Семейство гликозид гидролаз 56 - Википедия - Glycoside hydrolase family 56
| Гиалуронидаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура гиалуронидазы пчелиного яда в комплексе с тетрамером гиалуроновой кислоты | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_56 | ||||||||
| Pfam | PF01630 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR018155 | ||||||||
| SCOP2 | 1fcv / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| OPM суперсемейство | 117 | ||||||||
| Белок OPM | 1fcq | ||||||||
| CAZy | GH56 | ||||||||
| Мембранома | 1078 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 56 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы ЕС 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать в гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводным и неуглеводным фрагментом. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозидгидролаз 56 КАЗИ GH_56 включает ферменты с гиалуронидаза ЕС 3.2.1.35 Мероприятия. Яд Apis mellifera (Медоносная пчела) содержит несколько биологически активных пептидов и два фермента, один из которых - гиалуронидаза.[8] Аминокислотная последовательность гиалуронидазы пчелиного яда содержит 349 аминокислот и включает четыре цистеина и ряд потенциальных сайтов гликозилирования.[8] Последовательность показывает высокую степень сходства с PH-20, a мембранный белок из млекопитающее сперма участвует в адгезии сперматозоидов, подтверждая мнение, что гиалуронидазы играют роль в оплодотворение.[8]
PH-20 необходим для прилипания сперматозоидов к яйцеклетке. zona pellucida; он расположен на обоих сперматозоидах плазматическая мембрана и акросомный мембрана.[9] Аминокислотная последовательность зрелого белка содержит 468 аминокислот и включает шесть потенциальных N-связанных гликозилирование сайтов и двенадцать цистеины, восемь из которых плотно сгруппированы около C-конца.[9]
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 56». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ а б c Gmachl M, Kreil G (1993). «Гиалуронидаза пчелиного яда гомологична мембранному белку сперматозоидов млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (8): 3569–3573. Bibcode:1993PNAS ... 90.3569G. Дои:10.1073 / пнас.90.8.3569. ЧВК 46342. PMID 7682712.
- ^ а б Латроп В.Ф., Кармайкл Е.П., Майлс Д.Г., Примакофф П. (1990). «Клонирование кДНК раскрывает молекулярную структуру белка поверхности сперматозоидов, PH-20, участвующего в адгезии сперматозоидов к яйцеклетке, и широкое распространение его гена среди млекопитающих». J. Cell Biol. 111 (6): 2939–2949. Дои:10.1083 / jcb.111.6.2939. ЧВК 2116349. PMID 2269661.
