Семейство гликозид гидролаз 7 - Википедия - Glycoside hydrolase family 7

Семейство гликозилгидролаз 7
PDB 4ovw EBI.jpg
эндоглюканаза I в комплексе с эпоксибутилцеллобиозой
Идентификаторы
СимволGlyco_hydro_7
PfamPF00840
Pfam кланCL0004
ИнтерПроIPR001722
SCOP21цел / Объем / СУПФАМ
CAZyGH7
CDDcd07999

В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 7 это семья из гликозидгидролазы.

Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]

Семейство гликозид гидролаз 7 CAZY GH_7 содержит ферменты с несколькими известными активностями, включая эндоглюканаза (EC 3.2.1.4 ) и целлобиогидролаза (EC 3.2.1.91 ). Эти ферменты ранее были известны как семейство целлюлаз С.

Экзоглюканазы и целлобиогидролазы[8] сыграть роль в преобразовании целлюлоза к глюкоза сокращая дисахарид целлобиоза от невосстанавливающего конца полимерной цепи целлюлозы. Структурно целлюлазы и ксиланазы часто состоят из каталитического домена, присоединенного к связывающий целлюлозу домен (CBD) через линкерную область, богатую пролин и / или гидроксиаминокислоты. В типе I экзоглюканазы, домен CBD находится на С-конце этого фермента (этот короткий домен образует структуру петли шпильки, стабилизированную 2 дисульфидные мостики ).

Рекомендации

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
  5. ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Выпуск базы данных): D490–5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ «Семейство гликозид гидролаз 7». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
  7. ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID  29040563.
  8. ^ Гилкс Н.Р., Хенриссат Б., Килберн Д.Г., Миллер Р.К., Уоррен Р.А. (июнь 1991 г.). «Домены микробных бета-1,4-гликаназ: сохранение последовательности, функция и семейства ферментов». Микробиологические обзоры. 55 (2): 303–15. Дои:10.1128 / MMBR.55.2.303-315.1991. ЧВК  372816. PMID  1886523.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001722