MT-ND4L - MT-ND4L

ND4L
Идентификаторы
ПсевдонимыND4L, MTMT-NADH дегидрогеназа, субъединица 4L (комплекс I)
Внешние идентификаторыOMIM: 516004 MGI: 102497 ГомолоГен: 5021 Генные карты: ND4L
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

н / д

н / д

RefSeq (белок)

н / д

NP_904336

Расположение (UCSC)н / дChr M: 0,01 - 0,01 Мб
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Расположение MT-ND4L ген в митохондриальном геноме человека. MT-ND4L является одним из семи митохондриальных генов НАДН-дегидрогеназы (желтые прямоугольники).

MT-ND4L это ген из митохондриальный геном кодирование для НАДН-убихинон оксидоредуктаза цепь 4L (ND4L) белок.[4] Белок ND4L является субъединицей НАДН-дегидрогеназа (убихинон), который находится в митохондриальная внутренняя мембрана и является крупнейшим из пяти комплексов электронная транспортная цепь.[5] Варианты человеческого MT-ND4L связаны с повышенным ИМТ у взрослых и Наследственная оптическая невропатия Лебера (ЛХОН).[6][7]

Структура

В MT-ND4L Ген расположен в митохондриальной ДНК человека от 10 469 до 10765 пар оснований.[4][8] В MT-ND4L Ген продуцирует белок 11 кДа, состоящий из 98 аминокислот.[9][10] MT-ND4L - один из семи митохондриальных генов, кодирующих субъединицы фермента. НАДН-дегидрогеназа (убихинон), вместе с МТ-НД1, МТ-НД2, MT-ND3, МТ-НД4, MT-ND5, и MT-ND6. Также известный как Комплекс I, этот фермент является крупнейшим из респираторных комплексов. Конструкция Г-образная с длинным, гидрофобный трансмембранный домен и гидрофильный домен для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH. MT-ND4L и остальные субъединицы, кодируемые митохондриями, являются наиболее гидрофобными из субъединиц Комплекса I и образуют ядро ​​трансмембранной области.[5]

Необычная особенность человека MT-ND4L ген - 7-нуклеотидный перекрытие генов его последних трех кодонов (5'-CAA TGC TAA-3 'кодирование для Gln, Cys и Stop) с первыми тремя кодонами МТ-НД4 ген (5'-ATG CTA AAA-3 'кодирование аминокислот Met-Leu-Lys).[8] С уважением к MT-ND4L рамка чтения (+1), МТ-НД4 ген начинается в рамке считывания +3: [CAA] [TGC] [TAA] AA против CA [ATG] [CTA] [AAA].

Функция

Продукт MT-ND4L является субъединицей дыхательной цепи. Комплекс I который, как полагают, принадлежит к минимальному комплексу основных белков, необходимых для катализирования НАДН дегидрирование и перенос электронов к убихинон (Коэнзим Q10).[11] Первоначально, НАДН связывается с комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо из флавинмононуклеотид (ФМН) протез руки с образованием ФМНГ2. Электроны передаются через серию железо-серные (Fe-S) кластеры в протезе руки и, наконец, до коэнзима Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинол (CoQH2). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и pK сдвиг ионизируемой боковой цепи, который выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса.[5]

Клиническое значение

Митохондриальная дисфункция, вызванная вариантами MT-ND4L, МТ-НД1 и МТ-НД2 были связаны с ИМТ у взрослых и причастны к метаболическим нарушениям, включая ожирение, диабет и гипертонию.[6]

Известно, что мутация T> C в положении 10663 митохондриального гена MT-ND4L вызывает Наследственная оптическая невропатия Лебера (ЛХОН). Эта мутация приводит к замене аминокислоты валина на аланин в положении 65 белка ND4L, нарушая функцию Комплекс I в электронная транспортная цепь. Неизвестно, как эта мутация приводит к потере зрения у пациентов с LHON, но она может прерывать выработку АТФ из-за нарушения активности Комплекс I. Мутации в других генах, кодирующих субъединицы Комплекс I, включая МТ-НД1, МТ-НД2, МТ-НД4, MT-ND5, и MT-ND6 также известно, что они вызывают LHON.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000065947 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ а б «Ген Entrez: MT-ND4L субъединица 4L НАДН дегидрогеназы».
  5. ^ а б c Voet DJ, Voet JG, Pratt CW (2013). «Глава 18: Митохондриальный синтез АТФ». Основы биохимии (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN  978-0-47054784-7.
  6. ^ а б Flaquer A, Baumbach C, Kriebel J, Meitinger T, Peters A, Waldenberger M, Grallert H, Strauch K (2014). «Митохондриальные генетические варианты, идентифицированные как связанные с ИМТ у взрослых». PLOS ONE. 9 (8): e105116. Bibcode:2014PLoSO ... 9j5116F. Дои:10.1371 / journal.pone.0105116. ЧВК  4143221. PMID  25153900.
  7. ^ а б Ю-Вай-Ман П., Чиннери П. Ф. (1993). «Наследственная оптическая невропатия Лебера». PMID  20301353. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  8. ^ а б Homo sapiens митохондрия, полный геном. «Пересмотренная Кембриджская эталонная последовательность (rCRS): номер доступа NC_012920», Национальный центр биотехнологической информации. Проверено 30 января, 2016.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ «НАДН-убихинон оксидоредуктаза цепь 4L». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
  11. ^ «MT-ND4L - НАДН-убихинон оксидоредуктаза цепи 4L - Homo sapiens (Человек)». UniProt.org: центр информации о белках. Консорциум UniProt.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка