Гаплогруппа E-M75 - Haplogroup E-M75

Гаплогруппа E-M75
Возможное время происхождения45 000–50 000 лет назад
Возможное место происхожденияВосточная Африка
ПредокE-M96
ПотомкиE-M41, E-M54
Определение мутацийM75, P68

Гаплогруппа E-M75 это гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека. Вместе с гаплогруппа E-P147, это одна из двух основных ветвей старого гаплогруппа E-M96.

Распределение

Сортированная таблица частот популяций E-M75 +. Обратите внимание на "?" указывает, что суб-линия E-M75 не была протестирована или не сообщалась в соответствующем исследовании.

численность населенияОбласть, крайРазмерE-M75 +M41 +M54 +E-M75 + M41-M54-
Алур[1]Восточная Африка966.67%66.67%0.00%0.00%
Хема[1]Восточная Африка1838.89%38.89%0.00%0.00%
Коса[1]Южная Африка8027.50%0.00%27.50%0.00%
Римайбе[2]Западная африка3727.03%?27.03%?
Пигмеи мбути[2]Центральная Африка1225.00%?25.00%?
Даба[2]Центральная Западная Африка1822.22%?22.22%?
Eviya[3]Центральная Западная Африка2420.83%???
Зулусский[1]Южная Африка2920.69%0.00%20.69%0.00%
Банту (Кения)[4]Восточная Африка2917.24%3.45%13.79%0.00%
Эфиопия[5]Восточная Африка8817.05%17.05%0.00%0.00%
Ганда[1]Восточная Африка2615.38%7.69%3.85%3.85%
Южная Африка[5]Южная Африка5315.09%0.00%15.09%0.00%
Коморский ширази[6]Восточная Африка-14.00%0.00%14.00%0.00%
Акеле[3]Центральная Западная Африка5012.00%???
Эшира[3]Центральная Западная Африка4211.90%???
Дама[1]Южная Африка1811.11%0.00%5.56%5.56%
Смешанный нило-сахарский[2]Центральная Западная Африка911.11%?11.11%?
Обамба[3]Центральная Западная Африка4710.64%???
Орунгу[3]Центральная Западная Африка219.52%???
Встряхнуть[3]Центральная Западная Африка439.30%???
Сенегальский[7]Западная Африка339.09%???
Хуту[4]Восточная Африка698.70%4.35%4.35%0.00%
Дума[3]Центральная Западная Африка468.70%???
Малагасийский[8]Мадагаскар358.57%0.00%8.57%0.00%
Теке[3]Центральная Западная Африка488.33%???
C.Africa[5]Центральная Африка378.11%0.00%8.11%0.00%
Мандара[1]Центральная Африка287.14%0.00%7.14%0.00%
Нгумба[1]Центральная Африка316.45%0.00%6.45%0.00%
! Кунг[2]Южная Африка646.25%?6.25%?
Ндуму[3]Центральная Западная Африка365.56%???
афро-американцы[7]Северная Америка1995.53%???
Фон[4]Западная Африка1005.00%0.00%5.00%0.00%
Судан[5]Восточная Африка405.00%5.00%0.00%0.00%
Цого[3]Центральная Западная Африка605.00%???
Амбо[1]Южная Африка224.55%0.00%4.55%0.00%
Пигмеи мбути[1]Восточная Африка474.26%0.00%4.26%0.00%
Тутси[4]Восточная Африка944.26%0.00%4.26%0.00%
Галоа[3]Центральная Западная Африка474.26%???
Нгумба[3]Центральная Западная Африка244.17%???
Мосси[2]Западная африка494.08%?4.08%?
Кхве[2]Южная Африка263.85%?3.85%?
Сото-Тсвана[1]Южная Африка283.57%0.00%3.57%0.00%
Нзеби[3]Центральная Западная Африка573.51%???
Пуну[3]Центральная Западная Африка583.45%???
Пигмеи бакола[1]Центральная Африка333.03%0.00%3.03%0.00%
Волоф[1]Западная Африка342.94%0.00%2.94%0.00%
Сенегальский[9]Западная Африка1392.88%???
Мандинка[1]Западная Африка392.56%0.00%0.00%2.56%
Кикуйю и Камба[1]Восточная Африка422.38%0.00%2.38%0.00%
Вайрак[4]Восточная Африка432.33%2.33%0.00%0.00%
Макина[3]Центральная Западная Африка432.33%???
Бенга[3]Центральная Западная Африка482.08%???
Шона[1]Южная Африка492.04%0.00%0.00%2.04%
Кота[3]Центральная Западная Африка531.89%???
Догоны[1]Западная Африка551.82%0.00%1.82%0.00%
Арабы (Оман)[4]Ближний Восток / Азия1211.65%0.00%1.65%0.00%
Эфиопский (оромо)[9]Восточная Африка781.28%???

