Семейство гликозид гидролаз 2 - Википедия - Glycoside hydrolase family 2
| Семейство гликозилгидролаз 2, домен связывания сахара | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 е. coli (lacz), захваченный бета-галактозидазой промежуточный фермент 2-дезоксигалактозил | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_2_N | ||||||||
| Pfam | PF02837 | ||||||||
| Pfam клан | CL0202 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006104 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00531 | ||||||||
| SCOP2 | 1bgl / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH2 | ||||||||
| |||||||||
| Семейство гликозилгидролаз 2 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
е. coli (lacz), захваченный бета-галактозидазой промежуточный фермент 2-дезоксигалактозил | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_2 | ||||||||
| Pfam | PF00703 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006102 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00531 | ||||||||
| SCOP2 | 1bgl / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH2 | ||||||||
| |||||||||
| Семейство гликозилгидролаз 2, бочкообразный домен TIM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 человеческая бета-глюкуронидаза с разрешением 2,6 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_2_C | ||||||||
| Pfam | PF02836 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006103 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00531 | ||||||||
| SCOP2 | 1bgl / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH2 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии Семейство гликозид гидролаз 2 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 2[8] содержит ферменты с несколькими известными активностями: бета-галактозидаза (EC 3.2.1.23); бета-маннозидаза (EC 3.2.1.25); бета-глюкуронидаза (EC 3.2.1.31). Эти ферменты содержат консервативный остаток глутаминовой кислоты, который, как было показано,[9] в кишечная палочка lacZ (P00722), чтобы быть общим кислотно-основным катализатором в активном центре фермента.
Каталитический домен бета-галактозидаз имеет ТИМ ствол core окружало несколько других доменов, в основном бета-версий.[10] Сахарный связывающий домен этих белков имеет желейный рулет.[10] Эти ферменты также включают иммуноглобулин -подобно бета-бутерброд домен.[10]
внешняя ссылка
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 2». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Холка С. «Семейство гликозид гидролаз 2 (GH_2)». CAZypedia - углеводно-активные ферменты. Получено 2010-10-10.
- ^ Gebler JC, Aebersold R, Withers SG (июнь 1992 г.). «Glu-537, а не Glu-461, является нуклеофилом в активном центре (lac Z) бета-галактозидазы из Escherichia coli». Журнал биологической химии. 267 (16): 11126–30. PMID 1350782.
- ^ а б c Якобсон Р.Х., Чжан XJ, DuBose Р.Ф., Мэтьюз Б.В. (июнь 1994 г.). «Трехмерная структура бета-галактозидазы из E. coli». Природа. 369 (6483): 761–6. Bibcode:1994Натура.369..761J. Дои:10.1038 / 369761a0. PMID 8008071. S2CID 4241867.
