Семейство предшественников микроРНК Мир-196 - Mir-196 microRNA precursor family

Семейство предшественников микроРНК mir-196
RF00256.jpg
Идентификаторы
Символмир-196
РфамRF00256
miRBaseMI0000238
Семейство miRBaseMIPF0000031
Прочие данные
РНК типГен; miRNA
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКSO: 0001244
PDB структурыPDBe

miR-196 это некодирующая РНК называется микроРНК что, как было показано, экспрессируется у людей (MI0000238[постоянная мертвая ссылка ], MI0000279 ) и мыши (MI0000552, MI0000553 ).[1][2] miR-196, по-видимому, представляет собой микроРНК, специфичную для позвоночных, и теперь она предсказана или экспериментально подтверждена для широкого круга видов позвоночных (MIPF0000031[постоянная мертвая ссылка ]). У многих видов miRNA, по-видимому, экспрессируется из межгенных регионов в кластерах генов HOX. В заколка для волос предшественники предсказываются на основе спаривания оснований и межвидовой консервации - их масштабы неизвестны. В этом случае зрелая последовательность вырезается из 5 'плеча шпильки.

Было высказано предположение, что редкий SNP (rs11614913 ), который перекрывает has-mir-196a2, как выяснилось, связан с немелкоклеточный рак легкого.[3]

