ERCC4 - ERCC4

ERCC4
Белок ERCC4 PDB 1z00.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыERCC4, ERCC11, FANCQ, RAD1, XPF, XFEPS, эксцизионная репарация, кросс-комплементационная группа 4, эксцизионная репарация 4, ERCC, каталитическая субъединица эндонуклеазы
Внешние идентификаторыOMIM: 133520 MGI: 1354163 ГомолоГен: 3836 Генные карты: ERCC4
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение ERCC4
Геномное расположение ERCC4
Группа16p13.12Начните13,920,154 бп[1]
Конец13,952,348 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ERCC4 210158 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

2072

50505

Ансамбль

ENSG00000175595

ENSMUSG00000022545

UniProt

Q92889

Q9QZD4

RefSeq (мРНК)

NM_005236

NM_015769

RefSeq (белок)

NP_005227

NP_056584

Расположение (UCSC)Chr 16: 13.92 - 13.95 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ERCC4 это белок обозначенный как Эндонуклеаза репарации ДНК XPF что у людей кодируется ERCC4 ген. Вместе с ERCC1, ERCC4 образует ферментный комплекс ERCC1-XPF, который участвует в Ремонт ДНК и Рекомбинация ДНК.[4][5]

В нуклеаза фермент ERCC1-XPF разрезает определенные структуры ДНК. Многие аспекты этих двух генных продуктов описаны здесь вместе, потому что они являются партнерами в процессе репарации ДНК. Нуклеаза ERCC1-XPF является важной активностью в пути ДНК. эксцизионная репарация нуклеотидов (NER). Нуклеаза ERCC1-XPF также участвует в путях восстановления двухниточные разрывы в ДНК, и при восстановлении повреждений «поперечных связей», которые вредно связывают две цепи ДНК.

Клетки с отключением мутаций в ERCC4 более чувствительны, чем обычно, к определенным агентам, повреждающим ДНК, включая ультрафиолетовая радиация и к химическим веществам, которые вызывают сшивание между цепями ДНК. Генно-инженерные мыши с отключение мутаций в ERCC4 также имеют дефекты репарации ДНК, сопровождаемые метаболическими стрессовыми изменениями физиологии, которые приводят к преждевременному старению.[6] Полное удаление ERCC4 несовместимо с жизнеспособностью мышей, и не было обнаружено ни одного человека с полной (гомозиготной) делецией ERCC4. Редкие люди в человеческой популяции несут наследственные мутации, нарушающие функцию ERCC4. Когда нормальные гены отсутствуют, эти мутации могут приводить к синдромам человека, включая пигментная ксеродермия, Синдром Кокейна и Анемия Фанкони.

ERCC1 и ERCC4 имена человеческих генов и Ercc1 и Ercc4 являются аналогичный названия генов млекопитающих. Подобные гены со схожими функциями обнаруживаются у всех эукариотических организмов.

Ген

Человек ERCC4 ген может исправить дефект репарации ДНК в определенных мутантных клеточных линиях, чувствительных к ультрафиолету (УФ), полученных из клеток яичников китайского хомячка.[7] Было выделено несколько независимых групп комплементации клеток яичника китайского хомячка (СНО),[8] и этот ген восстанавливает устойчивость к УФ-излучению у клеток группы комплементации 4. Отражая этот метод межвидовой генетической комплементации, ген был назван «перекрестное комплементарное восстановление с эксцизией 4».[9]

Человек ERCC4 Ген кодирует белок XPF из 916 аминокислот с молекулярной массой около 104000 дальтон.

Гены, похожие на ERCC4 с эквивалентными функциями (ортологами) встречаются в геномах других эукариот. Некоторые из наиболее изученных ортологов генов включают: RAD1 в зародышевых дрожжах Saccharomyces cerevisiae, и рад16 + в делящихся дрожжах Schizosaccharomyces pombe.

Протеин

Рисунок 1: Схема XPF, показывающая неактивный домен геликазы, домен нуклеазы и домен спираль-шпилька-спираль

Одна молекула ERCC1 и одна молекула XPF связываются вместе, образуя гетеродимер ERCC1-XPF, который является активной нуклеазной формой фермента. В гетеродимере ERCC1-XPF ERCC1 обеспечивает взаимодействия ДНК и белок. XPF обеспечивает активный сайт эндонуклеазы и участвует в связывании ДНК и дополнительных межбелковых взаимодействиях.[7]

Белок ERCC4 / XPF состоит из двух консервативных областей, разделенных менее консервативной областью посередине. N-концевой участок гомологичен нескольким консервативным доменам ДНК-геликаз, принадлежащих к суперсемейству II, хотя XPF не является ДНК-геликазой.[10] С-концевой участок XPF включает остатки активного сайта для нуклеазной активности.[11] (Рисунок 1).

Большая часть белка ERCC1 связана на уровне последовательности с С-концом белка XPF.[12] но остатков в нуклеазном домене нет. ДНК-связывающий домен «спираль-шпилька-спираль» на С-конце каждого белка.

По первичной последовательности и структурному сходству белков нуклеаза ERCC1-XPF является членом более широкого семейства структурно-специфичных ДНК-нуклеаз, состоящих из двух субъединиц. К таким нуклеазам относится, например, нуклеаза MUS81-EME1.

Структурно-специфическая нуклеаза

Рисунок 2: ДНК-субстраты нуклеазы ERCC1-XPF

Комплекс ERCC1 – XPF является структурно-специфической эндонуклеазой. ERCC1-XPF не разрезает ДНК, которая является исключительно одноцепочечной или двухцепочечной, но он расщепляет фосфодиэфирный остов ДНК специфически в местах соединения двухцепочечной и одноцепочечной ДНК. Он вводит разрез в двухцепочечной ДНК на 5'-стороне такого соединения, примерно в двух нуклеотидах от него.[13] (Фигура 2). Эта структурная специфичность была первоначально продемонстрирована для RAD10-RAD1, дрожжевых ортологов ERCC1 и XPF.[14]

Гидрофобные мотивы спираль-шпилька-спираль в С-концевых областях ERCC1 и XPF взаимодействуют, способствуя димеризации двух белков.[15][16] В отсутствие димеризации каталитическая активность отсутствует. В самом деле, хотя каталитический домен находится внутри XPF и ERCC1 каталитически неактивен, ERCC1 необходим для активности комплекса.

Было предложено несколько моделей связывания ERCC1 – XPF с ДНК на основе частичных структур релевантных фрагментов белка при атомном разрешении.[15] Связывание ДНК, опосредованное доменами спираль-шпилька-спираль доменов ERCC1 и XPF, позиционирует гетеродимер на стыке двухцепочечной и одноцепочечной ДНК.

Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER)

Во время эксцизионной репарации нуклеотидов несколько белковых комплексов взаимодействуют для распознавания поврежденной ДНК и локально разделяют спираль ДНК на небольшое расстояние по обе стороны от участка повреждения ДНК. Нуклеаза ERCC1-XPF надрезает поврежденную цепь ДНК на 5'-стороне поражения.[13] Во время NER белок ERCC1 взаимодействует с белком XPA для координации связывания ДНК и белка.

Ремонт двухцепочечного разрыва ДНК (DSB)

Клетки млекопитающих с мутантным ERCC1 – XPF умеренно более чувствительны, чем нормальные клетки, к агентам (таким как ионизирующее излучение), которые вызывают двухцепочечные разрывы в ДНК.[17][18] Конкретные пути как репарации гомологичной рекомбинации, так и негомологичного присоединения концов зависят от функции ERCC1-XPF.[19][20] Соответствующая активность ERCC1 – XPF для обоих типов репарации двухцепочечных разрывов заключается в способности удалять негомологичные 3'-одноцепочечные хвосты с концов ДНК перед воссоединением. Эта активность необходима во время подпути однонитевого отжига гомологичной рекомбинации. Обрезка 3’-одноцепочечных хвостов также необходима в механически отличном от механизма пути негомологичного соединения концов, независимо от белков Ku.[21][22] Гомологичная интеграция ДНК, важный метод генетических манипуляций, зависит от функции ERCC1-XPF в клетке-хозяине.[23]

Ремонт межнитевых сшивок

Клетки млекопитающих, несущие мутации в ERCC1 или XPF, особенно чувствительны к агентам, вызывающим межцепочечные сшивки ДНК (ICL).[24] Межцепочечные поперечные сшивки блокируют развитие репликации ДНК, а структуры в ответвлениях блокированной репликации ДНК обеспечивают субстраты для расщепления с помощью ERCC1-XPF.[25][26] Надрезы могут быть сделаны по обе стороны от перекрестной связи на одной цепи ДНК, чтобы расцепить перекрестную связь и инициировать репарацию. Альтернативно, двухцепочечный разрыв может происходить в ДНК рядом с ICL, и последующая гомологичная рекомбинационная репарация может включать действие ERCC1-XPF. Хотя это не единственная участвующая нуклеаза, ERCC1 – XPF необходима для репарации ICL во время нескольких фаз клеточного цикла.[27][28]

Клиническое значение

Пигментная ксеродермия (XP)

Некоторые люди с редким наследственным синдромом пигментная ксеродермия есть мутации в ERCC4. Эти пациенты классифицируются как группа комплементации XP F (XP-F). Диагностическими особенностями XP являются сухая чешуйчатая кожа, аномальная пигментация кожи на участках, подверженных воздействию солнечных лучей, и серьезная светочувствительность, сопровождаемая более чем 1000-кратным повышением риска развития рака кожи, вызванного УФ-излучением.[4]

Синдром Кокейна (CS)

У большинства пациентов XP-F наблюдаются умеренные симптомы XP, но у некоторых появляются дополнительные симптомы синдрома Кокейна.[29] Пациенты с синдромом Кокейна (CS) проявляют светочувствительность, а также имеют дефекты развития и неврологические симптомы.[4][6]

Мутации в гене ERCC4 могут привести к очень редкому синдрому XF-E.[30] У этих пациентов есть характеристики XP и CS, а также дополнительные неврологические, гепатобилиарные, скелетно-мышечные и гемопоэтические симптомы.

Анемия Фанкони

Несколько пациентов-людей с симптомами анемии Фанкони (FA) имеют причинные мутации в гене ERCC4. Анемия Фанкони - сложное заболевание, включающее основные гемопоэтические симптомы. Характерной особенностью ЖК является повышенная чувствительность к агентам, вызывающим межцепочечные сшивки ДНК. Пациенты с FA с мутациями ERCC4 были классифицированы как принадлежащие к группе комплементации анемии Фанкони Q (FANCQ).[29][31]

ERCC4 (XPF) в нормальном двоеточие

Последовательные разделы одного и того же склеп толстой кишки с участием иммуногистохимический окрашивание (коричневый), показывающее нормальную высокую экспрессию белков репарации ДНК PMS2 (А), ERCC1 (B) и ERCC4 (XPF) (C). Этот склеп взят из биопсии 58-летнего пациента мужского пола, у которого никогда не было толстой кишки. неоплазия и крипта имеет высокую экспрессию этих белков репарации ДНК в ядрах поглощающих клеток на большей части крипты. Обратите внимание, что экспрессия PMS2 и ERCC4 (XPF) (на панелях A и C) снижена или отсутствует в ядра клеток в верхней части крипты и на поверхности толстой кишки просвет между склепами. Исходное изображение, также в публикации.[32]

ERCC4 (XPF) обычно экспрессируется в клетке на высоком уровне. ядра внутри внутренней поверхности двоеточие (см. изображение, панель C). Внутренняя поверхность толстой кишки выстлана простой столбчатой эпителий с участием инвагинации. Инвагинации называются кишечные железы или крипты толстой кишки. Крипты толстой кишки имеют форму микроскопических толстостенных пробирок с центральным отверстием по всей длине пробирки (крипта просвет ). Склепы имеют длину от 75 до 110 ячеек. Ремонт ДНК, включающий высокую экспрессию белков ERCC4 (XPF), PMS2 и ERCC1, по-видимому, очень активен в криптах толстой кишки у нормальных, ненеопластический эпителий толстой кишки.

Клетки образуются в основании крипты и мигрируют вверх вдоль оси крипты перед тем, как попасть в толстую кишку. просвет днями позже.[33] Есть от 5 до 6 стволовые клетки у оснований склепов.[33] На внутренней поверхности среднестатистического человека расположено около 10 миллионов крипт. двоеточие.[32] Если стволовые клетки в основе крипты экспрессирует ERCC4 (XPF), обычно все несколько тысяч клеток крипты также будут экспрессировать ERCC4 (XPF). На это указывает коричневый цвет, наблюдаемый при иммуноокрашивании ERCC4 (XPF) почти во всех клетках в крипте на панели C изображения в этом разделе. Аналогичная экспрессия PMS2 и ERCC1 наблюдается в тысячах клеток в каждой нормальной крипте толстой кишки.

Срез ткани на изображении, показанном здесь, также был контрастный с участием гематоксилин окрашивать ДНК в ядрах в сине-серый цвет. Ядра клеток в собственная пластинка, клетки, которые находятся ниже и окружают эпителиальные крипты, в основном показывают гематоксилиновый сине-серый цвет и мало экспрессируют PMS2, ERCC1 или ERCC4 (XPF). Кроме того, клетки на самых верхушках крипт, окрашенные на PMS2 (панель A) или ERCC4 (XPF) (панель C), имеют низкие уровни этих белков репарации ДНК, так что такие клетки также показывают сине-серое окрашивание ДНК.[32]

Дефицит ERCC4 (XPF) в эпителии толстой кишки рядом с раком и внутри него

Последовательные участки сегмента двоеточие эпителий рядом с колоректальный рак показывая уменьшенное или отсутствующее выражение PMS2 (А), ERCC1 (B) и ERCC4 (C) в криптах толстой кишки. Этот сегмент ткани взят из гистологически нормальная область резекции толстой кишки пациента мужского пола, у которого аденокарцинома в сигмовидной кишке. Для PMS2 (A) экспрессия в ядрах клеток тела крипты, шейки крипты и толстой кишки отсутствует. просвет поверхность для всех эпителиальных клеток. Для ERCC1 (B) наблюдается сниженная экспрессия в большинстве клеточных ядер крипт, но высокая экспрессия в клеточных ядрах на шейке крипт и в прилегающей ободочной кишке. просвет поверхность. Для ERCC4 (XPF) (C) экспрессия отсутствует в большинстве клеточных ядер крипт и в просвете толстой кишки в этой области ткани, но обнаруживается экспрессия на шейке некоторых крипт. Снижение или отсутствие экспрессии этих генов репарации ДНК в этой ткани, по-видимому, связано с эпигенетическая репрессия.[32] Исходное изображение, также в публикации.[32]

ERCC4 (XPF) недостаточен примерно в 55% случаев рака толстой кишки и примерно в 40% крипт толстой кишки в эпителии в пределах 10 см, прилегающих к опухолям (в полевые дефекты из которых, вероятно, возник рак).[32] Когда ERCC4 (XPF) снижается в криптах толстой кишки при полевом дефекте, это чаще всего связано со сниженной экспрессией ферментов репарации ДНК ERCC1 и PMS2, как показано на изображении в этом разделе. Дефицит ERCC1 (XPF) в эпителии толстой кишки, по-видимому, связан с эпигенетический репрессии.[32] Дефицит ERCC4 (XPF) может привести к уменьшению восстановления повреждений ДНК. Как указывали Харпер и Элледж,[34] Нарушение способности правильно реагировать на повреждения ДНК и восстанавливать их лежит в основе многих форм рака. Частое эпигенетическое снижение ERCC4 (XPF) в полевых дефектах, окружающих рак толстой кишки, а также при раке (наряду с эпигенетическим снижением ERCC1 и PMS2) указывает на то, что такое снижение часто может играть центральную роль в прогрессировании до рака толстой кишки.

