Мир-127 - Википедия - mir-127
мир-127 | |
---|---|
Вторичная структура микроРНК miR-127 и сохранение последовательности | |
Идентификаторы | |
Символ | мир-127 |
Рфам | RF00676 |
Семейство miRBase | MIPF0000080 |
NCBI Gene | 406914 |
HGNC | 31509 |
OMIM | 611709 |
Прочие данные | |
РНК тип | микроРНК |
Домен (ы) | Эукариоты; |
PDB структуры | PDBe |
mir-127 микроРНК короткий некодирующая РНК молекула с интересной перекрывающейся структурой генов. miR-127 регулирует уровни экспрессии генов, участвующих в развитии легких, формировании плаценты и апоптоз. Аберрантная экспрессия miR-127 была связана с различными видами рака.
Структура гена
pri-miR-127 происходит из отдельного, но перекрывающегося кластера консервативных генов, кодирующего miR-433/127. miR-127 и miR-433 перекрываются в направлении 5'-3 '.[1] Хотя локусы можно найти на разных хромосомах у разных видов, структура сохранилась. У млекопитающих, включая человека, шимпанзе, лошадь, собаку, обезьяну, крысу, корову и мышь, множественное выравнивание последовательностей (MSA) между miR-433 и miR127 показали 95-100% сходства с сохраненным расстоянием между miR-433 и miR-127 от 986 до 1007 п.н. Более того, вышестоящие элементы ответа в промоторах miR-433/127, включая элемент ответа рецепторов, связанных с эстрогеном (ERRE), были законсервированы среди вышеуказанных видов. Данные предполагают, что локусы miR-433/127, возможно, произошли от общего гена происхождения.[2]
Регулирование транскрипции
Сайты связывания факторов транскрипции, расположенные выше предшественника miRNA, играют роль в регуляции транскрипции. Активация промоторов miR-127 и miR-433 опосредуется гамма-рецептор, связанный с эстрогеном (ERRgamma, NR3B3), которые физически связываются с их эндогенными промоторами. Торможение регулируется Малый гетеродимерный партнер (SHP), который действует в транс.[3] Хотя miR-127 и miR-433 имеют общие регуляторные элементы, у них есть независимые промоторы, и наблюдается их дифференциальный паттерн экспрессии.[4]
Функциональные роли
Подавление импринтированного гена Rtl1
Rtl1 является ключевым геном в формировании плаценты, а потеря или сверхэкспрессия Rlt1 привели к поздней эмбриональной или неонатальной летальности у мышей.[5] miR-127 располагается рядом с островками CpG в импринтированной области, кодирующей rtl1, и обычно транскрибируется в антисмысловой ориентации по отношению к гену. Эктопическая экспрессия miR-127 приводила к снижению экспрессии Rtl1 в клетках Hela человека и Heppa-1 мыши.
Эксперименты, проведенные на мышах, показали, что Rtl1 транскрибируется только с отцовской хромосомы, тогда как материнский аллель деградирует. miR-127 и miR-136, однако, только матерински экспрессируются в соматических клетках и, таким образом, играют роль в антисмысловой регуляции импринтинга Rtl1. Статус аберрантного метилирования Rtl1 и miR-127 показал, что эпигенетическое программирование также участвует в процессе.[2]
Контроль развития легких плода
miR-127 высоко экспрессируется на поздних стадиях развития плода. Нарушение системы за счет сверхэкспрессии miR-127 в системе культивирования органов легких плода приводит к дефектному развитию, что проявляется в снижении количества терминальных зачатков и различного размера зачатков.[6]
Роль в болезни
Диффузная В-клеточная лимфома большого размера
Активная регуляция miR-127 вызывала подавление Белок В-клеточной лимфомы 6, протоонкоген, который обычно гипермутируется в диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLCL).[7][8] Более того, дифференциальная экспрессия miR-127 была обнаружена в разных типах DLCL. Уровни miR-127 были значительно выше в DLCL яичек по сравнению с DLCL узловой и центральной нервной системы, подразумевая различную биологическую сущность DLCL в разных местах.[9]
Гепатоцеллюлярная карцинома
Ингибирование экспрессии miR-127 связано с гепатоцеллюлярной карциномой. Механистическая связь была подтверждена изменением белка BCL6, на который нацелен miR-127.[10]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Песня G, Ван Л. (2008). Вольф, Жан-Николя (ред.). «MiR-433 и miR-127 возникают из независимых перекрывающихся первичных транскриптов, кодируемых локусом miR-433-127». PLoS ONE. 3 (10): e3574. Дои:10.1371 / journal.pone.0003574. ЧВК 2570487. PMID 18974780.
