Хоризмат-лиаза - Chorismate lyase

В энзимология, а хоризмат-лиаза (EC 4.1.3.40 ) является фермент который катализирует то химическая реакция

хоризматировать ${ displaystyle rightleftharpoons}$ 4-гидроксибензоат + пируват

Реакция, катализируемая хоризматпируватлиазой (CPL).

Следовательно, у этого фермента есть один субстрат, хоризматировать, и два товары, 4-гидроксибензоат и пируват.

Этот фермент принадлежит к семейству лиасы в частности оксо-кислот-лиазы, которые расщепляют углерод-углеродные связи. В систематическое название этого класса ферментов хоризмат пируват-лиаза (образующая 4-гидроксибензоат). Другие широко используемые имена включают CL, CPL, и UbiC.

Этот фермент катализирует первый шаг в биосинтез убихинона, удаление пирувата из хоризмата с получением 4-гидроксибензоата в кишечная палочка и другие Грамотрицательный бактерии.^[1] Для его деятельности не требуется металл. кофакторы.^[2]

Мероприятия^[3]

Хоризмат-лиаза
хоризматлиаза с продуктом, разрешение 1.0
Идентификаторы
Символ	Чор_лясе
Pfam	PF04345
Pfam клан	CL0122
ИнтерПро	IPR007440
SCOP2	1jd3 / Объем / СУПФАМ
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Каталитическая активность

• Хоризмат = 4HB + пируват^[4]
• Этот фермент имеет оптимальный pH 7,5.

Ферментативная активность

Тормозится:

• Ванилат
• 4-гидроксибензальдегид
• 3-карбоксилметиламинметил-4-гидроксибензойная кислота
• 4HB - ubiC ингибируется продуктом реакции, который, по мнению ученых, служит механизмом контроля этого пути.

Путь

Используемый путь называется путем биосинтеза убихинона, он катализирует первый этап биосинтеза убихинона в E. coli. Убихинон - это жирорастворимый кофермент, переносящий электроны. Они являются важными переносчиками электронов у прокариот и необходимы аэробным организмам для выработки АТФ.[1]

Номенклатура^[3]

Есть несколько разных названий хоризматлиазы. ее также называют хоризматпируватлиазой (образующей 4-гидроксибензоат), и ее также сокращают несколькими разными способами: CPL, CL и ubiC. Иногда его называют ubiC, потому что это название гена. Этот фермент относится к классу лиаз; более конкретно, окс-кислот-лиаза или углерод-углерод-лиаза.

• • таксономическая линия: бактерии → протеобактерии → гаммапротеобактерии → энтеробактерии → энтеробактерии → эшерихии → escherichia coli

Структура^[3]

Этот фермент является мономером. Его вторичная структура содержит спирали, витки и бета-нити.

• Он имеет массу 18 777 дальтон.
• Его последовательность составляет 165 аминокислот.

Участок связывания

• позиция: 35 (М)
• позиция: 77 (R)
• позиция: 115 (L)

Мутагенез^[3]

• положение: 91- G → A; увеличивает ингибирование продукта на 40%. Не влияет на сродство к субстрату.
• позиция: 156 - E → K; потеря активности

Рекомендации

дальнейшее чтение

• Николс Б.П., Грин Дж. М. (1992). «Клонирование и секвенирование ubiC Escherichia coli и очистка хоризматлиазы». J. Bacteriol. 174 (16): 5309–16. Дои:10.1128 / jb.174.16.5309-5316.1992. ЧВК  206367. PMID  1644758.
• Зиберт М., Северин К., Хайде Л. (1994). «Образование 4-гидроксибензоата в Escherichia coli: характеристика гена ubiC и кодируемого им фермента хоризмат-пируват-лиаза». Микробиология. 140 (4): 897–904. Дои:10.1099/00221287-140-4-897. PMID  8012607.
• Меганатан Р. (2001). «Биосинтез убихинона в микроорганизмах». FEMS Microbiol. Латыш. 203 (2): 131–9. Дои:10.1111 / j.1574-6968.2001.tb10831.x. PMID  11583838.