Бромопероксидаза ванадия - Vanadium bromoperoxidase
Бромопероксидаза / хлоропероксидаза, ванадий | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | Br / Cl_пероксидаза |
CATH | 1qhb |
SCOP2 | 1qhb / Объем / СУПФАМ |
CDD | cd03398 |
Бромопероксидазы ванадия являются своего рода ферменты называется галопероксидазы. Его основная функция - удалить пероксид водорода (обычное чистящее средство) внутри или вокруг ячейки, которое образуется во время фотосинтез. Производя гипобромистая кислота (HOBr) вторичная реакция с растворенное органическое вещество, каковы результаты бромирование органических соединений, которые связаны с защитой организма. Эти ферменты производят большую часть естественного броморганические соединения в мире.
Ванадий бромпероксидазы являются одним из немногих классов ферментов, требующих ванадий. Активный центр имеет центр оксида ванадия, присоединенный к белку через одну боковую цепь гистидина и набор водородные связи к оксидным лигандам.[1]
Возникновение и функция
Бромопероксидазы ванадия были обнаружены у бактерий, грибов, морских макроводорослей (водоросли ) и морские микроводоросли (диатомеи ), которые производят бромированные органические соединения.[2] Это не было окончательно идентифицировано как бромопероксидаза высших эукариот, таких как мурекс улиток, у которых есть очень стабильная и специфическая бромпероксидаза, но, возможно, не зависимая от ванадия.[3] Хотя назначение бромпероксидазы все еще неизвестно, ведущие теории включают в себя то, что это способ регулирования перекиси водорода, вырабатываемой фотосинтезом, и / или в качестве механизма самозащиты путем производства гипобромовой кислоты, которая предотвращает рост бактерий.[4][5]
Ферменты катализируют окисление бромида (0,0067% морская вода ) к пероксид водорода. Образующийся электрофильный катион бромония (Br+) атакует углеводороды (обозначенные как R-H в следующем уравнении):
- R-H + Br− + H2О2 → R-Br + H2О + ОН−
Бромирование действует на различные растворенные органические вещества, и все большее бромирование приводит к образованию бромоформ.[6] Бромопероксидазы ванадия производят примерно 1-2 миллиона тонн бромоформ и 56 000 тонн бромметан ежегодно.[7] Частично в полярных регионах, где весной наблюдается интенсивное цветение микроводорослей, эти соединения могут попасть в тропосферу и нижнюю стратосферу.[8][9] Через фотолиз, бромированные метаны производят радикал брома (Br−), что может привести к истощению озонового слоя.[10] Большинство природных броморганические соединения возникают под действием этого фермента.
Рекомендации
- ^ Батлер А., Картер-Франклин Дж. Н. (февраль 2004 г.). «Роль ванадийбромопероксидазы в биосинтезе галогенированных морских природных продуктов». Отчеты о натуральных продуктах. 21 (1): 180–8. Дои:10.1039 / b302337k. PMID 15039842.
- ^ Мур Р.М., Уэбб М., Токарчик Р., Вевер Р. (15 сентября 1996 г.). «Ферменты бромопероксидазы и йодопероксидазы и производство галогенированных метанов в культурах морских диатомовых водорослей». Журнал геофизических исследований: океаны. 101 (C9): 20899–20908. Bibcode:1996JGR ... 10120899M. Дои:10.1029 / 96JC01248.
- ^ Винтер Дж. М., Мур Б.С. (июль 2009 г.). «Изучение химии и биологии ванадий-зависимых галопероксидаз». Журнал биологической химии. 284 (28): 18577–81. Дои:10.1074 / jbc.R109.001602. ЧВК 2707250. PMID 19363038.
- ^ Гриббл GW (17 декабря 2009 г.). Встречающиеся в природе галогенорганические соединения: всестороннее обновление. Springer-Verlag / Wein. Bibcode:2010nooc.book ..... G. ISBN 978-3-211-99322-4.
- ^ Ренири Р., Девильд А., Пьерло С., Вевер Р., Хобер Д., Обри Дж. М. (июль 2008 г.). «Бактерицидная и вирулицидная активность алкалофильного мутанта хлоропероксидазы ванадия P395D / L241V / T343A». Журнал прикладной микробиологии. 105 (1): 264–70. Дои:10.1111 / j.1365-2672.2008.03742.x. PMID 18266697.
- ^ Батлер А., Сэнди М. (август 2009 г.). «Механистические соображения галогенирующих ферментов». Природа. 460 (7257): 848–54. Bibcode:2009Натура.460..848Б. Дои:10.1038 / природа08303. PMID 19675645.
- ^ Гриббл GW (1999). «Разнообразие встречающихся в природе броморганических соединений». Обзоры химического общества. 28 (5): 335–46. Дои:10.1039 / a900201d.
- ^ Wever R, van der Horst MA (сентябрь 2013 г.). «Роль галопероксидаз ванадия в образовании летучих бромированных соединений и их влияние на окружающую среду» (PDF). Dalton Transactions. 42 (33): 11778–86. Дои:10.1039 / c3dt50525a. PMID 23657250.
- ^ Хилл В.Л., Мэнли С.Л. (май 2009 г.). «Высвобождение реактивного брома и йода из диатомовых водорослей и его возможная роль в переносе галогенов в полярных и тропических океанах». Лимнология и океанография. 54 (3): 812–822. Bibcode:2009LimOc..54..812H. Дои:10.4319 / lo.2009.54.3.0812.
- ^ Saiz-Lopez A, von Glasow R (октябрь 2012 г.). «Реактивная химия галогенов в тропосфере». Обзоры химического общества. 41 (19): 6448–72. Дои:10.1039 / c2cs35208g. PMID 22940700.
внешняя ссылка
- активный сайт Интерактивное изображение (Jmol)
- Пример структуры: 1qhb
- Классификация семей / доменов:
- SCOP: Семья a.111.1.2: Галопероксидаза (бромпероксидаза)
- CATH: Надсемейство 1.10.606.10: Ванадийсодержащая хлоропероксидаза, домен 2
- CDD: cd03398: PAP2_haloperoxidase
- ИнтерПро: цельный белок
Этот фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |