Ламинин, альфа 5 - Википедия - Laminin, alpha 5

LAMA5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2Y38
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMA5, Ламинин, альфа 5, субъединица ламинина альфа 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 601033 MGI: 105382 ГомолоГен: 4060 Генные карты: LAMA5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 20 (человек)
Конец	62,367,312 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	180,225,859 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• структурная молекулярная активность; • связывание интегрина; • рецепторное связывание; • структурная составляющая внеклеточного матрикса;
Сотовый компонент	• внеклеточный матрикс; • ламинин-5 комплекс; • внеклеточная область; • базальная мембрана; • комплекс ламинин-10; • комплекс ламинина-11; • внеклеточная экзосома; • ядро клетки; • внеклеточный; • синаптическая щель; • нервномышечное соединение; • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс;
Биологический процесс	• развитие волосяного фолликула; • дифференциация клеток; • регуляция эмбрионального развития; • регулирование миграции клеток; • распознавание клеток; • развитие эмбриона; • развитие легких; • развитие мышечных органов; • организация внеклеточного матрикса; • морфогенез поляризованного эпителия; • одонтогенез дентинсодержащего зуба; • узел фокальной адгезии; • ветвление участвует в морфогенезе зачатка мочеточника; • регуляция клеточной адгезии; • клеточная адгезия; • регулирование пролиферации клеток; • организация цитоскелета; • ангиогенез; • миграция клеток нервного гребня; • морфогенез органов животных; • интегрин-опосредованный сигнальный путь; • дифференцировка эндотелиальных клеток; • распространение клеток, зависящее от адгезии субстрата; • морфогенез эмбрионального эпителия; • клеточная пролиферация; • миграция клеток; • морфогенез ветвления эпителиальной трубки; • ветвление, участвующее в морфогенезе слюнных желез; • морфогенез ресничек; • локализация белка на плазматической мембране; • цитокин-опосредованный сигнальный путь; • гистогенез; • межклеточная адгезия;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3911
	16776
	ENSG00000130702
	ENSMUSG00000015647
	O15230
	Q61001
	NM_005560
	NM_001081171
	NP_005551
	NP_001074640
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Субъединица ламинина альфа-5 это белок что у людей кодируется LAMA5 ген.^[5]^[6]

Функция

Компоненты внеклеточного матрикса оказывают огромное влияние на ткани по всему телу. В частности, ламинины, семейство гетеротримерных внеклеточных гликопротеинов, влияют на развитие и целостность тканей в таких различных органах, как почки, легкие, кожа и нервная система. Считается, что ламинины опосредуют прикрепление, миграцию и организацию клеток в тканях во время эмбрионального развития, взаимодействуя с другими компонентами внеклеточного матрикса. Ламинины функционируют как гетеротримерные комплексы альфа-, бета- и гамма-цепей, причем каждый тип цепи представляет отдельное подсемейство белков. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к альфа-подсемейству цепей ламинина и является основным компонентом базальных мембран. Для этого гена обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, но полноразмерная природа одного из них не установлена.^[6]

Взаимодействия

Ламинин, альфа 5, как было показано взаимодействовать с BCAM.^[7]^[8]

дальнейшее чтение

Утани А., Номидзу М., Ямада Ю. (январь 1997 г.). «Фибулин-2 связывается с короткими плечами ламинина-5 и ламинина-1 посредством консервативных аминокислотных последовательностей». Журнал биологической химии. 272 (5): 2814–20. Дои:10.1074 / jbc.272.5.2814. PMID 9006922.
Руссель П., Кин Д.Р., Руджеро Ф., Шамплио М.Ф., Рест М., Берджесон Р.Э. (август 1997 г.). «Ламинин 5 связывает домен NC-1 коллагена VII типа». Журнал клеточной биологии. 138 (3): 719–28. Дои:10.1083 / jcb.138.3.719. ЧВК 2141627. PMID 9245798.
Tiger CF, Champliaud MF, Pedrosa-Domellof F, Thornell LE, Ekblom P, Gullberg D (ноябрь 1997 г.). «Присутствие цепи ламинина альфа5 и отсутствие цепи ламинина альфа1 во время развития мышц человека и при мышечных дистрофиях». Журнал биологической химии. 272 (45): 28590–5. Дои:10.1074 / jbc.272.45.28590. PMID 9353324.
Mrowiec T, Melchar C, Górski A (1998). «Опосредованные белком ВИЧ изменения во взаимодействиях Т-клеток с белками внеклеточного матрикса и эндотелием». Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis. 45 (2–3): 255–9. PMID 9597096.
Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID 9628581.
Симидзу Х., Хосокава Х., Ниномия Х., Майнер Дж. Х., Масаки Т. (апрель 1999 г.). «Адгезия культивированных эндотелиальных клеток аорты крупного рогатого скота к ламинину-1, опосредованная дистрогликаном». Журнал биологической химии. 274 (17): 11995–2000. Дои:10.1074 / jbc.274.17.11995. PMID 10207021.
Сын Ю.Дж., Скрэнтон Т.В., Сандерленд В.Дж., Бэк С.Дж., Майнер Дж.Х., Санес-младший, Карлсон СС (январь 2000 г.). «Белок синаптических везикул SV2 образует комплекс с альфа5-содержащим ламинином на поверхности нервного окончания». Журнал биологической химии. 275 (1): 451–60. Дои:10.1074 / jbc.275.1.451. PMID 10617638.
Кёлер Д., Крузе М., Штёкер В., Стерчи Е.Е. (январь 2000 г.). «Гетерологически сверхэкспрессированный, аффинно очищенный человеческий меприн альфа является функционально активным и расщепляет компоненты базальной мембраны in vitro». Письма FEBS. 465 (1): 2–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01712-3. PMID 10620696. S2CID 22895580.
Киккава Ю., Сандзен Н., Фудзивара Х, Сонненберг А., Секигучи К. (март 2000 г.). «Специфичность связывания интегрина ламинина-10/11: ламинин-10/11 распознается интегринами альфа 3 бета 1, альфа 6 бета 1 и альфа 6 бета 4». Журнал клеточной науки. 113 (Pt 5) (5): 869–76. PMID 10671376.
Champliaud MF, Virtanen I, Tiger CF, Korhonen M, Burgeson R, Gullberg D (сентябрь 2000 г.). «Посттрансляционные модификации и ассоциации бета / гамма цепей ламинина альфа1 и цепей ламинина альфа5 человека: очистка ламинина-3 из плаценты». Экспериментальные исследования клеток. 259 (2): 326–35. Дои:10.1006 / excr.2000.4980. PMID 10964500.
Libby RT, Champliaud MF, Claudepierre T., Xu Y, Gibbons EP, Koch M, Burgeson RE, Hunter DD, Brunken WJ (сентябрь 2000 г.). «Экспрессия ламинина во взрослой и развивающейся сетчатке: данные о двух новых ламининах ЦНС». Журнал неврологии. 20 (17): 6517–28. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-17-06517.2000. ЧВК 2924637. PMID 10964957.
Пирс Р.А., Гриффин Г.Л., Майнер Дж. Х., старший RM (декабрь 2000 г.). «Образцы экспрессии ламинина альфа1 и альфа5 в легких человека во время развития». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии. 23 (6): 742–7. Дои:10.1165 / ajrcmb.23.6.4202. PMID 11104726.
Парсонс С.Ф., Ли Джи, Спринг Ф.А., Уиллиг Т.Н., Питерс Л.Л., Гимм Дж. А., Таннер М.Дж., Мохандас Н., Энсти Д.И., Часис Д.А. (январь 2001 г.). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают человеческий ламинин, содержащий альфа5-цепь, с высоким сродством». Кровь. 97 (1): 312–20. Дои:10.1182 / blood.V97.1.312. PMID 11133776.
Сагизаде М., Браун Д. Дж., Кастельон Р., Чва М., Хуанг Г. Х., Любимова Ю. Ю., Розенберг С., Спирин К. С., Столитенко Р. Б., Адачи В., Киношита С., Мерфи Г., Виндзор Л. Дж., Кенни М. С., Любимов А. В. (февраль 2001 г.). «Сверхэкспрессия матричной металлопротеиназы-10 и матриксной металлопротеиназы-3 в роговице человека с диабетом: возможный механизм изменений базальной мембраны и интегрина». Американский журнал патологии. 158 (2): 723–34. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 64015-1. ЧВК 1850323. PMID 11159210.
McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (июнь 2001 г.). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнных желез человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Архивы оральной биологии. 46 (6): 545–55. Дои:10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0. PMID 11311202.
Gagnoux-Palacios L, Allegra M, Spirito F, Pommeret O, Romero C, Ortonne JP, Meneguzzi G (май 2001 г.). «Короткое плечо цепи ламинина гамма2 играет ключевую роль во включении ламинина 5 во внеклеточный матрикс и в клеточной адгезии». Журнал клеточной биологии. 153 (4): 835–50. Дои:10.1083 / jcb.153.4.835. ЧВК 2192378. PMID 11352943.
Нагасе Т., Кикуно Р., Охара О. (август 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XXI. Полные последовательности 60 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки». ДНК исследования. 8 (4): 179–87. Дои:10.1093 / dnares / 8.4.179. PMID 11572484.
Дои М., Тиболл Дж., Кортесмаа Дж., Янссон К., Иванайнен А., Парварде М., Тимпл Р., Хедин Ю., Сведенборг Дж., Трюггвасон К. (апрель 2002 г.). «Рекомбинантный человеческий ламинин-10 (alpha5beta1gamma1). Продукция, очистка и активность, способствующая миграции в отношении эндотелиальных клеток сосудов». Журнал биологической химии. 277 (15): 12741–8. Дои:10.1074 / jbc.M111228200. PMID 11821406.

Эта статья о ген на хромосома человека 20 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130702 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015647 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9271224-5] Дуркин М.Э., Лоечел Ф., Маттей М.Г., Гилпин Б.Дж., Альбрехтсен Р., Вевер УМ (июль 1997 г.). «Тканеспецифическая экспрессия альфа5-цепи ламинина человека и картирование гена на хромосоме 20q13.2-13.3 человека и на дистальной хромосоме 2 мыши рядом с локусом мутации ragged (Ra)». Письма FEBS. 411 (2–3): 296–300. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8. PMID 9271224. S2CID 45286880.

[entrez-6] а ^б «Энтрез Ген: ламинин LAMA5, альфа 5».

[pmid11133776-7] Парсонс С.Ф., Ли Джи, Спринг Ф.А., Уиллиг Т.Н., Питерс Л.Л., Гимм Дж. А., Таннер М.Дж., Мохандас Н., Энсти Д.И., Часис Д.А. (январь 2001 г.). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают человеческий ламинин, содержащий альфа5-цепь, с высоким сродством». Кровь. 97 (1): 312–20. Дои:10.1182 / blood.V97.1.312. PMID 11133776.

[pmid12244066-8] Киккава Ю., Моулсон К.Л., Виртанен И., Майнер Дж. Х. (ноябрь 2002 г.). «Идентификация сайта связывания гликопротеина лютеранской группы крови на ламинине альфа 5 посредством экспрессии цепей химерного ламинина in vivo». Журнал биологической химии. 277 (47): 44864–9. Дои:10.1074 / jbc.M208731200. PMID 12244066.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Ламинин, альфа 5 - Википедия - Laminin, alpha 5

Содержание

Функция

Взаимодействия

Рекомендации

дальнейшее чтение