Субклады

Paragroup E-M75

Гаплогруппа E-M75 (xM41, M54) была обнаружена в 6% (1/18) образца Дама из Намибии,[1] 4% (1/26) выборки Ганда из Уганды,[1] 3% (1/39) выборки Мандинка из Гамбии / Сенегала,[1] и 2% (1/49) выборки Шона из Зимбабве.[1]

E-M41

Гаплогруппа E-M41 была обнаружена в основном в популяциях Великие озера и Верхний Нил регионы Центральная -Восток Африка, в том числе 67% (6/9) выборки Алур из ДРК,[1] 39% (7/18) выборки Хема из ДРК,[1] 17% (15/88) выборки из Эфиопии,[5] 8% (2/26) выборки Ганда из Уганды,[1] 5% (2/40) выборки из Судана,[5] 4% (3/69) выборки Хуту из Руанды,[4] 3% (1/29) выборки Банту из Кении,[4] и 2% (1/43) выборки Ирак из Танзании.[4]

E-M54

Гаплогруппа E-M54 была обнаружена в 28% (22/80) выборки Коса из Южной Африки,[1] 27% (10/37) выборки Римайбе из Буркина-Фасо,[2] 22% (4/18) выборки Даба из северного Камеруна,[2] 21% (6/29) выборки Зулусский из Южной Африки,[1] 15% (8/53) выборки нехойсанских южноафриканцев,[5] 14% (4/29) выборки Банту из Кении,[4] 14% выборки Коморский Ширази,[6] 11% (1/9) небольшой выборки спикеров Центральный суданский и Сахара языки из северного Камеруна,[2] 9% (3/35) выборки Малагасийский из Мадагаскара,[8] 8% (3/37) выборки из Центральной Африки,[5] 7% (2/28) образца Mandara из северного Камеруна,[1] 6% (2/31) выборки Нгумба из южного Камеруна,[1] 6% (4/64) образца! Kung из Южной Африки,[2] 6% (1/18) образца Дама из Намибии,[1] 5% (5/100) образца Фон из Бенина,[4] 5% (1/22) образца Амбо из Намибии,[1] 4% (3/69) выборки Хуту из Руанды,[4] 4% (4/94) выборки Тутси из Руанды,[4] 4% (2/47) выборки Мбути из ДРК,[1] 4% (1/26) выборки Ганды из Уганды,[1] 4% (1/26) выборки хве из Южной Африки,[2] 4% (1/28) образца сото-тсвана из Южной Африки,[1] 3% (1/33) образца бакола из южного Камеруна,[1] 3% (1/34) выборки Волоф из Гамбии / Сенегала,[1] 3% (2/72) образца из Катара,[10] 2% (1/42) образца Кикую и Камба из Кении,[1] 2% (1/55) выборки Догоны из Мали,[1] и примерно 2% от выборки из 121 арабов из Омана.[4]

Было высказано предположение, что Y-хромосомы гаплогруппы E-M85 распространились по Африке к югу от Сахары совсем недавно, на основании того факта, что микросателлитные гаплотипы Y-STR, связанные с этими хромосомами, демонстрируют низкую степень дифференциации во всем их широком географическом диапазоне. Кроме того, средняя дисперсия STR-аллелей хромосом E-M85 выше у жителей Центральной и Западной Африки, чем у южноафриканских койсанов, что побудило исследователей предположить, что E-M85 мог быть вовлечен в расширение ареала говорящих на банту народов из Центральной Африки. -Западная Африка к югу от Африки.[2][3]

E-M98 *

E-M98 (xM85) был обнаружен в 4% (2/49) образца Мосси из Буркина-Фасо.[2]

E-M200

E-M200 был обнаружен в 25% (3/12) небольшой выборки Мбути от Демократическая Республика Конго.[2] Согласно рисунку 4 Cruciani (2002), все три Bambuti, у которых обнаружена мутация M200, имеют одинаковый микросателлитный гаплотип, основанный на семи STR-локусах друг с другом и с некоторым E-M85 (xM200). Хойсан (! Kung и / или Khwe) люди из Южной Африки.

