MT-ND6 - Википедия - MT-ND6
MT-ND6 это ген из митохондриальный геном кодирование для НАДН-убихинон оксидоредуктаза цепь 6 белок (ND6).[4] Белок ND6 является субъединицей НАДН-дегидрогеназа (убихинон), который находится в митохондриальная внутренняя мембрана и является крупнейшим из пяти комплексов электронная транспортная цепь.[5] Вариации в человеке MT-ND6 ген связаны с Синдром Ли, Наследственная оптическая нейропатия Лебера (LHON) и дистония.[6]
Структура
В MT-ND6 Ген расположен в митохондриальной ДНК человека от 14 149 до 14 673 пар оснований.[4] MT-ND6 - единственный ген, кодирующий белок, расположенный на L-цепи митогенома человека.[7]
Кодируемый белок имеет массу 18 кДа и состоит из 172 аминокислот.[8][9] MT-ND6 - один из семи митохондриальных генов, кодирующих субъединицы фермента. НАДН-дегидрогеназа (убихинон), вместе с МТ-НД1, МТ-НД2, MT-ND3, МТ-НД4, MT-ND4L, и MT-ND5. Также известный как Комплекс I, этот фермент является крупнейшим из респираторных комплексов. Конструкция Г-образная с длинным, гидрофобный трансмембранный домен и гидрофильный домен для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH. MT-ND6 и остальные субъединицы, кодируемые митохондриями, являются наиболее гидрофобными из субъединиц Комплекса I и образуют ядро трансмембранной области.[5]
Функция
Продукт MT-ND6 является субъединицей дыхательной цепи. Комплекс I который, как полагают, принадлежит к минимальному комплексу основных белков, необходимых для катализирования НАДН дегидрирование и перенос электронов к убихинон (Коэнзим Q10).[10] Первоначально, НАДН связывается с комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо из флавинмононуклеотид (ФМН) протез руки с образованием ФМНГ2. Электроны передаются через серию железо-серные (Fe-S) кластеры в протезе руки и, наконец, до коэнзима Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинол (CoQH2). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и pK сдвиг ионизируемой боковой цепи, который выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса.[5]
Клиническое значение
Мутация T → C в 14484 паре оснований в MT-ND6 ген был идентифицирован у людей с Наследственная оптическая нейропатия Лебера (ЛХОН). Этот общий MT-ND6 Мутация ответственна за около 14 процентов всех случаев LHON, и это самая частая причина этого расстройства среди людей франко-канадского происхождения. Эта мутация изменяет одну аминокислоту в белке НАДН-дегидрогеназы 6 в положении 64 с метионина на валин. Мутация T14484C связана с хорошим долгосрочным прогнозом; Люди с этим генетическим изменением имеют шанс некоторого восстановления зрения от 37 до 65 процентов. Исследователи изучают, как мутации в MT-ND6 ген приводит к Наследственная оптическая нейропатия Лебера. Эти генетические изменения, кажется, предотвращают Комплекс I от нормального взаимодействия с убихинон, что может повлиять на выработку АТФ, а также может увеличить производство в митохондриях потенциально вредных молекул, называемых активные формы кислорода (ROS). Однако остается неясным, почему эффекты этих мутаций часто ограничиваются нервом, который передает визуальную информацию от глаза к мозгу (зрительный нерв). Дополнительные генетические факторы и факторы окружающей среды, вероятно, способствуют потере зрения и другим медицинским проблемам, связанным с наследственной оптической невропатией Лебера.[6]
A G → A мутация в паре оснований 14459 в MT-ND6 ген также был обнаружен у небольшого числа людей с Синдром Ли, прогрессирующее заболевание мозга, которое обычно проявляется в младенчестве или раннем детстве. У больных детей может возникнуть рвота, припадки, отложенное развитие, мышечная слабость, и проблемы с движением. Сердечное заболевание, проблемы с почками, и затрудненное дыхание также может возникать у людей с этим заболеванием. Этот MT-ND6 Мутация G14459A заменяет аминокислоту аланин на аминокислоту валин в положении 72 белка в белке 6 цепи НАДН-убихинон оксидоредуктазы. Это генетическое изменение также было обнаружено у людей с LHON и двигательным расстройством, называемым дистония, который включает непроизвольные сокращения мышц, тремор и другие неконтролируемые движения. Эта мутация нарушает нормальную сборку или активность комплекс I в митохондриях. Однако неизвестно, как это MT-ND6 изменение гена связано с особенностями синдрома Ли, LHON или дистонии. Также остается неясным, почему одна мутация может вызывать такие разные признаки и симптомы у разных людей.[6]
Взаимодействия
MT-ND6 взаимодействует с железо-серным белком 3 НАДН-дегидрогеназы [убихинон] (NDUFS3 ) и АТФ-зависимый металлопротеиназа YME1L1.[4]
Рекомендации
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064368 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c «Ген Entrez: субъединица 6 НАДН-дегидрогеназы MT-ND6».
