Коллаген, тип XVI, альфа 1 - Collagen, type XVI, alpha 1

COL16A1
Идентификаторы
ПсевдонимыCOL16A1, 447AA, FP1572, коллаген типа XVI альфа 1, коллаген типа XVI альфа 1 цепь
Внешние идентификаторыOMIM: 120326 MGI: 1095396 ГомолоГен: 1397 Генные карты: COL16A1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение COL16A1
Геномное расположение COL16A1
Группа1п35.2Начинать31,652,263 бп[1]
Конец31,704,319 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE COL16A1 204345 в формате fs.png

PBB GE COL16A1 gnf1h03617 x at fs.png

PBB GE COL16A1 gnf1h03616 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1307

107581

Ансамбль

ENSG00000084636

ENSMUSG00000040690

UniProt

Q07092

Q8BLX7

RefSeq (мРНК)

NM_001856

NM_028266

RefSeq (белок)

NP_001847

NP_082542

Расположение (UCSC)Chr 1: 31,65 - 31,7 МбChr 4: 130,05 - 130,1 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-1 (XVI) это белок что у людей кодируется COL16A1 ген.[5][6]

Функция

Этот ген кодирует альфа-цепь коллагена типа XVI, члена семейства коллагенов FACIT (коллагены, ассоциированные с фибриллами, с прерывистыми спиралями). Члены этого семейства коллагенов обнаруживаются в ассоциации с фибриллообразующими коллагенами, такими как тип I и II, и служат для поддержания целостности внеклеточный матрикс. Высокий уровень коллагена типа XVI был обнаружен в фибробласты и кератиноциты, а в гладких мышцах и амнион.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000084636 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040690 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Pan TC, Zhang RZ, Mattei MG, Timpl R, Chu ML (август 1992 г.). «Клонирование и хромосомная локализация коллагена альфа 1 (XVI) человека». Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (14): 6565–9. Дои:10.1073 / pnas.89.14.6565. ЧВК  49542. PMID  1631157.
  6. ^ а б «Ген Энтреза: коллаген COL16A1, тип XVI, альфа 1».

дальнейшее чтение

  • Ямагути Н., Кимура С., Макбрайд О.В., Хори Х., Ямада Й., Канамори Т., Ямакоши Х., Нагай Ю. (1993). «Молекулярное клонирование и частичная характеристика новой коллагеновой цепи альфа 1 (XVI), состоящей из повторяющихся коллагеновых доменов и неколлагеновых сегментов, содержащих цистеин». J. Biochem. 112 (6): 856–63. PMID  1284248.
  • Ратцингер С., Грэссель С., Довейко А., Райхерт Т.Э., Бауэр Р.Дж. (2011). «Индукция экспрессии коллагена типа XVI способствует пролиферации раковых клеток полости рта». Матричная биология. 30 (2): 118–25. Дои:10.1016 / j.matbio.2011.01.001. PMID  21251976.
  • Sires UI, Dublet B, Aubert-Foucher E, van der Rest M, Welgus HG (1995). «Деградация домена COL1 коллагена типа XIV желатиназой 92 кДа». J. Biol. Chem. 270 (3): 1062–7. Дои:10.1074 / jbc.270.3.1062. PMID  7836360.
  • Тиллет Э, Манн К., Ништ Р., Пан Т.С., Чу М.Л., Тимпл Р. (1995). «Рекомбинантный анализ человеческого альфа 1 (XVI) коллагена. Доказательства процессинга N-концевого глобулярного домена». Евро. J. Biochem. 228 (1): 160–8. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20245.x. PMID  7882999.
  • Grässel S, Timpl R, Tan EM, Chu ML (1997). «Биосинтез и переработка коллагена типа XVI в фибробластах человека и гладкомышечных клетках». Евро. J. Biochem. 242 (3): 576–84. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0576r.x. PMID  9022684.
  • Ратцингер С., Грэссель С., Довейко А., Райхерт Т.Э., Бауэр Р.Дж. (март 2011 г.). «Индукция экспрессии коллагена типа XVI способствует пролиферации раковых клеток полости рта». Матричная биология. 30 (2): 118–25. Дои:10.1016 / j.matbio.2011.01.001. PMID  21251976.
  • Касснер А., Хансен Ю., Миосге Н., Рейнхардт Д.П., Айгнер Т., Брукнер-Тудерман Л., Брукнер П., Грэссель С. (2004). «Дискретная интеграция коллагена XVI в тканеспецифические фибриллы коллагена или микрофибриллы в форме шариков». Матрикс Биол. 22 (2): 131–43. Дои:10.1016 / S0945-053X (03) 00008-8. PMID  12782140.
  • Касснер А., Тидеманн К., Нотбом Х., Людвиг Т., Моргелин М., Рейнхардт Д.П., Чу М.Л., Брукнер П., Грэссель С. (2004). «Молекулярная структура и взаимодействие рекомбинантного человеческого коллагена типа XVI». J. Mol. Биол. 339 (4): 835–53. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.03.042. PMID  15165854.
  • Eble JA, Kassner A, Niland S, Mörgelin M, Grifka J, Grässel S (2006). «Коллаген XVI содержит сайт узнавания интегрина альфа1 бета1 в своих С-концевых доменах». J. Biol. Chem. 281 (35): 25745–56. Дои:10.1074 / jbc.M509942200. PMID  16754661.

внешняя ссылка