Хотя эпигенетическое снижение экспрессии ERCC4 (XPF) часто встречается при раке толстой кишки человека, мутации в ERCC4 (XPF) у людей встречаются редко.[35] Однако мутация в ERCC4 (XPF) делает пациентов предрасположенными к раку кожи.[35] Унаследованный полиморфизм ERCC4 (XPF), по-видимому, также важен при раке груди.[36] Эти нечастые мутационные изменения подчеркивают вероятную роль дефицита ERCC4 (XPF) в прогрессировании рака.

Заметки

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175595 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ а б c Friedberg EC, Walker GC, Siede W, Wood RD, Schultz RA, Ellenberger T (2006). Ремонт ДНК и мутагенез. ASM Press. ISBN  978-1555813192.
  5. ^ «Ген Entrez: эксцизионная репарация ERCC4, дополняющая дефицит репарации грызунов, группа комплементации 4».
  6. ^ а б Грегг С.К., Робинсон А.Р., Нидернхофер Л.Дж. (июль 2011 г.). «Физиологические последствия дефектов эндонуклеазы репарации ДНК ERCC1-XPF». Ремонт ДНК. 10 (7): 781–91. Дои:10.1016 / j.dnarep.2011.04.026. ЧВК  3139823. PMID  21612988.
  7. ^ а б Вестервельд А., Hoeijmakers JH, ван Дуин М., де Вит Дж., Одийк Х., Пастинк А., Вуд Р. Д., Бутсма Д. (1984). «Молекулярное клонирование гена репарации ДНК человека». Природа. 310 (5976): 425–9. Bibcode:1984 Натур. 310..425 Вт. Дои:10.1038 / 310425a0. PMID  6462228. S2CID  4336902.
  8. ^ Буш Д., Грейнер С., Льюис К., Форд Р., Адэр Дж., Томпсон Л. (сентябрь 1989 г.). «Краткое изложение групп комплементации мутантов чувствительных к ультрафиолету клеток CHO, выделенных путем крупномасштабного скрининга». Мутагенез. 4 (5): 349–54. Дои:10.1093 / mutage / 4.5.349. PMID  2687628.
  9. ^ Брукман К.В., Ламердин Дж. Э., Телен М. П., Хван М., Рирдон Д. Т., Санкар А., Чжоу З. К., Уолтер Калифорния, Пэррис С. Н., Томпсон Л. Х. (ноябрь 1996 г.). «ERCC4 (XPF) кодирует человеческий белок эксцизионной репарации нуклеотидов с гомологами эукариотической рекомбинации». Молекулярная и клеточная биология. 16 (11): 6553–62. Дои:10.1128 / mcb.16.11.6553. ЧВК  231657. PMID  8887684.
  10. ^ Sgouros J, Gaillard PH, Wood RD (март 1999 г.). «Взаимосвязь между семейством нуклеаз репарации / рекомбинации ДНК и геликазами архей». Тенденции в биохимических науках. 24 (3): 95–7. Дои:10.1016 / s0968-0004 (99) 01355-9. PMID  10203755.
  11. ^ Энцлин Дж. Х., Шерер О. Д. (апрель 2002 г.). «Активный сайт эндонуклеазы репарации ДНК XPF-ERCC1 образует высококонсервативный мотив нуклеазы». Журнал EMBO. 21 (8): 2045–53. Дои:10.1093 / emboj / 21.8.2045. ЧВК  125967. PMID  11953324.
  12. ^ Гайяр PH, Wood RD (февраль 2001 г.). «Активность отдельных субъединиц ERCC1 и XPF в эксцизионной репарации нуклеотидов ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (4): 872–9. Дои:10.1093 / nar / 29.4.872. ЧВК  29621. PMID  11160918.
