Семейство гликозид гидролаз 42 - Википедия - Glycoside hydrolase family 42
| Бета-галактозидаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура бета-галактозидазы thermus thermophilus a4 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_42 | ||||||||
| Pfam | PF02449 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013529 | ||||||||
| SCOP2 | 1кВт / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH42 | ||||||||
| |||||||||
| Домен тримеризации бета-галактозидазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
кристаллическая структура бета-галактозидазы thermus thermophilus a4 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_42M | ||||||||
| Pfam | PF08532 | ||||||||
| Pfam клан | CL0014 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013738 | ||||||||
| SCOP2 | 1кВт / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| С-концевой домен бета-галактозидазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
кристаллическая структура бета-галактозидазы thermus thermophilus a4 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_42C | ||||||||
| Pfam | PF08533 | ||||||||
| Pfam клан | CL0369 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013739 | ||||||||
| SCOP2 | 1кВт / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 42 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы ЕС 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать в гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводным и неуглеводным фрагментом. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозилгидролаз 42 КАЗИ GH_42 состоит из бета-галактозидаза ферменты (ЕС 3.2.1.23 ). Эти ферменты катализировать в гидролиз терминального невосстанавливающего терминального бета-D-галактозида остатки. Средний домен этих трехдоменных ферментов участвует в тримеризация.[8]
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 42». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Симидзу Т., Кобаяши Т., Ба-Тейн В., Отани К., Хаяси Х (1995). «Анализ последовательности фланкирующих областей гена pfoA Clostridium perfringens: ген бета-галактозидазы (pbg) расположен в 3'-фланкирующей области». Микробиология и иммунология. 39 (9): 677–86. Дои:10.1111 / j.1348-0421.1995.tb03256.x. PMID 8577281. S2CID 2650178.
