Семейство гликозид гидролаз 4 - Glycoside hydrolase family 4
| Семейство 4 гликозилгидролаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура 6-фосфо-бета-глюкозидазы из Thermotoga maritima при разрешении 2,55 ангстрем в тетрагональной форме с марганцем, НАД + и глюкозо-6-фосфатом | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_4 | ||||||||
| Pfam | PF02056 | ||||||||
| Pfam клан | CL0063 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001088 | ||||||||
| PROSITE | PDOC01027 | ||||||||
| SCOP2 | 1obb / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH4 | ||||||||
| |||||||||
| Семейство 4 С-концевой домен гликозилгидролазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_4C | ||||||||
| Pfam | PF11975 | ||||||||
| Pfam клан | CL0341 | ||||||||
| PROSITE | PDOC01027 | ||||||||
| SCOP2 | 1obb / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH4 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 4 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 4 CAZY GH_4 содержит ферменты с несколькими известными активностями; 6-фосфо-бета-глюкозидаза (EC 3.2.1.86 ); 6-фосфо-альфа-глюкозидаза (EC 3.2.1.122 ); альфа-галактозидаза (EC 3.2.1.22 ). 6-фосфо-альфа-глюкозидаза требует как НАД (H), так и двухвалентного металла (Mn2+, Fe2+, Co2+, или Ni2+) для деятельности.[8]
Внешние ссылки
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 4». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Томпсон Дж., Пикис А., Рувинов С.Б., Хенриссат Б., Ямамото Х., Секигучи Дж. (Октябрь 1998 г.). «Ген glvA Bacillus subtilis 168 кодирует металлоемкую, НАД (H) -зависимую 6-фосфо-альфа-глюкозидазу. Отнесение к семейству 4 суперсемейства гликозилгидролаз». Журнал биологической химии. 273 (42): 27347–56. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27347. PMID 9765262.