  13. ^ а б Sijbers AM, de Laat WL, Ariza RR, Biggerstaff M, Wei YF, Moggs JG, Carter KC, Shell BK, Evans E, de Jong MC, Rademakers S, de Rooij J, Jaspers NG, Hoeijmakers JH, Wood RD (сентябрь 1996 г. ). «Xeroderma pigmentosum группы F, вызванная дефектом структурно-специфической эндонуклеазы репарации ДНК». Ячейка. 86 (5): 811–22. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80155-5. HDL:1765/3110. PMID  8797827. S2CID  12957716.
  14. ^ Бардвелл А.Дж., Бардуэлл Л., Томкинсон А.Е., Фридберг ЕС (сентябрь 1994 г.). «Специфическое расщепление модельных промежуточных продуктов рекомбинации и репарации дрожжевой эндонуклеазой ДНК Rad1-Rad10». Наука. 265 (5181): 2082–5. Bibcode:1994Научный ... 265.2082B. Дои:10.1126 / science.8091230. PMID  8091230.
  15. ^ а б Tripsianes K, Folkers G, Ab E, Das D, Odijk H, Jaspers NG, Hoeijmakers JH, Kaptein R, Boelens R (декабрь 2005 г.). «Структура человеческих доменов взаимодействия ERCC1 / XPF обнаруживает комплементарную роль этих двух белков в эксцизионной репарации нуклеотидов». Структура. 13 (12): 1849–1858. Дои:10.1016 / j.str.2005.08.014. HDL:1874/14818. ISSN  1633-8413. PMID  16338413.
  16. ^ Faridounnia M, Wienk H, Kovačič L, Folkers GE, Jaspers NG, Kaptein R, Hoeijmakers JH, Boelens R (август 2015 г.). «Точечная мутация F231L церебро-окуло-фасцио-скелетного синдрома в белке репарации ДНК ERCC1 вызывает диссоциацию комплекса ERCC1-XPF». J Biol Chem. 290 (33): 20541–20555. Дои:10.1074 / jbc.M114.635169. ISSN  1083-351X. ЧВК  4536458. PMID  26085086.
  17. ^ Wood RD, Burki HJ, Hughes M, Poley A (февраль 1983 г.). «Радиационно-индуцированная летальность и мутации в линии клеток СНО с дефицитом репарации». Международный журнал радиационной биологии и смежных исследований в области физики, химии и медицины. 43 (2): 207–13. Дои:10.1080/09553008314550241. PMID  6600735.
  18. ^ Ахмад А., Робинсон А. Р., Дюнзинг А., ван Друнен Е., Беверло Х. Б., Вайсберг Д. Б., Хасти П., Хоймейкерс Дж. Х., Нидернхофер Л. Дж. (Август 2008 г.). «Эндонуклеаза ERCC1-XPF способствует репарации двухцепочечных разрывов ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 28 (16): 5082–92. Дои:10.1128 / MCB.00293-08. ЧВК  2519706. PMID  18541667.
  19. ^ Сарджент Р.Г., Ролиг Р.Л., Килберн А.Э., Адэр Г.М., Уилсон Дж. Х., Нэрн Р.С. (ноябрь 1997 г.). «Зависимое от рекомбинации образование делеций в клетках млекопитающих, дефицитных по гену эксцизионной репарации нуклеотидов ERCC1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (24): 13122–7. Bibcode:1997PNAS ... 9413122S. Дои:10.1073 / пнас.94.24.13122. ЧВК  24273. PMID  9371810.
  20. ^ Аль-Минави А.З., Салех-Гохари Н., Хелледей Т. (январь 2008 г.). «Эндонуклеаза ERCC1 / XPF необходима для эффективного одноцепочечного отжига и преобразования генов в клетках млекопитающих». Исследования нуклеиновых кислот. 36 (1): 1–9. Дои:10.1093 / нар / гкм888. ЧВК  2248766. PMID  17962301.
