Семейство гликозид гидролаз 79 - Glycoside hydrolase family 79
| Семейство гликозилгидролаз 79, N-концевой домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_79n | ||||||||
| Pfam | PF03662 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR005199 | ||||||||
| CAZy | GH79 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 79 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозидгидролаз 79 включает эндо-бета-N-глюкуронидазу. EC 3.2.1.31 и гепараназа (КАЗИ GH_79 ). Гепарансульфатные протеогликаны (HSPG) играют ключевую роль в самосборке, нерастворимости и барьерных свойствах подвальные мембраны и внеклеточные матрицы. Следовательно, расщепление гепаран сульфат (HS) влияет на целостность и функциональное состояние тканей и, следовательно, на фундаментальные нормальные и патологические явления, включающие миграцию клеток и реакцию на изменения во внеклеточной микросреде. Гепараназа разрушает HS на определенных участках внутри цепи. Фермент синтезируется как латентный белок примерно 65 кДа, который обрабатывается в N-конец в высокоактивную форму приблизительно 50 кДа. Экспериментальные данные показывают, что гепараназа может способствовать как опухоль клеточная инвазия и неоваскуляризация, оба важнейших шага в прогрессировании рака. Фермент также участвует в миграции клеток, связанной с воспаление и аутоиммунитет.[8]
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Выпуск базы данных): D490–5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозидгидролаз 79». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов». Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. HDL:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. PMID 29040563.
- ^ Влодавский И., Гольдшмидт О., Зхария Э, Мецгер С., Чаек-шауль Т., Ацмон Р., Гуатта-рангини З., Фридман Ю. (2001). «Молекулярные свойства и участие гепараназы в прогрессировании рака и нормальном развитии». Биохимия. 83 (8): 831–839. Дои:10.1016 / S0300-9084 (01) 01318-9. PMID 11530216.
