MED1 - Википедия - MED1

MED1
PDB 1rjk EBI.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыMED1, CRSP1, CRSP200, DRIP205, DRIP230, PBP, PPARBP, PPARGBP, RB18A, TRAP220, TRIP2, субъединица медиаторного комплекса 1
Внешние идентификаторыOMIM: 604311 MGI: 1100846 ГомолоГен: 21002 Генные карты: MED1
Расположение гена (человек)
Chromosome 17 (human)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Chromosome 17 (human)
Genomic location for MED1
Genomic location for MED1
Группа17q12Начинать39,404,285 бп[1]
Конец39,451,272 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PPARBP 203496 s at fs.png

PBB GE PPARBP 203497 at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004774

NM_001080118
NM_013634
NM_134027
NM_001361950
NM_001361951

RefSeq (белок)

NP_004765

NP_001073587
NP_038662
NP_598788
NP_001348879
NP_001348880

Расположение (UCSC)Chr 17: 39.4 - 39.45 МбChr 11: 98.15 - 98.19 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 1 также известный как DRIP205 или же Ловушка220 является подразделением Медиаторный комплекс и является белок что у людей кодируется MED1 ген.[5][6][7] MED1 функционирует как ядерный рецептор коактиватор.

Med1
Идентификаторы
СимволMed1
PfamPF10744
ИнтерПроIPR019680

Функция

Активация транскрипции генов - это многоступенчатый процесс, который запускается факторами, распознающими сайты энхансеров транскрипции в ДНК. Эти факторы работают с коактиваторами, направляя инициацию транскрипции РНК-полимераза II аппарат. Медиатором белка субъединицы транскрипции 1 РНК-полимеразы II является субъединица CRSP (кофактор, необходимый для SP1 активация) комплекс, который вместе с TFIID, требуется для эффективной активации SP1. Этот белок также является компонентом других мультисубъединичных комплексов [например, рецептор гормона щитовидной железы - (TR-) ассоциированные белки, которые взаимодействуют с TR и облегчают функцию TR на матрице ДНК в сочетании с факторами инициации и кофакторами]. Он также регулирует p53 -зависимый апоптоз и это важно для адипогенез. Известно, что этот белок обладает способностью к самоолигомеризации.[7]

Взаимодействия

MED1 был показан взаимодействовать с:

Семейство белков

Эта запись представляет субъединицу Med1 комплекса Mediator. Med1 является частью субмодуля Med9 комплекса Srb / Med. Это одна из трех субъединиц, необходимых для жизнеспособность всего организм через его роль в экологически ориентированных решениях клеточной судьбы.[23]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125686 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018160 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Чжу Й., Ци С., Джайн С., Рао М.С., Редди Дж. К. (ноябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика PBP, белка, который взаимодействует с рецептором, активируемым пролифератором пероксисом». J Biol Chem. 272 (41): 25500–6. Дои:10.1074 / jbc.272.41.25500. PMID  9325263.
  6. ^ Чжу Ю., Ци С., Джайн С., Ле Бо М. М., Эспиноза Р., Аткинс Г. Б., Лазар М. А., Елданди А. В., Рао М. С., Редди Дж. К. (октябрь 1999 г.). «Амплификация и сверхэкспрессия гена рецептор-связывающего белка, активируемого пролифератором пероксисом (PBP / PPARBP), при раке груди». Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (19): 10848–53. Дои:10.1073 / пнас.96.19.10848. ЧВК  17971. PMID  10485914.
  7. ^ а б «Ген Entrez: PPARBP PPAR-связывающий белок».
  8. ^ Ван Кью, Шарма Д., Рен Й., Фонделл Д.Д. (ноябрь 2002 г.). «Корегуляторная роль комплекса TRAP-медиатор в экспрессии генов, опосредованной рецептором андрогена». J. Biol. Chem. 277 (45): 42852–8. Дои:10.1074 / jbc.M206061200. PMID  12218053.
  9. ^ Вада О, Оиси Х., Такада И., Янагисава Дж., Яно Т., Като С. (август 2004 г.). «Функция BRCA1 опосредует комплекс TRAP / DRIP посредством прямого взаимодействия с TRAP220». Онкоген. 23 (35): 6000–5. Дои:10.1038 / sj.onc.1207786. PMID  15208681.
  10. ^ а б Ито М., Юань С.Х., Малик С., Гу В., Фонделл Д.Д., Ямамура С., Фу З.Й., Чжан Икс, Цинь Дж., Редер Р.Г. (март 1999 г.). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути функционирования ядерных рецепторов и различных активаторов млекопитающих». Мол. Клетка. 3 (3): 361–70. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80463-3. PMID  10198638.
  11. ^ а б Китагава Х, Фудзики Р., Йошимура К., Мезаки И, Уэмацу Й, Мацуи Д., Огава С., Унно К., Окубо М, Токита А, Накагава Т, Ито Т, Ишими И, Нагасава Х, Мацумото Т, Янагисава Дж, Като С. (Июнь 2003 г.). «Комплекс WINAC, модифицирующий хроматин, нацеливается на ядерный рецептор на промоторы и нарушается при синдроме Вильямса». Клетка. 113 (7): 905–17. Дои:10.1016 / s0092-8674 (03) 00436-7. PMID  12837248.
  12. ^ а б Кан Ю.К., Гермах М., Юань С.Х., Рёдер Р.Г. (март 2002 г.). «Коактиваторный комплекс TRAP / медиатор напрямую взаимодействует с альфа- и бета-рецепторами эстрогена через субъединицу TRAP220 и напрямую усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2642–7. Дои:10.1073 / pnas.261715899. ЧВК  122401. PMID  11867769.
  13. ^ Zilliacus J, Holter E, Wakui H, Tazawa H, Treuter E, Gustafsson JA (апрель 2001 г.). «Регулирование активности глюкокортикоидных рецепторов посредством 14-3-3-зависимой внутриклеточной релокализации корепрессора RIP140». Мол. Эндокринол. 15 (4): 501–11. Дои:10.1210 / исправление.15.4.0624. PMID  11266503.
  14. ^ Хиттельман А.Б., Бураков Д., Иньигес-Ллухи Д.А., Фридман Л.П., Гарабедян М.Дж. (октябрь 1999 г.). «Дифференциальная регуляция транскрипционной активации глюкокортикоидных рецепторов с помощью белков, ассоциированных с AF-1». EMBO J. 18 (19): 5380–8. Дои:10.1093 / emboj / 18.19.5380. ЧВК  1171607. PMID  10508170.
  15. ^ Маэда Й., Рашез К., Хавел Л., Биус CV, Фридман LP, Sladek FM (июль 2002 г.). «Полиамины модулируют взаимодействие между ядерными рецепторами и белком 205, взаимодействующим с рецептором витамина D». Мол. Эндокринол. 16 (7): 1502–10. Дои:10.1210 / исправление.16.7.0883. PMID  12089346.
  16. ^ Малик С., Валлберг А.Е., Канг Ю.К., Родер Р.Г. (август 2002 г.). «TRAP / SMCC / медиатор-зависимая активация транскрипции из ДНК и хроматиновых матриц с помощью орфанного ядерного рецептора гепатоцитарного ядерного фактора 4». Мол. Клетка. Биол. 22 (15): 5626–37. Дои:10.1128 / mcb.22.15.5626-5637.2002. ЧВК  133960. PMID  12101254.
  17. ^ Frade R, Balbo M, Barel M (декабрь 2000 г.). «RB18A, ген которого локализован на хромосоме 17q12-q21.1, регулирует трансактивирующую активность p53 in vivo». Рак Res. 60 (23): 6585–9. PMID  11118038.
  18. ^ Дране П., Барел М., Бальбо М., Фраде Р. (декабрь 1997 г.). «Идентификация RB18A, нового регуляторного белка р53 массой 205 кДа, который имеет общие антигенные и функциональные свойства с р53». Онкоген. 15 (25): 3013–24. Дои:10.1038 / sj.onc.1201492. PMID  9444950.
  19. ^ Валлберг А.Е., Ямамура С., Малик С., Шпигельман Б.М., Рёдер Р.Г. (ноябрь 2003 г.). «Координация p300-опосредованного ремоделирования хроматина и функции TRAP / медиатора через коактиватор PGC-1alpha». Мол. Клетка. 12 (5): 1137–49. Дои:10.1016 / с1097-2765 (03) 00391-5. PMID  14636573.
  20. ^ Кодера Й., Такеяма К., Мураяма А., Судзава М., Масухиро Ю., Като С. (октябрь 2000 г.). «Тип-лиганд-специфические взаимодействия гамма-рецептора, активируемого пролифератором пероксисом, с коактиваторами транскрипции». J. Biol. Chem. 275 (43): 33201–4. Дои:10.1074 / jbc.C000517200. PMID  10944516.
  21. ^ Мисра П., Ци С., Ю С., Шах Ш., Цао В. К., Рао М. С., Тиммапая Б., Чжу Ю., Редди Дж. К. (май 2002 г.). «Взаимодействие PIMT с коактиваторами транскрипции CBP, p300 и дифференциальная роль PBP в регуляции транскрипции». J. Biol. Chem. 277 (22): 20011–9. Дои:10.1074 / jbc.M201739200. PMID  11912212.
  22. ^ Юань С.Х., Ито М., Фонделл Д.Д., Фу З.Й., Родер Р.Г. (июль 1998 г.). «Компонент TRAP220 коактиваторного комплекса белка, ассоциированного с рецептором тироидного гормона (TRAP), напрямую взаимодействует с ядерными рецепторами лиганд-зависимым образом». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (14): 7939–44. Дои:10.1073 / пнас.95.14.7939. ЧВК  20908. PMID  9653119.
  23. ^ Boube M, Joulia L, Cribbs DL, Bourbon HM (июль 2002 г.). «Доказательства медиатора регуляции транскрипции РНК-полимеразы II, сохраняемого от дрожжей к человеку». Клетка. 110 (2): 143–51. Дои:10.1016 / s0092-8674 (02) 00830-9. PMID  12150923. S2CID  771362.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR019680