Семейство гликозид гидролаз 44 - Википедия - Glycoside hydrolase family 44
| Семейство гликозидгидролаз 44 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_44 | ||||||||
| Pfam | PF12891 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| CAZy | GH44 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 44 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать в гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозидгидролаз 44 КАЗИ GH_44, ранее известная как семейство целлюлаз J, включает ферменты с эндоглюканаза EC 3.2.1.4 и ксилоглюканаза EC 3.2.1.151 виды деятельности. Общая структура ферментов этого семейства состоит из ТИМ-подобный ствол домен, бета-сэндвич-домен и активный сайт с двумя глютаминовая кислота остатки, все из которых являются консервативными между эндоглюканазами и ксилоглюканазами в семействе, с незначительными различиями.[8][9]
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозидгидролаз 44». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов». Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Китаго Ю., Карита С., Ватанабэ Н., Камия М., Айзава Т., Сакка К., Танака И. (декабрь 2007 г.). «Кристаллическая структура Cel44A, эндоглюканазы семейства 44 гликозидгидролаз из Clostridium thermocellum». Журнал биологической химии. 282 (49): 35703–11. Дои:10.1074 / jbc.M706835200. PMID 17905739.
- ^ Ариза А., Эклоф Дж. М., Спадиут О., Оффен В. А., Робертс С. М., Безенматтер В., Фриис Е. П., Скьёт М., Уилсон К. С., Брумер Г., Дэвис Г. (сентябрь 2011 г.). «Структура и активность ксилоглюканазы Paenibacillus polymyxa из семейства гликозидгидролаз 44». Журнал биологической химии. 286 (39): 33890–900. Дои:10.1074 / jbc.M111.262345. ЧВК 3190823. PMID 21795708.
