. PMID 12021115. S2CID 45659598.
Сандживи CB, Дас А.К., Штаувере-Брамеус A (2002). «Вакцинация БЦЖ и аутоантитела к GAD65 и IA-2 при аутоиммунном диабете в южной Индии». Анна. Акад. Наука. 958: 293–6. Дои:10.1111 / j.1749-6632.2002.tb02990.x. PMID 12021127. S2CID 44799912.
Bearzatto M, Lampasona V, Belloni C, Bonifacio E (2004). «Точное картирование аутоантител, связанных с диабетом IA-2». J. Аутоиммунный. 21 (4): 377–82. Дои:10.1016 / j.jaut.2003.08.002. PMID 14624760.
Трайковски М., Мзиаут Х, Альткрюгер А., Оувендийк Дж., Кнох К.П., Мюллер С., Солимена М. (2005). «Ядерная транслокация цитозольного фрагмента ICA512 сочетает экзоцитоз гранул и экспрессию инсулина в β-клетках». J. Cell Biol. 167 (6): 1063–74. Дои:10.1083 / jcb.200408172. ЧВК 2172607. PMID 15596545.
Ота Т., Такамура Т., Нагай Ю., Бандо Ю., Усуда Р. (2005). «Значение антитела IA-2 при диабете типа 1 в Японии: его связь с антителом к GAD». Diabetes Res. Clin. Практика. 67 (1): 63–9. Дои:10.1016 / j.diabres.2004.05.004. PMID 15620435.

Эта статья о ген на хромосома 2 человека это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000054356 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026204 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8024693-5] Лан М.С., Лу Дж., Гото Й., Ноткинс А.Л. (август 1994 г.). «Молекулярное клонирование и идентификация протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа, IA-2, из инсулиномы человека». ДНК клетки биол. 13 (5): 505–14. Дои:10.1089 / dna.1994.13.505. PMID 8024693.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRN, рецепторный тип, N».

[pmid11086001-7] Бергс С., Аггужаро Д., Дирккс Р., Максимова Э., Стабах П., Хермел Дж. М., Чжан Дж. П., Филбрик В., Слепнев В., Орт Т., Солимена М. (ноябрь 2000 г.). «βiv Spectrin, новый спектрин, локализованный в начальных сегментах аксонов и узлах Ранвье в центральной и периферической нервной системе». J. Cell Biol. 151 (5): 985–1002. Дои:10.1083 / jcb.151.5.985. ЧВК 2174349. PMID 11086001.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]