Семейство гликозид гидролаз 45 - Glycoside hydrolase family 45
| Семейство гликозилгидролаз 45 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 эндоглюканаза из humicola insolens с разрешением 1,7a | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_45 | ||||||||
| Pfam | PF02015 | ||||||||
| Pfam клан | CL0199 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000334 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00877 | ||||||||
| SCOP2 | 2eng / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH45 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 45 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы ЕС 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 45 КАЗИ GH_45 содержит ферменты только с одной известной активностью; эндоглюканаза (ЕС 3.2.1.4 ). Это семейство также известно как семейство целлюлаз K.[8] Наилучшая консервативная область этих ферментов расположена в N-концевой части. Он содержит аспарагиновая кислота остаток, который был показан[9] действовать как нуклеофил в каталитическом механизме. Это также имеет несколько цистеины которые участвуют в формировании дисульфидные мостики.
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 45». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. HDL:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. PMID 29040563.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (август 1993 г.). «Новые семейства в классификации гликозилгидролаз на основе сходства аминокислотных последовательностей». Биохимический журнал. 293 (Pt 3) (3): 781–8. Дои:10.1042 / bj2930781. ЧВК 1134435. PMID 8352747.
- ^ Дэвис Г.Дж., Додсон Г.Г., Хаббард Р.Э., Толли С.П., Даутер З., Уилсон К.С., Хьорт С., Миккельсен Дж. М., Расмуссен Г., Шюляйн М. (сентябрь 1993 г.). «Структура и функция эндоглюканазы V». Природа. 365 (6444): 362–4. Bibcode:1993Натура.365..362Д. Дои:10.1038 / 365362a0. PMID 8377830. S2CID 4277867.
