Семейство гликозид гидролаз 6 - Википедия - Glycoside hydrolase family 6
| Семейство гликозилгидролаз 6 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_6 | ||||||||
| Pfam | PF01341 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001524 | ||||||||
| SCOP2 | 1cb2 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH6 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 6 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы ЕС 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать в гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводным и неуглеводным фрагментом. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 6 CAZY GH_6 содержит ферменты с несколькими известными активностями, включая эндоглюканаза (ЕС 3.2.1.4 ) и целлобиогидролаза (ЕС 3.2.1.91 ). Эти ферменты ранее были известны как семейство целлюлаз B. Трехмерная структура ферментативного ядра целлобиогидролазы II (CBHII) гриба Trichoderma reesei показывает альфа-бета-белок со складкой, подобной повсеместной бочкообразной топологии, впервые обнаруженной в триозофосфат изомераза.[8] Активный сайт CBHII расположен на С-конце параллельного бета-ствола в закрытом туннеле, через который целлюлоза потоки. Два аспарагиновая кислота остатки, расположенные в центре туннеля, являются вероятными каталитическими остатками.[8]
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Выпуск базы данных): D490–5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозидгидролаз 6». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов». Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ а б Rouvinen J, Bergfors T, Teeri T, Knowles JK, Jones TA (июль 1990 г.). «Трехмерная структура целлобиогидролазы II из Trichoderma reesei». Наука. 249 (4967): 380–6. Bibcode:1990Sci ... 249..380R. Дои:10.1126 / science.2377893. PMID 2377893.