- ^ а б c Дональд Воет; Джудит Г. Воет; Шарлотта В. Пратт (2013). «18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN 9780470547847.
- ^ а б c «МТ-НД6». Домашний справочник по генетике. Национальная медицинская библиотека США. Получено 23 марта 2015.
- ^ Андерсон С., Банкир А.Т., Баррелл Б.Г., де Брюин М.Х., Колсон А.Р., Друин Дж., Эперон И.К., Нирлих Д.П., Роу Б.А., Сэнгер Ф., Шрайер П.Х., Смит А.Дж., Стаден Р., Янг И.Г. (апрель 1981 г.) «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Природа. 290 (5806): 457–65. Bibcode:1981Натура.290..457A. Дои:10.1038 / 290457a0. PMID 7219534. S2CID 4355527.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
- ^ «НАДН-убихинон оксидоредуктаза цепи 6». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
- ^ «MT-ND6 - НАДН-убихинон оксидоредуктаза цепи 6 - Homo sapiens (Human)». UniProt.org: центр информации о белках. Консорциум UniProt.
дальнейшее чтение
- Тарнопольский М., Мини Б., Робинсон Б., Шелдон К., Болес Р.Г. (август 2013 г.). «Тяжелый детский синдром Ли, связанный с редкой митохондриальной мутацией ND6, m.14487T> C». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 161A (8): 2020–3. Дои:10.1002 / ajmg.a.36000. PMID 23813926. S2CID 25888762.
- Торрони А., Ахилли А., Маколей В., Ричардс М., Бандельт Х. Дж. (Июнь 2006 г.). «Сбор плодов дерева мтДНК человека». Тенденции в генетике. 22 (6): 339–45. Дои:10.1016 / j.tig.2006.04.001. PMID 16678300.
- Johns DR, Neufeld MJ, Park RD (сентябрь 1992 г.). «Мутация митохондриальной ДНК ND-6, связанная с наследственной оптической невропатией Лебера». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 187 (3): 1551–7. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 90479-5. PMID 1417830.
- Марзуки С., Ноер А.С., Лертрит П., Тьягараджан Д., Капса Р., Уттанапхол П., Бирн Э. (декабрь 1991 г.). «Нормальные варианты митохондриальной ДНК человека и продукты трансляции: создание справочной базы данных». Генетика человека. 88 (2): 139–45. Дои:10.1007 / bf00206061. PMID 1757091. S2CID 28048453.
- Мораес С.Т., Андреетта Ф., Бонилла Э., Шанске С., ДиМауро С., Шон Э.А. (март 1991 г.). «Компетентная к репликации митохондриальная ДНК человека без промоторной области тяжелой цепи». Молекулярная и клеточная биология. 11 (3): 1631–7. Дои:10.1128 / MCB.11.3.1631. ЧВК 369459. PMID 1996112.
- Одзава Т., Танака М., Сугияма С., Ино Х, Оно К., Хаттори К., Обаяси Т., Ито Т., Дегучи Х., Кавамура К. (май 1991 г.). «Пациенты с идиопатической кардиомиопатией принадлежат к одному семейству генов митохондриальной ДНК болезни Паркинсона и митохондриальной энцефаломиопатии». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 177 (1): 518–25. Дои:10.1016 / 0006-291X (91) 92014-B. PMID 2043137.
- Чомин А., Клитер М.В., Рэган К.И., Райли М., Дулиттл Р.Ф., Аттарди Дж. (Октябрь 1986 г.). «URF6, последняя неопознанная рамка считывания мтДНК человека, кодирует субъединицу НАДН-дегидрогеназы». Наука. 234 (4776): 614–8. Bibcode:1986Наука ... 234..614C. Дои:10.1126 / science.3764430. PMID 3764430.
- Чомин А., Мариоттини П., Клитер М.В., Раган К.И., Мацуно-Яги А., Хатефи Ю., Дулиттл Р.Ф., Аттарди Г. (1985). «Шесть неопознанных рамок считывания митохондриальной ДНК человека кодируют компоненты НАДН-дегидрогеназы дыхательной цепи». Природа. 314 (6012): 592–7. Bibcode:1985Натура.314..592С. Дои:10.1038 / 314592a0. PMID 3921850. S2CID 32964006.
- Андерсон С., Банкир А.Т., Баррелл Б.Г., де Брюин М.Х., Колсон А.Р., Друин Дж., Эперон И.К., Нирлих Д.П., Роу Б.А., Сэнгер Ф., Шрайер П.Х., Смит А.Дж., Стаден Р., Янг И.Г. (апрель 1981 г.). «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Природа. 290 (5806): 457–65. Bibcode:1981Натура.290..457A. Дои:10.1038 / 290457a0. PMID 7219534. S2CID 4355527.
