Семейство гликозид гидролаз 28 - Википедия - Glycoside hydrolase family 28
| Семейство гликозилгидролаз 28 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 рамногалактуроназа А из aspergillus aculeatus | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_28 | ||||||||
| Pfam | PF00295 | ||||||||
| Pfam клан | CL0268 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000743 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00415 | ||||||||
| SCOP2 | 1rmg / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH28 | ||||||||
| Мембранома | 73 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 28 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозидгидролаз 28 КАЗИ GH_28 содержит ферменты с несколькими известными активностями; полигалактуроназа (EC 3.2.1.15 ); экзо-полигалактуроназа (EC 3.2.1.67 ); экзо-полигалактуроназа (EC 3.2.1.82 ); рамногалактуроназа (ЭК не определена).
Полигалактуроназа (PG) (пектиназа)[8][9] катализирует случайный гидролиз 1,4-альфа-D-галактозидуроновых связей в пектате и других галактуронанах. У фруктов полигалактуроназа играет важную роль в клеточная стенка метаболизм во время созревания. У растений бактериальные патогены, такие как Эрвиния каротовора или же Ralstonia solanacearum (Pseudomonas solanacearum) и грибковые патогены, такие как Aspergillus niger, полигалактуроназа участвует в мацерация и мягкое гниение растительной ткани. Экзо-поли-альфа-D-галактуронозидаза (EC 3.2.1.82 ) (exoPG)[10] гидролизует пептическую кислоту с невосстанавливающего конца, высвобождая дигалактуронат. PG и exoPG имеют несколько областей сходства последовательностей и принадлежат к семейству 28 гликозилгидролаз.
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозидгидролаз 28». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Ruttkowski E, Labitzke R, Khanh NQ, Löffler F, Gottschalk M, Jany KD (сентябрь 1990 г.). «Клонирование и анализ последовательности ДНК кДНК полигалактуроназы из Aspergillus niger RH5344». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1087 (1): 104–6. Дои:10.1016 / 0167-4781 (90) 90130-т. PMID 2400785.
- ^ Хуанг Дж. Х., Шелл MA (июль 1990 г.). «Анализ последовательности ДНК pglA и механизма экспорта его продукта полигалактуроназы из Pseudomonas solanacearum». Журнал бактериологии. 172 (7): 3879–87. Дои:10.1128 / jb.172.7.3879-3887.1990. ЧВК 213369. PMID 2193922.
- ^ Он С.Ю., Коллмер А. (сентябрь 1990 г.). «Молекулярное клонирование, нуклеотидная последовательность и мутагенез обмена маркера гена pehX, кодирующего экзо-поли-альфа-D-галактуронозидазу, Erwinia chrysanthemi EC16». Журнал бактериологии. 172 (9): 4988–95. Дои:10.1128 / jb.172.9.4988-4995.1990. ЧВК 213154. PMID 2168372.
