Семейство гликозид гидролаз 108 - Glycoside hydrolase family 108
| Гликозилгидролаза 108 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_108 | ||||||||
| Pfam | PF05838 | ||||||||
| Pfam клан | CL0037 | ||||||||
| CAZy | GH108 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 108 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 108 CAZY GH_108 включает ферменты с лизоцим (N-ацетилмурамидаза) ЕС 3.2.1.17 Мероприятия. А глютаминовая кислота остаток в консервативном Glu -Gly -Gly-Тюр мотив необходим для каталитическая активность.[8] У бактерий он может активировать секреция большого белки через разрыв и перестановку пептидогликан слой во время секреции.[9][10]
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Выпуск базы данных): D490–5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 108». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Стойкович Э.А., Ротман-Денес Л.Б. (2007). «N-ацетилмурамидаза колифага N4 определяет новое семейство гидролаз муреина». Дж Мол Биол. 366 (2): 406–19. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.11.028. PMID 17174325.
- ^ Пей Дж, Гришин Н.В. (2005). "COG3926 и COG5526: история двух новых семейств лизоцимоподобных белков". Белковая наука. 14 (10): 2574–81. Дои:10.1110 / пс. 051656805. ЧВК 2253296. PMID 16155206.
- ^ Кондо Й, Тойода А., Фукуши Х., Янас Х., Тономура К., Кавасаки Х. и др. (1994). «Клонирование и характеристика пары генов, которые стимулируют выработку и секрецию внеклеточной левансахаразы и инвертазы Zymomonas mobilis». Biosci Biotechnol Biochem. 58 (3): 526–30. Дои:10.1271 / bbb.58.526. PMID 7764692.