  21. ^ Беннардо Н., Ченг А., Хуанг Н., Старк Дж. М. (июнь 2008 г.). «Альтернатива-NHEJ - это механистически отдельный путь репарации разрывов хромосом млекопитающих». PLOS Genetics. 4 (6): e1000110. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000110. ЧВК  2430616. PMID  18584027.
  22. ^ Ахмад А., Робинсон А. Р., Дюнзинг А., ван Друнен Е., Беверло Х. Б., Вайсберг Д. Б., Хасти П., Хоймейкерс Дж. Х., Нидернхофер Л. Дж. (Август 2008 г.). «Эндонуклеаза ERCC1-XPF способствует репарации двухцепочечных разрывов ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 28 (16): 5082–92. Дои:10.1128 / MCB.00293-08. ЧВК  2519706. PMID  18541667.
  23. ^ Нидернхофер Л.Дж., Эссерс Дж., Вида Дж., Беверлоо Б., де Вит Дж., Муйтьенс М., Одийк Х., Хоймейкерс Дж. Х., Канаар Р. (ноябрь 2001 г.). «Структурно-специфическая эндонуклеаза Ercc1-Xpf необходима для целенаправленной замены гена в эмбриональных стволовых клетках». Журнал EMBO. 20 (22): 6540–9. Дои:10.1093 / emboj / 20.22.6540. ЧВК  125716. PMID  11707424.
  24. ^ Wood RD (июль 2010 г.). «Белки эксцизионной репарации нуклеотидов млекопитающих и репарация межцепочечных сшивок». Экологический и молекулярный мутагенез. 51 (6): 520–6. Дои:10.1002 / em.20569. ЧВК  3017513. PMID  20658645.
  25. ^ Сарджент Р.Г., Ролиг Р.Л., Килберн А.Э., Адэр Г.М., Уилсон Дж. Х., Нэрн Р.С. (ноябрь 1997 г.). «Рекомбинационно-зависимое образование делеций в клетках млекопитающих, дефицитных по гену эксцизионной репарации нуклеотидов ERCC1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (24): 13122–7. Bibcode:1997PNAS ... 9413122S. Дои:10.1073 / пнас.94.24.13122. ЧВК  24273. PMID  9371810.
  26. ^ Klein Douwel D, Boonen RA, Long DT, Szypowska AA, Räschle M, Walter JC, Knipscheer P (май 2014 г.). «XPF-ERCC1 действует в межцепочечных перекрестных связях расцепляющей ДНК в сотрудничестве с FANCD2 и FANCP / SLX4». Молекулярная клетка. 54 (3): 460–71. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.03.015. ЧВК  5067070. PMID  24726325.
  27. ^ Ран Дж. Дж., Адэр ГМ, Нэрн Р.С. (июль 2010 г.). «Множественные роли ERCC1-XPF в репарации межцепочечных сшивок млекопитающих». Экологический и молекулярный мутагенез. 51 (6): 567–81. Дои:10.1002 / em.20583. PMID  20658648. S2CID  29240680.
  28. ^ Клаусон К., Шерер О.Д., Нидернхофер Л. (октябрь 2013 г.). «Достижения в понимании сложных механизмов репарации межцепочечных сшивок ДНК». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 5 (10): a012732. Дои:10.1101 / cshperspect.a012732. ЧВК  4123742. PMID  24086043.