Филогенетика

Филогенетическая история

Основная статья: Таблица преобразования для гаплогрупп Y хромосомы

До 2002 г. в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, которое, прежде всего, было своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы на основе знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
E-P2921III3А13Eu3H2BE *EEEEEEEEEE
E-M3321III3А13Eu3H2BE1 *E1E1aE1aE1E1E1aE1aE1aE1aE1a
E-M4421III3А13Eu3H2BE1aE1aE1a1E1a1E1aE1aE1a1E1a1E1a1E1a1E1a1
E-M7521III3А13Eu3H2BE2aE2E2E2E2E2E2E2E2E2E2
E-M5421III3А13Eu3H2BE2bE2bE2bE2b1-------
E-P225III414Eu3H2BE3 *E3E1bE1b1E3E3E1b1E1b1E1b1E1b1E1b1
E-M28III515Eu2H2BE3a *E3aE1b1E1b1aE3aE3aE1b1aE1b1aE1b1aE1b1a1E1b1a1
E-M588III515Eu2H2BE3a1E3a1E1b1a1E1b1a1E3a1E3a1E1b1a1E1b1a1E1b1a1E1b1a1a1aE1b1a1a1a
E-M116.28III515Eu2H2BE3a2E3a2E1b1a2E1b1a2E3a2E3a2E1b1a2E1b1a2E1ba12удаленныйудаленный
E-M1498III515Eu2H2BE3a3E3a3E1b1a3E1b1a3E3a3E3a3E1b1a3E1b1a3E1b1a3E1b1a1a1cE1b1a1a1c
E-M1548III515Eu2H2BE3a4E3a4E1b1a4E1b1a4E3a4E3a4E1b1a4E1b1a4E1b1a4E1b1a1a1g1cE1b1a1a1g1c
E-M1558III515Eu2H2BE3a5E3a5E1b1a5E1b1a5E3a5E3a5E1b1a5E1b1a5E1b1a5E1b1a1a1dE1b1a1a1d
E-M108III515Eu2H2BE3a6E3a6E1b1a6E1b1a6E3a6E3a6E1b1a6E1b1a6E1b1a6E1b1a1a1eE1b1a1a1e
E-M3525III414Eu4H2BE3b *E3bE1b1b1E1b1b1E3b1E3b1E1b1b1E1b1b1E1b1b1удаленныйудаленный
E-M7825III414Eu4H2BE3b1 *E3b1E1b1b1aE1b1b1a1E3b1aE3b1aE1b1b1aE1b1b1aE1b1b1aE1b1b1a1E1b1b1a1
E-M14825III414Eu4H2BE3b1aE3b1aE1b1b1a3aE1b1b1a1c1E3b1a3aE3b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a3aE1b1b1a1c1E1b1b1a1c1
E-M8125III414Eu4H2BE3b2 *E3b2E1b1b1bE1b1b1b1E3b1bE3b1bE1b1b1bE1b1b1bE1b1b1bE1b1b1b1E1b1b1b1a
E-M10725III414Eu4H2BE3b2aE3b2aE1b1b1b1E1b1b1b1aE3b1b1E3b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1E1b1b1b1aE1b1b1b1a1
E-M16525III414Eu4H2BE3b2bE3b2bE1b1b1b2E1b1b1b1b1E3b1b2E3b1b2E1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b2aE1b1b1b1a2a
E-M12325III414Eu4H2BE3b3 *E3b3E1b1b1cE1b1b1cE3b1cE3b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1cE1b1b1b2a
E-M3425III414Eu4H2BE3b3a *E3b3aE1b1b1c1E1b1b1c1E3b1c1E3b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1c1E1b1b1b2a1
E-M13625III414Eu4H2BE3ba1E3b3a1E1b1b1c1aE1b1b1c1a1E3b1c1aE3b1c1aE1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1c1a1E1b1b1b2a1a1

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании дерева YCC.

  • α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
  • β Андерхилл 2000
  • γ Молот 2001
  • δ Карафет 2001
  • ε Семино 2000
  • ζ Вс 1999
  • η Капелли 2001

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве YCC 2008[11] и последующие опубликованные исследования.

  • E-M75 (M75, P68)
    • E-M41 (M41 / P210)
    • E-M98 (M98)
      • E-M54 (M54, M90)
        • E-M85 (M85)
          • E-M200 (M200)
            • E-P45 (P45)
            • E-P258 (P258)

