Семейство гликозид гидролаз 47 - Glycoside hydrolase family 47
| Семейство гликозилгидролаз 47 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_47 | ||||||||
| Pfam | PF01532 | ||||||||
| Pfam клан | CL0059 | ||||||||
| SCOP2 | 1dl2 / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH47 | ||||||||
| Мембранома | 526 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 47 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозид гидролаз 47 CAZY GH_47 содержит ферменты только с одной известной активностью; альфа-маннозидаза (EC 3.2.1.113 ).
Альфа-маннозидаза участвует в созревании Asn -связанный олигосахариды.[8] Фермент гидролизует концевые 1,2-связанные остатки альфа-D-маннозы в олигосахариде олигоманнозы человека (9) (glcnac) (2) кальций-зависимым образом. В манноза остатки обрезаются, чтобы получить сначала структуру man (8) glcnac (2), затем структуру man (5) (glcnac) (2).
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 47». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
- ^ Лал А., Шутцбах Дж. С., Форзее В. Т., Ним П. Дж., Мормен К. В. (апрель 1994 г.). «Выделение и экспрессия кДНК мышей и кроликов, кодирующих альфа 1,2-маннозидазу, участвующую в процессинге олигосахаридов, связанных с аспарагином». Журнал биологической химии. 269 (13): 9872–81. PMID 8144580.