  29. ^ а б Кашияма К., Накадзава И., Пилз Д.Т., Го С., Шимада М., Сасаки К., Фосетт Х., Винг Дж.Ф., Левин С.О., Карр Л., Ли Т.С., Йошиура К., Утани А., Хирано А., Ямасита С., Гринблатт Д., Нардо Т. , Стефанини М., МакГиббон ​​Д., Саркани Р., Фассихи Х., Такахаши Ю., Нагаяма Ю., Мицутаке Н., Леманн А. Р., Оги Т. (май 2013 г.). «Неисправность нуклеазы ERCC1-XPF приводит к разнообразным клиническим проявлениям и вызывает синдром Кокейна, пигментную ксеродермию и анемию Фанкони». Американский журнал генетики человека. 92 (5): 807–19. Дои:10.1016 / j.ajhg.2013.04.007. ЧВК  3644632. PMID  23623389.
  30. ^ Нидернхофер Л.Дж., Гаринис Г.А., Рамс А., Лалаи А.С., Робинсон А.Р., Аппелдорн Е., Одейк Х., Остендорп Р., Ахмад А., ван Леувен В., Тейл А.Ф., Вермёлен В., ван дер Хорст Г.Т., Майнеке П., Клейджер В.Дж., Видж Дж. , Ясперс Н.Г., Hoeijmakers JH (декабрь 2006 г.). «Новый прогероидный синдром показывает, что генотоксический стресс подавляет соматотропную ось». Природа. 444 (7122): 1038–43. Bibcode:2006Натура 444.1038Н. Дои:10.1038 / природа05456. PMID  17183314. S2CID  4358515.
  31. ^ Больоло М., Шустер Б., Стокер К., Деркунт Б., Су Й., Рамс А., Трухильо Дж. П., Мингуильон Дж., Рамирес М. Дж., Пухоль Р., Касадо Дж. А., Баньос Р., Рио П, Книс К., Суньига С., Бенитес Дж, Буэрен Дж. , Ясперс Н.Г., Шерер О.Д., де Винтер Дж. П., Шиндлер Д., Сурралле Дж. (Май 2013 г.). «Мутации в ERCC4, кодирующей эндонуклеазу репарации ДНК XPF, вызывают анемию Фанкони». Американский журнал генетики человека. 92 (5): 800–6. Дои:10.1016 / j.ajhg.2013.04.002. ЧВК  3644630. PMID  23623386.
  32. ^ а б c d е ж г Фасиста А, Нгуен Х., Льюис С., Прасад А.Р., Рэмси Л., Зейтлин Б., Нфонсам В., Кроуз Р.С., Бернштейн Х., Пейн С.М., Стерн С., Оатман Н., Банерджи Б., Бернштейн С. (2012). «Недостаточная экспрессия ферментов репарации ДНК при раннем прогрессировании до спорадического рака толстой кишки». Геном Интегр. 3 (1): 3. Дои:10.1186/2041-9414-3-3. ЧВК  3351028. PMID  22494821.
  33. ^ а б Бейкер А.М., Церезер Б., Мелтон С., Флетчер А.Г., Родригес-Хусто М., Тадрус П.Дж., Хамфрис А., Элия Дж., Макдональд С.А., Райт Н.А., Саймонс Б.Д., Янсен М., Грэм Т.А. (2014). «Количественная оценка эволюции крипт и стволовых клеток в нормальной и неопластической толстой кишке человека». Сотовый представитель. 8 (4): 940–7. Дои:10.1016 / j.celrep.2014.07.019. ЧВК  4471679. PMID  25127143.
  34. ^ Харпер Дж. У., Элледж С. Дж. (2007). «Реакция на повреждение ДНК: десять лет спустя». Мол. Ячейка. 28 (5): 739–45. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.11.015. PMID  18082599.
  35. ^ а б Грегг С.К., Робинсон А.Р., Нидернхофер Л.Дж. (2011). «Физиологические последствия дефектов эндонуклеазы репарации ДНК ERCC1-XPF». Ремонт ДНК (Amst.). 10 (7): 781–91. Дои:10.1016 / j.dnarep.2011.04.026. ЧВК  3139823. PMID  21612988.
  36. ^ Ли Э., Левин Э.А., Франко В.И., Аллен Г.О., Гонг Ф., Чжан И, Ху Дж.Дж. (2014). «Комбинированные модели генетического и пищевого риска тройного отрицательного рака груди». Nutr Cancer. 66 (6): 955–63. Дои:10.1080/01635581.2014.932397. PMID  25023197. S2CID  22065506.

внешние ссылки