Уравновешивающий переносчик нуклеозидов 1 - Equilibrative nucleoside transporter 1
Уравновешивающий переносчик нуклеозидов 1 (ENT1) это белок что у людей кодируется SLC29A1 ген.[5][6] Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов, кодирующих один и тот же белок.[7]
Функция
Этот ген является членом семейства уравновешивающих переносчиков нуклеозидов. Ген кодирует трансмембранный гликопротеин локализуется в плазме и митохондриальных мембранах и опосредует поглощение клетками нуклеозиды из окружающей среды. Белок классифицируется как уравновешивающий (в отличие от концентрирующего) переносчик, чувствительный к ингибированию рибонуклеозидом нитробензилмеркаптопурина (NBMPR). Переносчики нуклеозидов необходимы для синтеза нуклеотидов в клетках, в которых отсутствует de novo пути синтеза нуклеозидов, а также необходимы для поглощения цитотоксических нуклеозидов, используемых для химиотерапии рака и вирусов.[7]
Геномика
Ген, кодирующий этот белок, расположен на коротком плече хромосома 6 на 6p21.2-p21.1 на (плюсовой) нити Watson. Это 14 647 баз в длину. Кодируемый белок имеет 456 аминокислотных остатков с 11 предсказанными трансмембранными доменами. Расчетная молекулярная масса составляет 50,219 килодальтон. Белок посттрансляционно гликозилируется и экспрессируется во всех тканях, за исключением скелетные мышцы. Самые высокие уровни находятся в печень, сердце, яички, селезенка, легкое, почка и мозг.
Интерактивная карта проезда
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.[§ 1]
- ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «ФторпиримидинActivity_WP1601».
Клинический
Мутации в этом гене были связаны с H-синдром пигментированный гипертрихоз при инсулинозависимом диабете и Фейсалабадский гистиоцитоз.[8]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112759 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023942 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Гриффитс М., Бомонт Н., Яо С.Ю., Сундарам М., Боума К.Э., Дэвис А., Квонг Ф.Й., Коу И., Касс С.Е., Янг Д.Д., Болдуин С.А. (январь 1997 г.). «Клонирование переносчика нуклеозидов человека, вовлеченного в клеточное поглощение аденозина и химиотерапевтических препаратов». Нат Мед. 3 (1): 89–93. Дои:10.1038 / нм0197-89. PMID 8986748. S2CID 10182379.
- ^ Coe IR, Griffiths M, Young JD, Baldwin SA, Cass CE (февраль 1998 г.). «Присвоение равновесного переносчика нуклеозидов человека (hENT1) к 6p21.1-p21.2». Геномика. 45 (2): 459–60. Дои:10.1006 / geno.1997.4928. PMID 9344680.
- ^ а б «Ген Entrez: семейство 29 носителей растворенных веществ SLC29A1 (переносчики нуклеозидов), член 1».
- ^ Болз А., Абхьянкар А., Грант А. В., Патель Б., Ядав Р., Бьюн М., Кайлез Д., Эмиль Дж. Ф., Пастор-Англада М., Абель Л., Пуэль А., Говиндараджан Р., де Понтуаль Л., Казанова Дж. Л. (2012). «Легкая форма расстройства SLC29A3: удаление кадра со сдвигом рамки приводит к парадоксальной трансляции варианта сращивания мРНК, не кодирующего иначе». PLOS ONE. 7 (1): e29708. Bibcode:2012PLoSO ... 729708B. Дои:10.1371 / journal.pone.0029708. ЧВК 3251605. PMID 22238637.
дальнейшее чтение
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
- Гриффитс М., Яо С.Ю., Абиди Ф. и др. (1998). «Молекулярное клонирование и характеристика нечувствительного к нитробензилтиоинозину (ei) равновесного переносчика нуклеозидов из плаценты человека». Biochem. J. 328 (3): 739–43. Дои:10.1042 / bj3280739. ЧВК 1218980. PMID 9396714.
- Lum PY, Ngo LY, Bakken AH, Unadkat JD (2000). "Переносчик es-нуклеозидов кишечника человека: молекулярная характеристика и профили ингибирования нуклеозидов". Рак-химиотерапия. Pharmacol. 45 (4): 273–8. Дои:10.1007 / s002800050040. PMID 10755314. S2CID 25693616.
