PRDX6 - PRDX6
Пероксиредоксин-6 это белок что у людей кодируется PRDX6 ген.[5][6] Он является членом пероксиредоксин семейство антиоксидантных ферментов.
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства тиол-специфических антиоксидантных белков. Этот белок представляет собой бифункциональный фермент с двумя различными активными центрами. Он участвует в окислительно-восстановительной регуляции клетки; он может восстанавливать H (2) O (2) и короткоцепочечные органические, жирные кислоты и гидропероксиды фосфолипидов. Он может играть роль в регуляции обмена фосфолипидов, а также в защите от окислительного повреждения.[6]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Нормальный |
| Плодородие | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Тревога | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Плазма иммуноглобулины | Нормальный |
| Гематология | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Эпидермис хвоста цельный | Нормальный |
| Гистопатология кожи | Нормальный |
| Гистопатология мозга | Нормальный |
| Сальмонелла инфекция | Нормальный[7] |
| Citrobacter инфекция | Нормальный[8] |
| Все тесты и анализы от[9][10] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции PRDX6. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Prdx6tm1a (EUCOMM) Wtsi[11][12] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.[13][14][15]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[9][16] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей, но не наблюдали значительных отклонений.[9]
использованная литература
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000117592 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026701 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Фелан С.А. (март 2001 г.). «AOP2 (антиоксидантный белок 2): структура и функция уникального тиолоспецифического антиоксиданта». Антиоксидный окислительно-восстановительный сигнал. 1 (4): 571–84. PMID 11233154.
- ^ а б «Энтрез Ген: пероксиредоксин 6 PRDX6».
- ^ "Сальмонелла данные о заражении Prdx6 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении Prdx6 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88 (S248). Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Е. (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
дальнейшее чтение
- Маневич Ю., Фишер А.Б. (2005). «Пероксиредоксин 6, пероксиредоксин 1-Cys, участвует в антиоксидантной защите и метаболизме фосфолипидов в легких». Свободный Радич. Биол. Med. 38 (11): 1422–32. Дои:10.1016 / j.freeradbiomed.2005.02.011. PMID 15890616.
- Akesson B; Густавий Б (1975). «Работа в процессе. Возникновение фосфолипазы А1 и А2 в децидуальной оболочке человека». Простагландины. 9 (5): 667–73. Дои:10.1016/0090-6980(75)90106-9. PMID 240188.
- Hochstrasser DF; Frutiger S; Paquet N; и другие. (1993). «Карта белков печени человека: справочная база данных, созданная путем микросеквенирования и сравнения гелей». Электрофорез. 13 (12): 992–1001. Дои:10.1002 / elps.11501301201. PMID 1286669.
- Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Инфекция. 24 (3): 317–20. Дои:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
- Йейтс Д.А., Бахле Ю.С. (1989). «Фосфолипазы A2 и C легкого человека; субклеточное распределение и селективность субстрата». Биохим. Биофиз. Acta. 1003 (2): 189–95. Дои:10.1016/0005-2760(89)90254-3. PMID 2730891.
- Nagase T; Miyajima N; Танака А; и другие. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
- Голаз О; Hughes GJ; Frutiger S; и другие. (1994). "Карты белков плазмы и красных кровяных телец: обновление 1993". Электрофорез. 14 (11): 1223–31. Дои:10.1002 / elps.11501401183. PMID 8313871.
- Kim TS; Сундареш CS; Файнштейн С.И.; и другие. (1997). «Идентификация клона кДНК человека для Ca2 + -независимой фосфолипазы А2 лизосомального типа и свойства экспрессированного белка». J. Biol. Chem. 272 (4): 2542–50. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2542. PMID 8999971.
- Франк С., Мунц Б., Вернер С. (1997). «Человеческий гомолог говяжьей неселеновой глутатионпероксидазы представляет собой новый ген, регулируемый фактором роста кератиноцитов». Онкоген. 14 (8): 915–21. Дои:10.1038 / sj.onc.1200905. PMID 9050990.
- Кан С.В., Бейнс И.К., Ри С.Г. (1998). «Характеристика пероксиредоксина млекопитающих, содержащего один консервативный цистеин». J. Biol. Chem. 273 (11): 6303–11. Дои:10.1074 / jbc.273.11.6303. PMID 9497358.
- Choi HJ; Кан SW; Ян СН; и другие. (1998). «Кристаллическая структура нового фермента пероксидазы человека при разрешении 2,0 A». Nat. Struct. Биол. 5 (5): 400–6. Дои:10.1038 / nsb0598-400. PMID 9587003.
- Чен JW; Dodia C; Файнштейн С.И.; и другие. (2000). «1-Cys пероксиредоксин, бифункциональный фермент с активностью глутатионпероксидазы и фосфолипазы A2». J. Biol. Chem. 275 (37): 28421–7. Дои:10.1074 / jbc.M005073200. PMID 10893423.
- Фатма Н., Сингх Д.П., Шинохара Т., Чайлак Л.Т. (2002). «Регуляция транскрипции гена антиоксидантного белка 2, тиол-специфического антиоксиданта, фактором роста, происходящим из эпителия хрусталика, для защиты клеток от окислительного стресса». J. Biol. Chem. 276 (52): 48899–907. Дои:10.1074 / jbc.M100733200. PMID 11677226.
- Вагнер Э; Luche S; Penna L; и другие. (2002). «Метод обнаружения избыточного окисления цистеинов: пероксиредоксины окисляются in vivo в цистеине активного центра во время окислительного стресса». Biochem. J. 366 (Pt 3): 777–85. Дои:10.1042 / BJ20020525. ЧВК 1222825. PMID 12059788.
- Leavey PJ; Гонсалес-Аллер С; Турман Г; и другие. (2003). «Белок массой 29 кДа, связанный с p67phox, экспрессирует как пероксиредоксин, так и фосфолипазу А2, и усиливает продукцию супероксид-анионов бесклеточной системой активности НАДФН-оксидазы». J. Biol. Chem. 277 (47): 45181–7. Дои:10.1074 / jbc.M202869200. PMID 12121978.
- Маневич Ю; Sweitzer T; Pak JH; и другие. (2002). «Сверхэкспрессия 1-Cys пероксиредоксина защищает клетки от повреждения мембран, опосредованного перекисным окислением фосфолипидов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (18): 11599–604. Дои:10.1073 / pnas.182384499. ЧВК 129315. PMID 12193653.
- Штраусберг Р.Л .; Feingold EA; Рябчик LH; и другие. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Krapfenbauer K; Engidawork E; Кэрнс N; и другие. (2003). «Аберрантная экспрессия подтипов пероксиредоксина при нейродегенеративных расстройствах». Мозг Res. 967 (1–2): 152–60. Дои:10.1016 / S0006-8993 (02) 04243-9. PMID 12650976.
- Куда О, Брезинова М., Силхави Дж., Ланда В., Зидек В., Додиа С., Кройхвиг Ф., Врбаки М., Балас Л., Дюран Т., Хюбнер Н., Фишер А. Б., Копецки Дж., Правенец М. (июнь 2018 г.). «Nrf2-опосредованная антиоксидантная защита и пероксиредоксин 6 связаны с биосинтезом пальмитиновой кислоты сложного эфира 9-гидроксистеариновой кислоты (9-PAHSA)». Сахарный диабет. 67 (6): 1190–1199. Дои:10.2337 / db17-1087. ЧВК 6463562. PMID 29549163.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
