Семейство предшественников микроРНК Мир-15 - Mir-15 microRNA precursor family
Семейство предшественников микроРНК mir-15 | |
---|---|
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности Мир-15 | |
Идентификаторы | |
Символ | мир-15 |
Рфам | RF00455 |
miRBase | MI0000069 |
Семейство miRBase | MIPF0000006 |
Прочие данные | |
РНК тип | Ген; miRNA |
Домен (ы) | Эукариоты |
ИДТИ | Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: |
ТАК | SO: 0001244 |
PDB структуры | PDBe |
В miR-15 микроРНК семейство предшественников состоит из маленьких некодирующая РНК гены, регулирующие экспрессию генов. Семейство включает родственные последовательности mir-15a и mir-15b, а также miR-16-1, miR-16-2, miR-195 и miR-497. Эти шесть высококонсервативных miRNA сгруппированы в трех отдельных хромосомах.[1] У человека miR-15a и miR-16 сгруппированы в пределах 0,5 килобаз в положении 13q14 хромосомы.[2] Было обнаружено, что этот регион чаще всего страдает хронический лимфолейкоз (ХЛЛ), с удалением всего региона более чем в половине случаев. Таким образом, как miR-15a, так и miR-16 часто делетируются или подавляются в образцах CLL с делециями 13q14; встречается более чем в двух третях случаев ХЛЛ.[3] Экспрессия miR-15a связана с выживаемостью при тройном отрицательном раке молочной железы.[4]
Было показано, что делеция miR-15a / 16-1 ускоряет распространение B-клеток как человека, так и мыши путем модуляции экспрессии генов, контролирующих развитие клеточного цикла.[5] Исследования показали, что кластер микроРНК miR-15a / 16-1 действует как опухолевый супрессор, при этом онкоген BCL2 в качестве цели.[6] В частности, miR-15a / 16-1 подавляет экспрессию BCL2 и сама удаляется или подавляется в опухолевых клетках.[7] Наблюдается заметное увеличение уровней BCL2, наблюдаемое в случаях прогрессирующей опухоли простаты, что обратно коррелирует с экспрессией miR-15a / 16-1 (и поэтому соответствует снижению уровней miR-15a / 16-1). Ингибирование пролиферации клеток кластером miR-15a / 16-1 происходит как в лимфоидной, так и нелимфоидной ткани.[6]
Кроме того, было обнаружено, что кластер miR-15a / 16-1 высоко экспрессируется в CD5 + -клетках, что указывает на важную роль miR-15/16 в нормальных CD5 + B-клетках. гомеостаз.[3]
ЧЕК1
В ЧЕК1 Ген (контрольная точка киназы 1), расположенный в позиции хромосомы 11q24.2, отвечает за кодирование протеинкиназы Chk1.[8] Chk1, в свою очередь, фосфорилирует фосфатазу, участвующую в контроле клеточного цикла. Он опосредует клеточный ответ на ошибки репликации ДНК, а также играет важную роль в предотвращении генетической нестабильности. Повышенный ЧЕК1 Было обнаружено, что уровни согласуются с отсутствием miR-15a / 16-1 у мышей.[1] Постнатальная индукция семейства miR-15 опосредует инактивацию онтогенеза ЧЕК1 после рождения. Эта инактивация была определена как возможный фактор, способствующий возникновению кардиомиоцитов. двухъядерный в неонатальный период.[1]
Остановка кардиомиоцитов новорожденных
В постнатальном развитии сердца происходит активация множества членов семейства miR-15. В частности, miR-195, обнаруженный на более высоких уровнях, чем обычно, в развивающемся сердце, был идентифицирован как фактор, который может вызвать сердечные аномалии у новорожденных.[1] Это было связано с преждевременной остановкой клеточного цикла из-за нарушения пролиферации волокон сердечной мышцы и подавления экспрессии митотических генов.[9] Накопление волокон сердечной мышцы приводит к последующему блоку перехода между премитотическая / фаза G2 и митотическая фаза клеточного цикла с постнатальным ингибированием семейства miR-15, побуждающим волокна сердечной мышцы вступать в митоз. Сверхэкспрессия miR-195 также связана с клеточным гипертрофия.[10]
Рекомендации
- ^ а б c d Porrello ER, Johnson BA, Aurora AB, Simpson E, Nam YJ, Matkovich SJ, et al. (2011). «Семейство MiR-15 регулирует постнатальную остановку митоза кардиомиоцитов». Circ Res. 109 (6): 670–9. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.111.248880. ЧВК 3167208. PMID 21778430.
- ^ Лагос-Кинтана М, Раухут Р., Лендекель В., Тушл Т. (2001). «Идентификация новых генов, кодирующих малые экспрессированные РНК». Наука. 294 (5543): 853–8. Дои:10.1126 / science.1064921. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-F65F-2. PMID 11679670.
- ^ а б Калин Г.А., Думитру С.Д., Шимицу М., Бичи Р., Зупо С., Ноч Э. и др. (2002). «Частые делеции и подавление микро-РНК генов miR15 и miR16 в 13q14 при хроническом лимфолейкозе». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (24): 15524–9. Дои:10.1073 / pnas.242606799. ЧВК 137750. PMID 12434020.
