WDR12 - WDR12

WDR12
Идентификаторы
ПсевдонимыWDR12, YTM1, повторяющийся домен WD 12
Внешние идентификаторыOMIM: 616620 MGI: 1927241 ГомолоГен: 10098 Генные карты: WDR12
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение WDR12
Геномное расположение WDR12
Группа2q33.2Начинать202,874,782 бп[1]
Конец203,014,798 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE WDR12 218512 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

55759

57750

Ансамбль

ENSG00000138442

ENSMUSG00000026019

UniProt

Q9GZL7

Q9JJA4

RefSeq (мРНК)

NM_018256
NM_001371664

NM_001199060
NM_001199061
NM_021312

RefSeq (белок)

NP_060726
NP_001358593

NP_001185989
NP_001185990
NP_067287

Расположение (UCSC)Chr 2: 202,87 - 203,01 МбChr 1: 60.07 - 60.1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок биогенеза рибосом WDR12 это белок что у людей кодируется WDR12 ген на хромосома 2.[5][6][7] Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток.[8] WDR12 участвует в биогенез рибосом и распространение клеток как компонент комплекса PeboW.[5] Этот белок связан с сердечно-сосудистые заболевания Такие как ишемическая болезнь сердца и инфаркт миокарда.[9] В PCSK9 ген также содержит один из 27 места связано с повышенным риском ишемической болезни сердца.[10]

Структура

Ген

В WDR12 ген находится на хромосоме 2 в полосе 2q33.2 и включает 13 экзоны.[7]

Протеин

WDR12 является членом семейства WD repeat WDR12 / YTM1 и содержит 7 WD повторяет.[11][5] Каждый повтор WD обычно содержит C-терминал триптофан -аспарагиновая кислота дипептид и N-концевой глицин -гистидин дипептид.[12] Нарушение этих 7 WD повторов трамбует с предсказанной пропеллероподобной структурой и, следовательно, ее ядрышковый локализация.[5] На N-конце WDR12 находится убиквитин -подобный (UBL) домен, который содержит β-захватывающую складку, подобную той, что обнаружена в убиквитине. Домен UBL связывает моторный белок мидазин и способствует высвобождению комплекса PeBoW, который состоит из WDR12, Pescadillo 1 (PES1 ) и Блок распространения 1 (BOP1 ), из прерибосомных частиц.[12][13]

Функция

Ген WDR12 повсеместно экспрессируется во время эмбриогенез, а высокие уровни находятся в вилочковая железа и яички взрослых мышей.[5] Это решающий фактор для млекопитающих. рибосома путь биогенеза, который образует стабильный комплекс под названием PeboW с Pes1 и Bop1.[5][6] WDR12 требуется для обработки предшественника 32S рРНК не влияя на синтез первичного транскрипта 45S / 47S, и он функционирует в созревании 60S рибосомная субъединица. Истощение WDR12 серьезно тормозит пролиферацию клеток.[6] Замечено, что WDR12 миРНК молчание in vitro привело к снижению фосфорилирования p38 MAPK, HSP27, и ERK1 / 2 в миоцитах новорожденных, что может частично объяснить механистическую роль WDR12 в регуляции пролиферации, дифференцировки и выживания клеток.[14][15] Учитывая доказательства in vitro связывания WDR12 с цитоплазматическим доменом Notch1 постулируется, что WDR12 также участвует в модуляции Notch сигнализация Мероприятия.[16]

Клиническое значение

У человека большой исследование ассоциации всего генома (GWAS) идентифицировал несколько однонуклеотидный полиморфизм (SNP), которые были воспроизводимы и тесно связаны с риском ишемической болезни сердца и инфаркта миокарда (т. Е. сердечные приступы ). В этом крупном генетическом исследовании 46 геномных локусов были связаны с вариациями восприимчивости к ишемической болезни сердца.[17] Из 46 полногеномных SNP 12 указали на связь с уровнями липидов, а 5 показали значительную связь с высокое кровяное давление. Соответственно, один из наиболее сильно ассоциированных вариантов был локализован в локусе WDR12, что также изначально было связано с риском раннего инфаркта миокарда.[17] Однако его точная клеточная и функциональная роль в сердце все еще не определена.

Биомаркер

Экспрессия WDR12 в сердце крысы и сердце человека изучалась с использованием доставки гена WDR12, чтобы изучить прямые функциональные и структурные эффекты WDR12 на сердечную дезадаптивность. реконструкция, в частности левый желудочек. Это недавнее исследование показало, что сверхэкспрессия WDR12 путем доставки гена может ухудшить как систолический и диастолическая функция сердца крысы. Аналогичным образом, последующий анализ когорты из 1400 человек подтвердил, что вариант WDR12 был связан с диастолический дисфункция.[12]

Кроме того, исследование множественных локусов генетического риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген WDR12, выявило лиц с повышенным риском как по заболеваемости, так и по рецидиву. Коронарная артерия события болезни, а также усиление клинической пользы от статины терапия. Исследование было основано на когортном исследовании сообщества (исследование Malmo Diet and Cancer) и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях. испытания когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22).[10]

Взаимодействия

Интерактивная карта пути

WDR12 участвует во взаимодействии внутри основной путь процессинга рРНК в ядрышке.

