Агонист смерти с взаимодействующим доменом BH3 - BH3 interacting-domain death agonist

BID
BID protein 2bid.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыBID, Bid, 2700049M22Rik, AI875481, AU022477, FP497, агонист смерти взаимодействующего домена BH3
Внешние идентификаторыOMIM: 601997 MGI: 108093 ГомолоГен: 923 Генные карты: BID
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное местоположение для BID
Геномное местоположение для BID
Группа22q11.21Начинать17,734,138 бп[1]
Конец17,774,770 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE BID 211725 s в формате fs.png

PBB GE BID 204493 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

637

12122

Ансамбль

ENSG00000015475

ENSMUSG00000004446

UniProt

P55957

P70444

RefSeq (мРНК)

NM_007544

RefSeq (белок)

NP_031570

Расположение (UCSC)Chr 22: 17.73 - 17.77 МбChr 6: 120,89 - 120,92 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
BID
PDB 2bid EBI.jpg
человеческий проапоптотический белок, два раза в день
Идентификаторы
СимволBID
PfamPF06393
ИнтерПроIPR010479
SCOP21 дБ / Объем / СУПФАМ
TCDB1.A.21
OPM суперсемейство40
Белок OPM2 мин. 5 я

В Агонист смерти с взаимодействующим доменом BH3, или же BID, ген является про-апоптотический член Bcl-2 семейство белков.[5] Члены семейства Bcl-2 разделяют одну или несколько из четырех характеристик домены из гомология названные домены гомологии Bcl-2 (BH) (названные BH1, BH2, BH3 и BH4) и могут образовывать гетеро- или гомодимеры. Белки Bcl-2 действуют как анти- или про-апоптотический регуляторы, которые участвуют в широком спектре клеточной деятельности.

Взаимодействия

BID представляет собой проапоптотический белок Bcl-2, содержащий только домен BH3. В ответ на апоптотический сигнал, BID взаимодействует с другим семейством Bcl-2. белок, Bax, что привело к вставке Bax в органелла мембраны, прежде всего наружные митохондриальный мембрана. Bax, как полагают, взаимодействует с митохондриальным потенциал-зависимым анионным каналом и вызывает открытие митохондриального анионного канала, VDAC. С другой стороны, растущие данные свидетельствуют о том, что активированный Bax и / или Бак образуют олигомерные поры, MAC в наружной мембране. Это приводит к высвобождению цитохрома с и других проапоптотических факторов (таких как SMAC / DIABLO)[6] из митохондрий, что часто называют проницаемостью внешней мембраны митохондрий, что приводит к активации каспасы. Это определяет BID как прямой активатор Bax, роль, общую для некоторых проапоптотических белков Bcl-2, содержащих только домен BH3.

Белки против апоптоза Bcl-2, включая сам Bcl-2, могут связывать BID и ингибировать способность BID активировать Bax. В результате антиапоптотические белки Bcl-2 могут ингибировать апоптоз за счет секвестрирования BID, что приводит к снижению активации Bax.

Выражение BID регулируется подавитель опухолей p53, и было показано, что BID участвует в p53-опосредованном апоптозе.[7] Белок p53 представляет собой фактор транскрипции который при активации как часть ответа клетки на стресс регулирует многие нижестоящие гены-мишени, включая BID. Однако р53 также играет независимую от транскрипции роль в апоптозе. В частности, p53 взаимодействует с Bax, способствуя активации Bax и встраиванию Bax в митохондриальную мембрану.

Было показано, что агонист смерти взаимодействующего домена BH3 взаимодействовать с:

Расщепление

Расщепление Bid каспазой-8 (как поверхность) (как лента) (визуализация Коси Граматикофф )