- ^ Ланцки, Андраш; Надь, Адам; Боттаи, Джулия; Мункачи, Дьёнджи; Сабо, Андраш; Сантарпиа, Либеро; Дьёрфи, Балаж (01.12.2016). «miRpower: веб-инструмент для проверки миРНК, связанных с выживанием, с использованием данных экспрессии от 2178 пациентов с раком груди». Исследования и лечение рака груди. 160 (3): 439–446. Дои:10.1007 / s10549-016-4013-7. ISSN 1573-7217. PMID 27744485.
- ^ Klein U, Lia M, Crespo M, Siegel R, Shen Q, Mo T и др. (2010). «Кластер DLEU2 / miR-15a / 16-1 контролирует пролиферацию В-клеток, а его делеция приводит к хроническому лимфолейкозу». Раковая клетка. 17 (1): 28–40. Дои:10.1016 / j.ccr.2009.11.019. PMID 20060366.
- ^ а б Bonci D, Coppola V, Musumeci M, Addario A, Giuffrida R, Memeo L и др. (2008). «Кластер miR-15a-miR-16-1 контролирует рак простаты, воздействуя на несколько онкогенных активностей». Нат Мед. 14 (11): 1271–7. Дои:10,1038 / нм. 1880. PMID 18931683.
- ^ Акейлан Р.И., Калин Г.А., Кроче С.М. (2010). «miR-15a и miR-16-1 в раке: открытие, функции и перспективы на будущее». Разница в гибели клеток. 17 (2): 215–20. Дои:10.1038 / cdd.2009.69. PMID 19498445.
- ^ Санчес И., Вонг С., Тома Р.С., Ричман Р., Ву З., Пивница-Вормс Х. и др. (1997). «Сохранение пути контрольной точки Chk1 у млекопитающих: связь повреждения ДНК с регуляцией Cdk через Cdc25». Наука. 277 (5331): 1497–501. Дои:10.1126 / science.277.5331.1497. PMID 9278511.
- ^ Боттинг К.Дж., Ван К.С., Падхи М., Макмиллен И.К., Саммерс-Пирс Б., Раттанатрей Л. и др. (2011). «Раннее происхождение сердечных заболеваний: низкая масса тела при рождении и детерминанты наличия кардиомиоцитов». Clin Exp Pharmacol Physiol. 39 (9): 814–823. Дои:10.1111 / j.1440-1681.2011.05649.x. PMID 22126336.
- ^ Чен Х., Унтиверос Г.М., Макки Л.А., Перес Дж., Ли Дж., Антин П.Б. и др. (2012). «Микро-РНК-195 и -451 регулируют сигнальную ось LKB1 / AMPK путем нацеливания на MO25». PLoS ONE. 7 (7): e41574. Дои:10.1371 / journal.pone.0041574. ЧВК 3402395. PMID 22844503.
дальнейшее чтение
- Финнерти Дж. Р., Ван В. X., Эбер С. С., Уилфред Б. Р., Мао Дж., Нельсон П. Т. (август 2010 г.). "Группа генов микроРНК miR-15/107: эволюционная биология, клеточные функции и роль в заболеваниях человека". Дж Мол Биол. 402 (3): 491–509. Дои:10.1016 / j.jmb.2010.07.051. ЧВК 2978331. PMID 20678503.
- Чиммино А., Калин Г.А., Фаббри М. и др. (Сентябрь 2005 г.). «miR-15 и miR-16 вызывают апоптоз, воздействуя на BCL2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (39): 13944–9. Дои:10.1073 / pnas.0506654102. ЧВК 1236577. PMID 16166262.
- Паламарчук А., Ефанов А., Назарян Н. и др. (Май 2010 г.). «Делеции 13q14 в ХЛЛ связаны с взаимодействующими опухолевыми супрессорами». Кровь. 115 (19): 3916–22. Дои:10.1182 / кровь-2009-10-249367. ЧВК 2869560. PMID 20071661.
- Акейлан Р.И., Калин Г.А., Кроче С.М. (февраль 2010 г.). «miR-15a и miR-16-1 в раке: открытие, функции и перспективы на будущее». Разница в гибели клеток. 17 (2): 215–20. Дои:10.1038 / cdd.2009.69. PMID 19498445.
- Гуо CJ, Пан Q, Ли Д.Г., Сунь Х., Лю Б.В. (апрель 2009 г.). «miR-15b и miR-16 участвуют в активации звездчатых клеток печени крысы: важная роль в апоптозе». J. Hepatol. 50 (4): 766–78. Дои:10.1016 / j.jhep.2008.11.025. PMID 19232449.
- Ся Л., Чжан Д., Ду Р и др. (Июль 2008 г.). «miR-15b и miR-16 модулируют множественную лекарственную устойчивость, воздействуя на BCL2 в клетках рака желудка человека». Int. J. Рак. 123 (2): 372–9. Дои:10.1002 / ijc.23501. PMID 18449891.
внешняя ссылка
- Страница семейства предшественников микроРНК mir-15 в Рфам
- miRBase запись MI0000069
- запись miRBaseMI0000438