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138442 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026019 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d е ж Hölzel M, Rohrmoser M, Schlee M, Grimm T., Harasim T., Malamoussi A, Gruber-Eber A., ​​Kremmer E, Hiddemann W., Bornkamm GW, Eick D. (август 2005 г.). «WDR12 млекопитающих является новым членом комплекса Pes1-Bop1 и необходим для биогенеза рибосом и пролиферации клеток». Журнал клеточной биологии. 170 (3): 367–78. Дои:10.1083 / jcb.200501141. ЧВК  2171466. PMID  16043514.
  6. ^ а б c Рормозер М., Хельцель М., Гримм Т., Маламусси А., Харасим Т., Орбан М., Пфистерер И., Грубер-Эбер А., Креммер Е., Эйк Д. (май 2007 г.). «Взаимозависимость Pes1, Bop1 и WDR12 контролирует локализацию ядрышек и сборку комплекса PeBoW, необходимого для созревания 60S субъединицы рибосомы». Молекулярная и клеточная биология. 27 (10): 3682–94. Дои:10.1128 / MCB.00172-07. ЧВК  1899993. PMID  17353269.
  7. ^ а б «Ген Entrez: домен повторения WD 12 WDR12».
  8. ^ «BioGPS - ваша система генного портала». biogps.org. Получено 2016-08-23.
  9. ^ Консорциум генетики инфаркта миокарда (март 2009 г.). «Общегеномная ассоциация инфаркта миокарда с ранним началом с однонуклеотидными полиморфизмами и вариантами числа копий». Природа Генетика. 41 (3): 334–41. Дои:10,1038 / нг.327. ЧВК  2681011. PMID  19198609.
  10. ^ а б Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (Июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза от терапии статинами: анализ испытаний первичной и вторичной профилактики». Ланцет. 385 (9984): 2264–71. Дои:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. ЧВК  4608367. PMID  25748612.
  11. ^ «WDR12 - белок биогенеза рибосом WDR12 - Homo sapiens (человек) - ген и белок WDR12». www.uniprot.org. Получено 2016-08-23.
  12. ^ а б c Мойланен А.М., Риса Дж., Кайкконен Л., Карвонен Т., Мустонен Э., Серпи Р., Сабо З., Тенхунен О, Багюра З., Няпанкангас Дж., Охукайнен П., Тави П., Керкела Р., Леосдоттир М., Вальстранд Б. Меландер Оед , Ruskoaho H (01.01.2015). «WDR12, член Nucleolar PeBoW-Complex, активируется при сердечной недостаточности и вызывает ухудшение сердечной функции». PLOS ONE. 10 (4): e0124907. Дои:10.1371 / journal.pone.0124907. ЧВК  4411154. PMID  25915632.
  13. ^ Ромес Э.М., Собхани М., Стэнли Р. Э. (январь 2016 г.). «Кристаллическая структура убиквитиноподобного домена фактора сборки рибосомы Ytm1 и характеристика его взаимодействия с мидазином AAA-ATPase». Журнал биологической химии. 291 (2): 882–93. Дои:10.1074 / jbc.M115.693259. ЧВК  4705406. PMID  26601951.
  14. ^ Роуз Б.А., Force T, Ван И (октябрь 2010 г.). «Передача сигналов митоген-активируемой протеинкиназы в сердце: ангелы против демонов в душераздирающей истории». Физиологические обзоры. 90 (4): 1507–46. Дои:10.1152 / физрев.00054.2009. ЧВК  3808831. PMID  20959622.
  15. ^ Уиллис М.С., Паттерсон С. (октябрь 2010 г.). «Держи меня крепче: роль шаперонов семейства белков теплового шока в сердечных заболеваниях». Тираж. 122 (17): 1740–51. Дои:10.1161 / CIRCULATIONAHA.110.942250. ЧВК  2976481. PMID  20975010.
  16. ^ Нал Б., Мор Э., Сильва М. И., Тагетт Р., Наварро С., Кэрролл П., Депетрис Д., Верту С., Джордан Б. Р., Ферриер П. (январь 2002 г.). «Wdr12, мышиный ген, кодирующий новый белок WD-Repeat с беззубчатым аминоконцевым доменом». Геномика. 79 (1): 77–86. Дои:10.1006 / geno.2001.6682. PMID  11827460.
  17. ^ а б Катиресан С., Войт Б.Ф., Перселл С., Мусунуру К., Ардиссино Д., Маннуччи П.М. и др. (Март 2009 г.). «Общегеномная ассоциация инфаркта миокарда с ранним началом с однонуклеотидными полиморфизмами и вариантами числа копий». Природа Генетика. 41 (3): 334–41. Дои:10,1038 / нг.327. ЧВК  2681011. PMID  19198609.

дальнейшее чтение

  • Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х., Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
  • Нал Б., Мор Э., Сильва М. И., Тагетт Р., Наварро С., Кэрролл П., Депетрис Д., Верту С., Джордан Б. Р., Ферриер П. (январь 2002 г.). «Wdr12, мышиный ген, кодирующий новый белок WD-Repeat с беззубчатым аминоконцевым доменом». Геномика. 79 (1): 77–86. Дои:10.1006 / geno.2001.6682. PMID  11827460.
  • Scherl A, Couté Y, Déon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC, Greco A, Hochstrasser D, Diaz JJ (ноябрь 2002 г.). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Молекулярная биология клетки. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
  • Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
  • Хига Л.А., Ву М., Йе Т, Кобаяши Р., Сун Х., Чжан Х. (ноябрь 2006 г.). «Убиквитинлигаза CUL4-DDB1 взаимодействует с множеством белков WD40-повторов и регулирует метилирование гистонов». Природа клеточной биологии. 8 (11): 1277–83. Дои:10.1038 / ncb1490. PMID  17041588. S2CID  22180568.