Семейство гликозид гидролаз 3 - Википедия - Glycoside hydrolase family 3
| 3 N-концевой домен семейства гликозилгидролаз | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_3 | ||||||||
| Pfam | PF00933 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001764 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00621 | ||||||||
| SCOP2 | 1ex1 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH3 | ||||||||
| |||||||||
| C-концевой домен 3 семейства гликозилгидролаз | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура изофермента бета-d-глюканглюкогидролазы ячменя exo1 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_3_C | ||||||||
| Pfam | PF01915 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002772 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00621 | ||||||||
| SCOP2 | 1ex1 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 3 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению более 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 3 КАЗИ GH_3 содержит ферменты с рядом известных активностей; бета-глюкозидаза (EC 3.2.1.21); бета-ксилозидаза (EC 3.2.1.37 ); N-ацетил-бета-глюкозаминидаза (EC 3.2.1.52); глюкан-бета-1,3-глюкозидаза (EC 3.2.1.58 ); целлодекстриназа (EC 3.2.1.74 ); экзо-1,3-1,4-глюканаза (EC 3.2.1 ). Эти ферменты представляют собой двухдоменные глобулярные белки, которые N-гликозилированный на трех участках.[8]
внешняя ссылка
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Выпуск базы данных): D490–5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 3». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Варгезе Дж. Н., Хрмова М., Финчер Г. Б. (февраль 1999 г.). «Трехмерная структура экзогидролазы бета-D-глюкана ячменя, гликозилгидролазы семейства 3». Структура. 7 (2): 179–90. Дои:10.1016 / S0969-2126 (99) 80024-0. PMID 10368285.