- ^ а б Песня G, Ван L (2009). Тора, Ласло (ред.). «Консервативная структура гена и регуляция экспрессии miR-433 и miR-127 у млекопитающих». PLoS ONE. 4 (11): e7829. Дои:10.1371 / journal.pone.0007829. ЧВК 2778354. PMID 19946636.
- ^ Ван Л., Лю Дж., Саха П. и др. (Октябрь 2005 г.). «Орфанный ядерный рецептор SHP регулирует экспрессию PGC-1alpha и выработку энергии в коричневых адипоцитах». Cell Metab. 2 (4): 227–38. Дои:10.1016 / j.cmet.2005.08.010. PMID 16213225.
- ^ Сонг Джи, Ван Л (октябрь 2008 г.). "Механизм транскрипции парных генов miR-433 и miR-127 ядерными рецепторами SHP и ERRgamma". Нуклеиновые кислоты Res. 36 (18): 5727–35. Дои:10.1093 / nar / gkn567. ЧВК 2566885. PMID 18776219.
- ^ Секита Ю., Вагацума Х., Накамура К. и др. (Февраль 2008 г.). «Роль импринтированного гена, полученного из ретротранспозона, Rtl1, в фето-материнском интерфейсе плаценты мыши». Nat. Genet. 40 (2): 243–8. Дои:10.1038 / нг.2007.51. PMID 18176565.
- ^ Бхаскаран М., Ван И, Чжан Х и др. (Май 2009 г.). «МикроРНК-127 модулирует развитие легких плода». Physiol. Геномика. 37 (3): 268–78. Дои:10.1152 / физиолгеномика.90268.2008. ЧВК 2685501. PMID 19439715.
- ^ Лу Дж., Гетц Дж., Миска Е.А. и др. (Июнь 2005 г.). «Профили экспрессии микроРНК классифицируют рак человека». Природа. 435 (7043): 834–8. Дои:10.1038 / природа03702. PMID 15944708.
- ^ Сайто Ю., Лян Дж., Эггер Дж. И др. (Июнь 2006 г.). «Специфическая активация микроРНК-127 с подавлением протоонкогена BCL6 лекарствами, модифицирующими хроматин, в раковых клетках человека». Раковая клетка. 9 (6): 435–43. Дои:10.1016 / j.ccr.2006.04.020. PMID 16766263.
- ^ Робертус Дж. Л., Хармс Дж., Блокзейл Т. и др. (Апрель 2009 г.). «Специфическая экспрессия miR-17-5p и miR-127 в диффузной большой B-клеточной лимфоме яичек и центральной нервной системы». Мод. Патол. 22 (4): 547–55. Дои:10.1038 / modpathol.2009.10. PMID 19287466.
- ^ Трындяк В.П., Росс С.А., Беланд Ф.А., Погрибный И.П. (июнь 2009 г.). «Подавление микроРНК miR-34a, miR-127 и miR-200b в печени крыс во время гепатоканцерогенеза, индуцированного диетой с дефицитом метил» (PDF). Мол. Канцероген. 48 (6): 479–87. Дои:10.1002 / mc.20484. PMID 18942116.
дальнейшее чтение
- Сайто Ю., Лян Дж., Эггер Дж., Фридман Дж. М., Чуанг Дж. К., Кутзи Г. А., Джонс П. А. (2006). «Специфическая активация микроРНК-127 с подавлением протоонкогена BCL6 лекарствами, модифицирующими хроматин, в раковых клетках человека». Раковая клетка. 9 (6): 435–43. Дои:10.1016 / j.ccr.2006.04.020. PMID 16766263.
- Цуй XS, Чжан Д.X., Ко Ю.Г., Ким NH (2009). «Аберрантное эпигенетическое репрограммирование импринтированной микроРНК-127 и Rtl1 в клонированных эмбрионах мыши». Biochem Biophys Res Commun. 379 (2): 390–4. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.12.148. PMID 19126398.
- Чжан Ц., Ван Ц., Чен Икс, Ян Ц., Ли К., Ван Дж., Дай Дж, Ху З, Чжоу Х, Чен Л., Чжан И, Ли И, Цю Х, Син Дж, Лян З, Рен Б., Ян Ц. , Дзен К., Чжан К.Ю. (декабрь 2010 г.). «Профиль экспрессии микроРНК в сыворотке: отпечаток пальца на плоскоклеточный рак пищевода». Clin. Chem. 56 (12): 1871–9. Дои:10.1373 / Clinchem.2010.147553. PMID 20943850.