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК E субклады

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак Wood et al. (2005)
  2. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о Cruciani et al. (2002)
  3. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р Berniell-Lee et al. (2009)
  4. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п Луис и др. (2004)
  5. ^ а б c d е ж грамм час Андерхилл и др. (2000)
  6. ^ а б Мсаиди, Саид; и другие. (2011). «Генетическое разнообразие на Коморских островах показывает, что раннее мореплавание является основным фактором биокультурной эволюции человека в западной части Индийского океана» (PDF). Европейский журнал генетики человека. 19 (1): 89–94. Дои:10.1038 / ejhg.2010.128. ЧВК  3039498. PMID  20700146. Получено 19 ноября 2016.
  7. ^ а б Stefflova et al. (2009)
  8. ^ а б Hurles Matthew E .; Сайкс Брайан Ч .; Джоблинг Марк А .; Форстер Питер (май 2005 г.), «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: свидетельства материнского и отцовского происхождения», Американский журнал генетики человека, 76 (894–901): 894–901, Дои:10.1086/430051, ЧВК  1199379, PMID  15793703
  9. ^ а б Semino et al. (2004)
  10. ^ Cadenas et al. (2007)
  11. ^ Карафет и др. (2008)

Дополнительные источники

  1. Берниелл-Ли, Джемма; Калафель, Франсеск; Босх, Елена; Хейер, Эвелин; Сика, Лукас; Мугиама-Дауда, Патрик; ван дер Вин, Лолке; Хомбер, Жан-Мари; и другие. (2009), "Генетические и демографические последствия расширения банту: выводы из отцовского происхождения человека", Молекулярная биология и эволюция, 26 (7): 1581–9, Дои:10.1093 / molbev / msp069, PMID  19369595
  2. Каденас, Алисия М; Животовский, Лев А; Кавалли-Сфорца, Лука Л.; Андерхилл, Питер А; Эррера, Рене Дж. (2007), «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив», Европейский журнал генетики человека, 16 (3): 374–86, Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201934, PMID  17928816
  3. Кручиани, Фульвио; Сантоламацца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олькерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; и другие. (2002), "Обратная миграция из Азии в Африку к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением", Американский журнал генетики человека, 70 (5): 1197–214, Дои:10.1086/340257, ЧВК  447595, PMID  11910562
  4. Hurles, Matthew E .; Сайкс, Брайан Ч .; Джоблинг, Марк А .; Форстер, Питер (2005), "Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: свидетельства материнского и отцовского происхождения", Американский журнал генетики человека, 76 (5): 894–901, Дои:10.1086/430051, ЧВК  1199379, PMID  15793703
  5. Карафет, Татьяна М .; Mendez, Fernando L .; Meilerman, Monica B .; Андерхилл, Питер А .; Зегура, Стивен Л .; Хаммер, Майкл Ф. (2008), «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека», Геномные исследования, 18 (5): 830–8, Дои:10.1101 / gr.7172008, ЧВК  2336805, PMID  18385274
  6. Луис, Дж; Роулд, D; Регейро, М; Caeiro, B; Cinnioglu, C; Roseman, C; Андерхилл, П; Cavallisforza, L; Эррера, Р. (2004 г.), "Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей", Американский журнал генетики человека, 74 (3): 532–44, Дои:10.1086/382286, ЧВК  1182266, PMID  14973781
  7. Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А .; Аль-Захери, Надия; Батталья, Винченца; Макчони, Лилиана; Triantaphyllidis, Costas; и другие. (2004), "Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморском регионе", Американский журнал генетики человека, 74 (5): 1023–34, Дои:10.1086/386295, ЧВК  1181965, PMID  15069642
  8. Стефлова, Клара; Дулик, Мэтью С .; Pai, Athma A .; Уокер, Эми Х .; Zeigler-Johnson, Charnita M .; Gueye, Serigne M .; Schurr, Theodore G .; Реббек, Тимоти Р. (2009), Релетфорд, Джон (редактор), «Оценка группового генетического происхождения популяций из Филадельфии и Дакара в контексте гендерно-предвзятого смешения в Америке», PLOS ONE, 4 (11): e7842, Bibcode:2009PLoSO ... 4.7842S, Дои:10.1371 / journal.pone.0007842, ЧВК  2776971, PMID  19946364
  9. Андерхилл, Питер А .; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А .; Джин, Ли; Пассарино, Джузеппе; Ян, Вэй Х .; Кауфман, Эрин; Бонне-Тамир, Батшева; и другие. (2000), "Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций", Природа Генетика, 26 (3): 358–61, Дои:10.1038/81685, PMID  11062480, S2CID  12893406
  10. Вуд, Элизабет Т; Стовер, Дарин А; Эрет, Кристофер; Дестро-Бизоль, Джованни; Спедини, Габриэлла; Маклеод, Ховард; Луи, Лесли; Бамшад, Майк; и другие. (2005), «Контрастные модели вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: данные о демографических процессах, обусловленных полом», Европейский журнал генетики человека, 13 (7): 867–76, Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201408, PMID  15856073

внешняя ссылка