дальнейшее чтение

Рекомендации

  1. ^ Lagos-Quintana M, Rauhut R, Meyer J, Borkhardt A, Tuschl T (2003). «Новые микроРНК от мыши и человека». РНК. 9 (2): 175–9. Дои:10.1261 / rna.2146903. ЧВК  1370382. PMID  12554859.
  2. ^ Лим LP, Гласнер ME, Yekta S, Burge CB, Bartel DP (2003). «Гены микроРНК позвоночных». Наука. 299 (5612): 1540. Дои:10.1126 / science.1080372. PMID  12624257.
  3. ^ Ху З, Чен Дж, Тянь Т, Чжоу Х, Гу Х, Сюй Л., Цзэн И, Мяо Р, Джин Г, Ма Х, Чен Й, Шен Х (2008). «Генетические варианты последовательностей miRNA и выживаемость при немелкоклеточном раке легкого». J Clin Invest. 118 (7): 2600–8. Дои:10.1172 / JCI34934. ЧВК  2402113. PMID  18521189.
  4. ^ Чжан XW, Пан С.Д., Фэн Ю.Л., Лю Дж.Б., Донг Дж., Чжан Ю.Х., Чен Дж.Г., Ху З.Б., Шэнь Х.В. (2011). «[Связь между генетическим полиморфизмом в предшественнике микроРНК и генетической предрасположенностью гепатоцеллюлярной карциномы]». Чжунхуа Ю Фан И Сюэ За Чжи. 45 (3): 239–43. PMID  21624236.
  5. ^ Жорж М (2011). «Долгий и извилистый путь от корреляции к причинности». Нат Жене. 43 (3): 180–1. Дои:10.1038 / ng0311-180. PMID  21350497.
  6. ^ Brest P, Lapaquette P, Souidi M, Lebrigand K, Cesaro A, Vouret-Craviari V, Mari B, Barbry P, Mosnier JF, Hébuterne X, Harel-Bellan A, Mograbi B, Darfeuille-Michaud A, Hofman P (2011) . «Синонимичный вариант IRGM изменяет сайт связывания для miR-196 и вызывает дерегуляцию IRGM-зависимой ксенофагии при болезни Крона». Нат Жене. 43 (3): 242–5. Дои:10,1038 / нг.762. PMID  21278745.
  7. ^ Чен С., Чжан И, Чжан Л., Уикли С.М., Яо Кью (2011). «MicroRNA-196: важнейшие роли и клиническое применение в развитии и раке». J Cell Mol Med. 15 (1): 14–23. Дои:10.1111 / j.1582-4934.2010.01219.x. ЧВК  3276076. PMID  21091634.
  8. ^ Scagnolari C, Zingariello P, Vecchiet J, Selvaggi C, Racciatti D, Taliani G, Riva E, Pizzigallo E, Antonelli G (2010). «Дифференциальная экспрессия интерферон-индуцированных микроРНК у пациентов с хронической инфекцией вируса гепатита С, получавших пегилированный интерферон альфа». Вирол Дж. 7: 311. Дои:10.1186 / 1743-422X-7-311. ЧВК  2996368. PMID  21070682.
  9. ^ Ли И, Чжан М., Чен Х, Донг З., Ганапати В., Тхангараджу М., Хуанг С. (2010). «Отношение miR-196 к матричной РНК HOXC8 коррелирует с миграцией клеток рака груди и метастазированием». Рак Res. 70 (20): 7894–904. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-10-1675. ЧВК  2955846. PMID  20736365.
  10. ^ Гуан Й, Мидзогути М., Ёсимото К., Хата Н., Шоно Т., Сузуки СО, Араки Ю., Куга Д., Накамидзо А., Амано Т., Ма Х, Хаяси К., Сасаки Т. (2010). «MiRNA-196 активируется в глиобластоме, но не в анапластической астроцитоме, и имеет прогностическое значение». Clin Cancer Res. 16 (16): 4289–97. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-0207. PMID  20601442.
  11. ^ Асли Н.С., Кессель М (2010). «Пространственно-временная ограниченная регуляция общих программ двигательных нейронов посредством miR-196-опосредованной репрессии Hoxb8». Дев Биол. 344 (2): 857–68. Дои:10.1016 / j.ydbio.2010.06.003. HDL:11858 / 00-001M-0000-0011-F056-2. PMID  20553899.
  12. ^ Schotte D, Lange-Turenhout EA, Stumpel DJ, Stam RW, Buijs-Gladdines JG, Meijerink JP, Pieters R, Den Boer ML (2010). «Экспрессия miR-196b не является исключительно управляемой MLL, но особенно связана с активацией генов HOXA при остром лимфобластном лейкозе у детей». Haematologica. 95 (10): 1675–82. Дои:10.3324 / haematol.2010.023481. ЧВК  2948092. PMID  20494936.
  13. ^ Хоу В., Тиан Кью, Чжэн Дж., Бонковски Х.Л. (2010). «МикроРНК-196 подавляет экспрессию белка Bach1 и гена вируса гепатита С в клетках гепатомы человека, экспрессирующих белки вируса гепатита С». Гепатология. 51 (5): 1494–504. Дои:10.1002 / hep.23401. ЧВК  2862129. PMID  20127796.
  14. ^ МакГлинн Э., Йекта С., Мэнсфилд Дж. Х., Соучек Дж., Бартель Д. П., Табин С. Джей (2009). «In ovo применение antagomiRs указывает на роль miR-196 в формировании паттерна осевого скелета цыпленка посредством регуляции гена Hox». Proc Natl Acad Sci U S A. 106 (44): 18610–5. Дои:10.1073 / pnas.0910374106. ЧВК  2773993. PMID  19846767.
  15. ^ Сехм Т., Саксе С., Френзель С., Эчеверри К. (2009). «miR-196 - важный регулятор регенерации хвоста на ранней стадии, предшествующий ключевым событиям формирования паттерна спинного мозга». Дев Биол. 334 (2): 468–80. Дои:10.1016 / j.ydbio.2009.08.008. PMID  19682983.
  16. ^ Попович Р., Рисбек Л. Е., Велу С. С., Чаубей А., Чжан Дж., Ахилле Н. Дж., Эрфурт Ф. Э., Итон К., Лу Дж., Граймс Г. Л., Чен Дж., Роули Д. Д., Железник-Ле Нью-Джерси (2009). «Регулирование mir-196b с помощью MLL и его сверхэкспрессия слиянием MLL способствует иммортализации». Кровь. 113 (14): 3314–22. Дои:10.1182 / кровь-2008-04-154310. ЧВК  2665896. PMID  19188669.
  17. ^ Sonkoly E, Ståhle M, Pivarcsi A (2008). «МикроРНК и иммунитет: новые игроки в регуляции нормальной иммунной функции и воспаления». Семин Рак Биол. 18 (2): 131–40. Дои:10.1016 / j.semcancer.2008.01.005. PMID  18291670.
  18. ^ Уолтеринг Дж. М., Дерстон А. Дж. (2008). «MiR-10 подавляет HoxB1a и HoxB3a у рыбок данио». PLoS ONE. 3 (1): e1396. Дои:10.1371 / journal.pone.0001396. ЧВК  2148072. PMID  18167555.
  19. ^ Ричардсон М.К., Кройманс Р.П., Гроенен М.А. (2007). «Секвенирование и геномная аннотация Hox кластеров курицы (Gallus gallus) и картирование эволюционно консервативных регионов». Cytogenet Genome Res. 117 (1–4): 110–9. Дои:10.1159/000103171. PMID  17675851.
  20. ^ Кавасаки Х., Тайра К. (2004). «МикроРНК-196 ингибирует экспрессию HOXB8 при миелоидной дифференцировке клеток HL60». Нуклеиновые кислоты Symp Ser (Oxf). 48 (48): 211–2. Дои:10.1093 / nass / 48.1.211. PMID  17150553.
  21. ^ Чопра VS, Мишра РК (2006). ""Мир "Акции в регуляции гена hox". BioEssays. 28 (5): 445–8. Дои:10.1002 / bies.20401. PMID  16615131.
  22. ^ Роншауген М., Биемар Ф., Пиль Дж., Левин М., Лай ЕС (2005). «МикроРНК iab-4 дрозофилы вызывает доминантную гомеотическую трансформацию жужжальцев в крылья». Genes Dev. 19 (24): 2947–52. Дои:10.1101 / gad.1372505. ЧВК  1315399. PMID  16357215.
  23. ^ Хорнштейн Э, Мэнсфилд Дж. Х., Йекта С., Ху Дж. К., Харф Б. Д., МакМанус М. Т., Баскервиль С., Бартель Д. П., Табин С. Дж. (2005). «МикроРНК miR-196 действует выше Hoxb8 и Shh в развитии конечностей». Природа. 438 (7068): 671–4. Дои:10.1038 / природа04138. PMID  16319892.
  24. ^ Yekta S, Shih IH, Bartel DP (2004). «МикроРНК-направленное расщепление мРНК HOXB8». Наука. 304 (5670): 594–6. Дои:10.1126 / science.1097434. PMID  15105502.

внешняя ссылка