Мир-433 - Mir-433

мир-433
МиР-433 вторичная структура.png
Вторичная структура микроРНК miR-433 и сохранение последовательности
Идентификаторы
Символмир-433
РфамRF00748
Семейство miRBaseMIPF0000177
NCBI Gene574034
HGNC32026
OMIM611711
Прочие данные
РНК типмикроРНК
Домен (ы)Эукариоты; Евтерия;
PDB структурыPDBe

В молекулярной биологии мир-433 короткий некодирующая РНК молекула. МикроРНК (miRNA) функционируют как посттранскрипционные регуляторы уровней экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов.[1] Они играют роль в развитии, метаболизме и канцерогенезе.[2]

Геномная структура и регуляция

Мир-433 - одна из 21 миРНК, обнаруженных в кластере на хромосоме 12.[3]

3'-кодирующая область mir-433 также является промотором соседнего гена miRNA: мир-127.[3] Два гена перекрываются и транскрибируются в одной ориентации.[2] Это метод компактного и эффективного хранения генетической информации.[2]

Мир-433, наряду с другими двадцатью генами в кластере, активируется в малый гетеродимерный партнер (SHP) гомозиготные нокаутные мыши.[3]

SHP - это ядерный рецептор, который, как известно, подавляет транскрипцию, и он играет роль в некоторых метаболических заболеваниях. Напротив, транскрипция mir-433, как было показано, активируется посредством рецептор, связанный с эстрогеном (ERR).[3]

Мир-433 является высококонсервативным для всех видов, будучи на 95% похожим у человека, шимпанзе, лошади, собаки, обезьяны, крысы, коровы и мыши.[4] Расстояние между миром-433 и мир-127 у этих видов также было одинаковым; как и позиционирование мотивы связывания факторов транскрипции, в том числе для ERR. Это указывает на то, что регуляция гена, а также первичная последовательность консервативны у этих видов млекопитающих.

Также предполагается, что mir-433 и mir-127, вероятно, произошли от общего предкового гена.[4]

Ассоциация болезней

Было обнаружено, что уровни МИР-433 повышены в рак желудка, путем исследования с геном miRNA микрочипы. Мир-433 регулирует экспрессию GRB2, известный ассоциированный с опухолью белок, который может быть объяснением этой ассоциации.[5]

Подобной связи между вариантом МИР-433 и болезнь Паркинсона [6] несмотря на то, что вариация в области FGF20 ген, который связывается с mir-433, связан с болезнью Паркинсона.

Мир-433 также был связан с доминантно наследуемой формой хондродисплазии, связанной с хондродисплазией.[7] Мир-433 в норме подавляет экспрессию HDAC6. А однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в 3 ′ непереведенный регион (UTR) HDAC6 расщепляется с хондродисплазией. Этот SNP устраняет способность mir-433 подавлять HDAC6, что приводит к его сверхэкспрессии. Следовательно, уменьшается ацетилирование своей цели, альфа-тубулин, вызывая болезнь.[7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Каллен BR (декабрь 2004 г.). «Транскрипция и процессинг предшественников микроРНК человека». Мол. Клетка. 16 (6): 861–865. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.12.002. PMID  15610730.
  2. ^ а б c Песня G, Ван Л. (2008). Вольф Дж (ред.). «MiR-433 и miR-127 возникают из независимых перекрывающихся первичных транскриптов, кодируемых локусом miR-433-127». PLoS ONE. 3 (10): e3574. Дои:10.1371 / journal.pone.0003574. ЧВК  2570487. PMID  18974780.
  3. ^ а б c d Песня G, Ван Л. (2008). "Механизм транскрипции парных генов miR-433 и miR-127 ядерными рецепторами SHP и ERRgamma". Нуклеиновые кислоты Res. 36 (18): 5727–5735. Дои:10.1093 / nar / gkn567. ЧВК  2566885. PMID  18776219.
  4. ^ а б Песня G, Ван L (2009). Тора Л. (ред.). «Консервативная структура гена и регуляция экспрессии miR-433 и miR-127 у млекопитающих». PLoS ONE. 4 (11): e7829. Дои:10.1371 / journal.pone.0007829. ЧВК  2778354. PMID  19946636.
  5. ^ Ло Х, Чжан Х, Чжан З, Чжан Х, Нин Б., Го Дж, Ни Н, Лю Б., Ву Х (2009). «Пониженная регуляция miR-9 и miR-433 в карциноме желудка человека». J Exp Clin Cancer Res. 28 (1): 82. Дои:10.1186/1756-9966-28-82. ЧВК  2739520. PMID  19531230.
  6. ^ де Мена Л., Кардо Л. Ф., Кото Е., Миар А., Дас М., Корао А. И., Алонсо Б., Рибакоба Р., Сальвадор С., Менендес М., Морос Г., Альварес В. (2010). «Вариация SNP FGF20 rs12720208 и микроРНК-433: нет связи с болезнью Паркинсона у испанских пациентов». Neurosci Lett. 479 (1): 22–25. Дои:10.1016 / j.neulet.2010.05.019. PMID  20471450.
  7. ^ а б Саймон Д., Лалу Б., Бариллот М., Барнече Т., Бланшар С., Рорик С., Марке М., Бургелин I, Купри I, Чассен Н., Жильбер-Дюссардье Б., Лакомб Д., Гроссет С., Арвейлер Б. (2010). «Мутация в 3'-UTR гена HDAC6, устраняющая посттранскрипционную регуляцию, опосредованную hsa-miR-433, связана с новой формой доминантной Х-сцепленной хондродисплазии». Хум Мол Генет. 19 (10): 2015–2027. Дои:10.1093 / hmg / ddq083. PMID  20181727.

внешняя ссылка