TRIM24 - TRIM24

TRIM24
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTRIM24, PTC6, RNF82, TF1A, TIF1, TIF1A, TIF1ALPHA, hTIF1, трехчастный мотив, содержащий 24
Внешние идентификаторыOMIM: 603406 MGI: 109275 ГомолоГен: 20830 Генные карты: TRIM24
Расположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек)[1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение TRIM24
Геномное расположение TRIM24
Группа7q33-q34Начните138,460,259 бп[1]
Конец138,589,996 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TRIM24 204391 x at fs.png

PBB GE TRIM24 213301 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003852
NM_015905

NM_001272064
NM_001272076
NM_145076

RefSeq (белок)

NP_003843
NP_056989

NP_001258993
NP_001259005
NP_659542

Расположение (UCSC)Chr 7: 138,46 - 138,59 МбChr 6: 37,87 - 37,97 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Трехчастный мотив, содержащий 24 (TRIM24) также известен как транскрипционный промежуточный фактор 1α (TIF1α) это белок что у людей кодируется TRIM24 ген.[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, обеспечивает контроль транскрипции путем взаимодействия с областью функции активации 2 (AF2) нескольких ядерных рецепторов, включая эстроген, ретиноевая кислота, и Витамин Д3 рецепторы. Белок локализуется в ядерных телах и, как полагают, связан с хроматином и факторами, связанными с гетерохроматином. Белок входит в состав трехсторонний мотив (TRIM) семья. Мотив TRIM включает три цинк-связывающих домена - RING, B-бокса типа 1 и B-бокса типа 2 - и спиральная катушка область, край. Два альтернативно сращенный Для этого гена были описаны варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.[5]

Взаимодействия

TRIM24 был показан взаимодействовать с участием Минералокортикоидный рецептор,[6][8] TRIM33,[9] Рецептор эстрогена альфа[6][10] и Ретиноидный рецептор X альфа.[6][11]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000122779 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029833 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б "Entrez Gene: TRIM24 трехчастный мотив, содержащий 24".
  6. ^ а б c d Тено С., Анрике С., Рошфор Н., Кавай В. (май 1997 г.). «Дифференциальное взаимодействие ядерных рецепторов с предполагаемым коактиватором транскрипции человека hTIF1». J. Biol. Chem. 272 (18): 12062–8. Дои:10.1074 / jbc.272.18.12062. PMID  9115274.
  7. ^ Le Douarin B, Nielsen AL, You J, Chambon P, Losson R (май 1997 г.). «TIF1 альфа: хроматин-специфический медиатор для лиганд-зависимой функции активации AF-2 ядерных рецепторов?». Biochem. Soc. Транс. 25 (2): 605–12. Дои:10.1042 / bst0250605. PMID  9191165.
  8. ^ Дзеннаро, М. С; Сук А; Viengchareun S; Пуассон E; Lombès M (сентябрь 2001 г.). «Новый вариант сплайсинга MR человека представляет собой лиганд-независимый трансактиватор, модулирующий действие кортикостероидов». Мол. Эндокринол. Соединенные Штаты. 15 (9): 1586–98. Дои:10.1210 / исправление.15.9.0689. ISSN  0888-8809. PMID  11518808.
  9. ^ Пэн, Хунчжуан; Фельдман Ирина; Раушер Франк Дж (июль 2002 г.). «Гетеро-олигомеризация среди семейства TIF ядерных кофакторов, содержащих домен RBCC / TRIM: потенциальный механизм для регулирования переключения между коактивацией и корепрессией». J. Mol. Биол. Англия. 320 (3): 629–44. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00477-1. ISSN  0022-2836. PMID  12096914.
  10. ^ Thénot, S; Капот S; Булахтуф А; Марджит Э; Ройер С. А.; Borgna J L; Cavaillès V (декабрь 1999 г.). «Влияние лиганда и связывания ДНК на взаимодействие между человеческим промежуточным фактором транскрипции 1альфа и рецепторами эстрогена». Мол. Эндокринол. Соединенные Штаты. 13 (12): 2137–50. Дои:10.1210 / мэ.13.12.2137. ISSN  0888-8809. PMID  10598587.
  11. ^ Ли, Вэнь-И; Ной Ноа (февраль 2002 г.). «Взаимодействия RXR с коактиваторами по-разному опосредуются спиралью 11 лиганд-связывающего домена рецептора». Биохимия. Соединенные Штаты. 41 (8): 2500–8. Дои:10.1021 / bi011764 +. ISSN  0006-2960. PMID  11851396.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.