Несколько отчетов показали, что каспаза -8 и его субстрат BID часто активируются в ответ на определенные апоптотический стимулы, не зависящие от рецепторов смерти. N-гидрокси-L-аргинин (NOHA), стабильный промежуточный продукт, образующийся при превращении L-аргинина в оксид азота активирует каспазу-8.[16] Активация каспазы-8 и последующее расщепление BID участвуют в цитохром-с опосредованный апоптоз.[17] 1-метил-4-фенил-1,2,3,6-тетрагидропиридин (MPTP) опосредованная активация каспазы-9 через цитохром-с было показано, что высвобождение приводит к активации каспазы-8 и расщеплению Bid.[18] Аспирин и Куркумин (диферулоилметан) также активирует каспазу-8, чтобы расщеплять и перемещать Bid, вызывая конформационные изменения и транслокацию Bax и цитохром-с релиз.[19][20]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000015475 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000004446 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ван К., Инь XM, Чао Д.Т., Миллиман С.Л., Корсмейер С.Дж. (1996). «BID: новый агонист смерти, содержащий только домен BH3». Genes Dev. 10 (22): 2859–69. Дои:10.1101 / gad.10.22.2859. PMID  8918887.
  6. ^ Вайнберг, Роберт А. (2007). Биология рака. Нью-Йорк: Тейлор и Фрэнсис. п. 341. ISBN  978-0-8153-4076-8.
  7. ^ Сакс Дж. К., Фей П., Мерфи М. Э., Бернхард Э, Корсмейер С. Дж., Эль-Дейри В. С. (2002). «Регулирование BID с помощью p53 способствует химиочувствительности». Nat. Cell Biol. 4 (11): 842–9. Дои:10,1038 / ncb866. PMID  12402042. S2CID  2206946.
  8. ^ Лю Ю., Бертрам CC, Ши Кью, Зинкель СС (2011). «Proapoptotic Bid опосредует ответ на повреждение ДНК, направленное Atr, на репликативный стресс». Разница в гибели клеток. 18 (5): 841–52. Дои:10.1038 / cdd.2010.151. ЧВК  3074003. PMID  21113148.
  9. ^ а б Чен Л., Уиллис С.Н., Вей А., Смит Б.Дж., Флетчер Д.И., Хайндс М.Г., Колман П.М., Дэй К.Л., Адамс Дж.М., Хуанг, округ Колумбия (2005). «Дифференциальное нацеливание белков Bcl-2 для выживания с помощью их лигандов, содержащих только BH3, обеспечивает комплементарную апоптотическую функцию». Мол. Клетка. 17 (3): 393–403. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.12.030. PMID  15694340.
  10. ^ Настоящий Пи Джей, Цао Й, Ван Р, Николовска-Колеска З., Санс-Ортис Дж., Ван С., Фернандес-Луна Дж. Л. (2004). «Клетки рака молочной железы могут избежать опосредованного апоптозом селективного уничтожения с помощью нового низкомолекулярного ингибитора Bcl-2». Рак Res. 64 (21): 7947–53. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-0945. PMID  15520201.
  11. ^ а б Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (2002). «Каспаза-2 вызывает апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий». J. Biol. Chem. 277 (16): 13430–7. Дои:10.1074 / jbc.M108029200. PMID  11832478.
  12. ^ Парони G, Хендерсон C, Шнайдер C, Бранколини C (2001). «Апоптоз, индуцированный каспазой-2, зависит от каспазы-9, но для его обработки во время гибели клеток, зависимой от УФ-излучения или фактора некроза опухоли, требуется каспаза-3». J. Biol. Chem. 276 (24): 21907–15. Дои:10.1074 / jbc.M011565200. PMID  11399776.
  13. ^ Гаджате С., Моллинедо Ф (2005). «Цитоскелет-опосредованный рецептор смерти и концентрация лиганда в липидных рафтах образуют кластеры, способствующие апоптозу при химиотерапии рака». J. Biol. Chem. 280 (12): 11641–7. Дои:10.1074 / jbc.M411781200. PMID  15659383.
  14. ^ Вен Ц, Ли И, Сюй Д, Ши И, Тан Х (2005). «Специфическое расщепление Mcl-1 каспазой-3 в апоптозе, индуцированном лигандом, индуцирующим апоптоз (TRAIL), в Т-клетках лейкемии Jurkat». J. Biol. Chem. 280 (11): 10491–500. Дои:10.1074 / jbc.M412819200. PMID  15637055.
  15. ^ Лю Ю., Вайтхиялингам С., Ши К., Чазин В.Дж., Зинкель С.С. (2011). «BID связывается с белком репликации А и стимулирует функцию ATR после репликативного стресса». Мол. Клетка. Биол. 31 (21): 4298–309. Дои:10.1128 / MCB.05737-11. ЧВК  3209332. PMID  21859891.
  16. ^ Сингх Р., Первин С., Чаудхури Г. (2002). «Опосредованное каспазой-8 расщепление BID и высвобождение митохондриального цитохрома c во время апоптоза, индуцированного номега-гидрокси-L-аргинином в клетках MDA-MB-468. Антагонистические эффекты L-орнитина». J. Biol. Chem. 277 (40): 37630–6. Дои:10.1074 / jbc.M203648200. PMID  12145284.
  17. ^ Тан Д., Лахти Дж. М., Кидд В. Дж. (2000). «Активация каспазы-8 и расщепление бид вносят вклад в клеточное выполнение MCF7 каспазой-3-зависимым образом во время опосредованного стауроспорином апоптоза». J. Biol. Chem. 275 (13): 9303–7. Дои:10.1074 / jbc.275.13.9303. PMID  10734071.
  18. ^ Вишванат В., Ву И, Бунплюанг Р., Чен С., Стивенсон Ф. Ф., Янтири Ф., Ян Л., Бил М. Ф., Андерсен Дж. К. (2001). «Активация каспазы-9 приводит к активации каспазы-8 и расщеплению бид при болезни Паркинсона, вызванной 1-метил-4-фенил-1,2,3,6-тетрагидропиридином». J. Neurosci. 21 (24): 9519–28. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-24-09519.2001. ЧВК  6763046. PMID  11739563.
  19. ^ Гу Q, Ван Дж.Д., Ся ХХ, Линь МС, Хе Х, Цзоу Би, Ту СП, Ян Й, Лю XG, Лам С.К., Вонг ВМ, Чан АО, Юэнь М.Ф., Кунг Х.Ф., Вонг BC (2005). «Активация путей каспазы-8 / Bid и Bax в индуцированном аспирином апоптозе при раке желудка». Канцерогенез. 26 (3): 541–6. Дои:10.1093 / carcin / bgh345. PMID  15579484.
  20. ^ Anto RJ, Mukhopadhyay A, Denning K, Aggarwal BB (2002). «Куркумин (диферулоилметан) индуцирует апоптоз посредством активации каспазы-8, расщепления BID и высвобождения цитохрома c: его подавление эктопической экспрессией Bcl-2 и Bcl-xl». Канцерогенез. 23 (1): 143–50. Дои:10.1093 / carcin / 23.1.143. PMID  11756235.

внешняя ссылка