- Сундарам М., Яо С.Ю., Инграм Дж. С. и др. (2002). «Топология человеческого уравновешенного, нитробензилтиоинозинового (NBMPR) переносчика нуклеозидов (hENT1), участвующего в клеточном поглощении аденозина и противораковых препаратов». J. Biol. Chem. 276 (48): 45270–5. Дои:10.1074 / jbc.M107169200. PMID 11584005.
- SenGupta DJ, Lum PY, Lai Y и др. (2002). «Одна мутация глицина в гене уравновешивающего переносчика нуклеозидов, hENT1, изменяет активность транспорта нуклеозидов и чувствительность к нитробензилтиоинозину». Биохимия. 41 (5): 1512–9. Дои:10.1021 / bi015833w. PMID 11814344.
- Яо С.Ю., Нг А.М., Викерс М.Ф. и др. (2002). «Функциональная и молекулярная характеристика транспорта азотистых оснований рекомбинантными уравновешивающими переносчиками нуклеозидов 1 и 2 человека и крысы. Химерные конструкции раскрывают роль области 5-6 спирали ENT2 в транслокации азотистых оснований». J. Biol. Chem. 277 (28): 24938–48. Дои:10.1074 / jbc.M200966200. PMID 12006583.
- Галмарини С.М., Томас X, Кальво Ф. и др. (2002). «Возможные механизмы устойчивости к цитарабину у больных ОМЛ». Лейк. Res. 26 (7): 621–9. Дои:10.1016 / S0145-2126 (01) 00184-9. PMID 12008078.
- Лай Й, Баккен А.Х., Унадкат Дж.Д. (2002). «Одновременная экспрессия hCNT1-CFP и hENT1-YFP в клетках почек собак Madin-Darby. Исследования локализации и векторного транспорта». J. Biol. Chem. 277 (40): 37711–7. Дои:10.1074 / jbc.M204986200. PMID 12097333.
- Санкар Н., Мачадо Дж., Абдулла П. и др. (2002). «Сравнительный геномный анализ равновесных переносчиков нуклеозидов предполагает консервативную структуру белка, несмотря на ограниченную идентичность последовательностей». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (20): 4339–50. Дои:10.1093 / нар / gkf564. ЧВК 137128. PMID 12384580.
- Рейман Т., Кларк М.Л., Даббаг Л. и др. (2003). «Дифференциальная экспрессия человеческого белка равновесного переносчика нуклеозидов 1 (hENT1) в клетках Рида-Штернберга болезни Ходжкина». Лейк. Лимфома. 43 (7): 1435–40. Дои:10.1080/1042819022386725. PMID 12389626. S2CID 24497772.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Mangravite LM, Xiao G, Giacomini KM (2003). «Локализация человека равновесных переносчиков нуклеозидов, hENT1 и hENT2, в почечных эпителиальных клетках». Являюсь. J. Physiol. Почечная физиология. 284 (5): F902–10. Дои:10.1152 / айпренал.00215.2002. PMID 12527552.
- Szkotak AJ, Ng AM, Man SF, et al. (2003). «Сопряжение опосредованной CFTR секреции аниона с переносчиками нуклеозидов и гомеостазом аденозина в клетках Calu-3». J. Membr. Биол. 192 (3): 169–79. Дои:10.1007 / s00232-002-1073-х. PMID 12820662. S2CID 23060872.
- Лай Й, Це CM, Унадкат Дж. Д. (2004). «Митохондриальная экспрессия человеческого уравновешенного переносчика нуклеозидов 1 (hENT1) приводит к усилению митохондриальной токсичности противовирусных препаратов». J. Biol. Chem. 279 (6): 4490–7. Дои:10.1074 / jbc.M307938200. PMID 14607828.
- Ленер Б., Семпл Дж. И., Браун С. Е. и др. (2004). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Эндрес CJ, Sengupta DJ, Unadkat JD (2004). «Мутация лейцина-92 избирательно снижает очевидное сродство инозина, гуанозина, NBMPR [S6- (4-нитробензил) меркаптопурин рибозид] и дилазепа к равновесному переносчику нуклеозидов человека, hENT1». Biochem. J. 380 (Пт 1): 131–7. Дои:10.1042 / BJ20031880. ЧВК 1224139. PMID 14759222.
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.