TGFB1I1 - TGFB1I1

TGFB1I1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTGFB1I1, ARA55, HIC-5, HIC5, TSC-5, транскрипт 1, индуцированный трансформирующим фактором роста бета 1
Внешние идентификаторыOMIM: 602353 MGI: 102784 ГомолоГен: 7572 Генные карты: TGFB1I1
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение TGFB1I1
Геномное расположение TGFB1I1
Группа16p11.2Начинать31,471,585 бп[1]
Конец31,477,960 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TGFB1I1 209651 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015927
NM_001042454
NM_001164719

NM_001289550
NM_001289551
NM_001289552
NM_001289553
NM_009365

RefSeq (белок)

NP_001035919
NP_001158191
NP_057011
NP_001158191.1
NP_057011.2

NP_001276479
NP_001276480
NP_001276481
NP_001276482

Расположение (UCSC)Chr 16: 31.47 - 31.48 МбChr 7: 128,25 - 128,26 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Трансформирующий белок транскрипта 1, индуцированный бета-1 фактором роста это белок что у людей кодируется TGFB1I1 ген.[5][6]

Взаимодействия

TGFB1I1 был показан взаимодействовать с:

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции TGFB1I1. Условный нокаутирующая мышь линия называется Tgfb1i1tm1b (КОМП) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[14] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[15] для определения последствий удаления.[16][17][18][19] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[20]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000140682 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030782 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c Мацуя М., Сасаки Х., Аото Х., Митака Т., Нагура К., Охба Т., Ишино М., Такахаши С., Сузуки Р., Сасаки Т. (январь 1998 г.). "Киназа клеточной адгезии бета образует комплекс с новым членом Hic-5 белков, локализованных в очаговых адгезиях". Журнал биологической химии. 273 (2): 1003–14. Дои:10.1074 / jbc.273.2.1003. PMID  9422762.
  6. ^ Fujimoto N, Yeh S, Kang HY, Inui S, Chang HC, Mizokami A, Chang C (март 1999 г.). «Клонирование и характеристика коактиватора рецептора андрогена, ARA55, в простате человека». Журнал биологической химии. 274 (12): 8316–21. Дои:10.1074 / jbc.274.12.8316. PMID  10075738.
  7. ^ а б Ван X, Ян Y, Гуо X, Sampson ER, Hsu CL, Tsai MY, Yeh S, Wu G, Guo Y, Chang C (май 2002 г.). «Подавление трансактивации рецептора андрогена с помощью Pyk2 посредством взаимодействия и фосфорилирования корегулятора ARA55». Журнал биологической химии. 277 (18): 15426–31. Дои:10.1074 / jbc.M111218200. PMID  11856738.
  8. ^ He B, Minges JT, Lee LW, Wilson EM (март 2002 г.). «Мотив FXXLF опосредует специфические взаимодействия рецепторов андрогенов с корегуляторами». Журнал биологической химии. 277 (12): 10226–35. Дои:10.1074 / jbc.M111975200. PMID  11779876.
  9. ^ Карнейро А.М., Инграм С.Л., Больё Дж.М., Суини А., Амара С.Г., Томас С.М., Карон М.Г., Торрес Дж.Э. (август 2002 г.). «Адаптерный белок Hic-5, содержащий множественные LIM-домены, синаптически колокализуется и взаимодействует с транспортером дофамина». Журнал неврологии. 22 (16): 7045–54. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-16-07045.2002. ЧВК  6757888. PMID  12177201.
  10. ^ Цзя Ю., Рэнсом Р.Ф., Шибанума М., Лю С., Валлийский М.Дж., Смойер В.Е. (октябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика hic-5 / ARA55 как белка, связывающего hsp27». Журнал биологической химии. 276 (43): 39911–8. Дои:10.1074 / jbc.M103510200. PMID  11546764.
  11. ^ а б Томас С.М., Хагель М., Тернер С.Е. (январь 1999 г.). «Характеристика белка фокальной адгезии Hic-5, который имеет большую гомологию с паксиллином». Журнал клеточной науки. 112 (2): 181–90. PMID  9858471.
  12. ^ Нишия Н., Татибана К., Шибанума М., Машимо Джи, Нос К. (август 2001 г.). «Hic-5 снижает распространение клеток на фибронектине: конкурентные эффекты между паксиллином и Hic-5 за счет взаимодействия с киназой фокальной адгезии». Молекулярная и клеточная биология. 21 (16): 5332–45. Дои:10.1128 / MCB.21.16.5332-5345.2001. ЧВК  87257. PMID  11463817.
  13. ^ Nishiya N, Iwabuchi Y, Shibanuma M, Côté JF, Tremblay ML, Nose K (апрель 1999 г.). «Hic-5, гомолог паксиллина, связывается с протеин-тирозинфосфатазой PEST (PTP-PEST) через свой домен LIM 3». Журнал биологической химии. 274 (14): 9847–53. Дои:10.1074 / jbc.274.14.9847. PMID  10092676.
  14. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  15. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  16. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  17. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  18. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  19. ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс, Северная Каролина, Таннахилл Д. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  20. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.