- Монтойя Дж., Охала Д., Аттарди Дж. (Апрель 1981 г.). «Отличительные особенности 5'-концевых последовательностей митохондриальных мРНК человека». Природа. 290 (5806): 465–70. Bibcode:1981Натура.290..465М. Дои:10.1038 / 290465a0. PMID 7219535. S2CID 4358928.
- Хораи С., Хаясака К., Кондо Р., Цугане К., Такахата Н. (январь 1995 г.). «Недавнее африканское происхождение современных людей выявлено с помощью полных последовательностей гоминоидных митохондриальных ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (2): 532–6. Bibcode:1995PNAS ... 92..532H. Дои:10.1073 / пнас.92.2.532. ЧВК 42775. PMID 7530363.
- Джун А.С., Браун, доктор медицины, Уоллес, округ Колумбия (июнь 1994 г.). «Мутация митохондриальной ДНК в паре нуклеотидов 14459 гена субъединицы 6 НАДН-дегидрогеназы, ассоциированная с наследственной по материнской линии наследственной оптической нейропатией Лебера и дистонией». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (13): 6206–10. Bibcode:1994PNAS ... 91.6206J. Дои:10.1073 / пнас.91.13.6206. ЧВК 44167. PMID 8016139.
- Де Фрис Д.Д., Вент Л.Н., Брюн Г.В., Схолте Х.Р., Хофстра Р.М., Болхуис П.А., ван Ост Б.А. (апрель 1996 г.). «Генетические и биохимические нарушения активности митохондриального комплекса I в семье с наследственной оптической нейропатией Лебера и наследственной спастической дистонией». Американский журнал генетики человека. 58 (4): 703–11. ЧВК 1914692. PMID 8644732.
- Лео-Коттлер Б., Крист-Адлер М., Бауманн Б., Зреннер Э., Виссинджер Б. (июль 1996 г.). «Наследственная оптическая нейропатия Лебера: клинические и молекулярно-генетические результаты, полученные в семье с новой точечной мутацией в положении нуклеотида 14498 в гене ND 6». Немецкий журнал офтальмологии. 5 (4): 233–40. PMID 8854108.
- Судойо Х., Ситепу М, Малик С., Поеспонегоро Х.Д., Марзуки С. (1999). «Наследственная оптическая нейропатия Лебера в Индонезии: две семьи с мутациями мтДНК 11778G> A и 14484T> C». Человеческая мутация. Приложение 1: S271-4. Дои:10.1002 / humu.1380110186. PMID 9452107.
- Besch D, Leo-Kottler B, Zrenner E, Wissinger B (сентябрь 1999 г.). «Наследственная оптическая нейропатия Лебера: клинические и молекулярно-генетические данные у пациента с новой мутацией в гене ND6». Архив Клинической и Экспериментальной Офтальмологии Грефе = Архив Клинических и Экспериментальных Офтальмологов Альбрехта фон Грефеса. 237 (9): 745–52. Дои:10.1007 / s004170050307. PMID 10447650. S2CID 25865564.
- Эндрюс Р.М., Кубака И., Чиннери П.Ф., Лайтаулерс Р.Н., Тернбулл Д.М., Хауэлл Н. (октябрь 1999 г.). «Повторный анализ и пересмотр кембриджской эталонной последовательности митохондриальной ДНК человека». Природа Генетика. 23 (2): 147. Дои:10.1038/13779. PMID 10508508. S2CID 32212178.
- Ingman M, Kaessmann H, Pääbo S, Gyllensten U (декабрь 2000 г.). «Вариации митохондриального генома и происхождение современного человека». Природа. 408 (6813): 708–13. Bibcode:2000Натура 408..708И. Дои:10.1038/35047064. PMID 11130070. S2CID 52850476.
- Чиннери П.Ф., Браун Д.Т., Эндрюс Р.М., Сингх-Клер Р., Риордан-Ева П., Линдли Дж., Эпплгарт Д.А., Тернбулл Д.М., Хауэлл Н. (январь 2001 г.). «Митохондриальный ген ND6 является горячей точкой для мутаций, вызывающих наследственную оптическую невропатию Лебера». Мозг. 124 (Pt 1): 209–18. Дои:10.1093 / мозг / 124.1.209. PMID 11133798.
- Finnilä S, Lehtonen MS, Majamaa K (июнь 2001 г.). «Филогенетическая сеть европейской мтДНК». Американский журнал генетики человека. 68 (6): 1475–84. Дои:10.1086/320591. ЧВК 1226134. PMID 11349229.
- Мака-Мейер Н., Гонсалес А.М., Ларруга Дж.М., Флорес С., Кабрера В.М. (2003). «Основные геномные митохондриальные линии определяют раннюю экспансию человека». BMC Genetics. 2: 13. Дои:10.1186/1471-2156-2-13. ЧВК 55343. PMID 11553319.
внешняя ссылка
- Масс-спектрометрическая характеристика MT-ND6 на COPaKB
- GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о митохондриальном ДНК-ассоциированном синдроме Ли и NARP
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.