XPB - Википедия - XPB
XPB (пигментная ксеродермия тип B) является АТФ -зависимый ДНК геликаза у людей это часть TFIIH фактор транскрипции сложный.
Структура
Трехмерная структура археального гомолога XPB была решена с помощью рентгеновской кристаллографии доктором Джоном Тайнером и его группой в Научно-исследовательский институт Скриппса.[5]
Функция
XPB играет важную роль в нормальной базальной транскрипции, транскрипционный сопряженный ремонт (TCR) и эксцизионная репарация нуклеотидов (NER). Было показано, что очищенный XPB раскручивает ДНК с полярностью 3’-5 ’.
Функция белка XPB (ERCC3) в NER заключается в том, чтобы способствовать раскручиванию ДНК двойная спираль после повреждения изначально распознается. NER - это многоступенчатый путь, который устраняет широкий спектр различных повреждений ДНК, которые нарушают нормальное спаривание оснований. Такие повреждения включают объемные химические аддукты, УФ-индуцированные димеры пиримидина и несколько форм окислительное повреждение. Мутации в гене XPB (ERCC3) у человека могут приводить к пигментная ксеродермия (XP) или XP в сочетании с Синдром Кокейна (XPCS).[6] Мутантные клетки XPB от людей с фенотипом XPCS чувствительны к УФ-облучению и острому окислительному стрессу.[7]
Расстройства
Мутации в XPB и других родственных группах комплементации, XPA-XPG, приводят к ряду генетических нарушений, таких как Пигментная ксеродермия, Синдром Кокейна, и трихотиодистрофия.
Взаимодействия
XPB был показан взаимодействовать с:
Ингибиторы малых молекул
Сильные, биоактивные природные продукты, такие как триптолид, которые ингибируют транскрипцию млекопитающих посредством ингибирования субъединицы XPB общего фактора транскрипции TFIIH, недавно были описаны в качестве конъюгата глюкозы для нацеливания на гипоксические раковые клетки с повышенной экспрессией переносчика глюкозы.[18]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163161 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024382 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Фан Л., Арвай А.С., Купер П.К., Иваи С., Ханаока Ф., Тайнер Дж. А. (апрель 2006 г.). «Консервативная структура ядра XPB и мотивы для раскручивания ДНК: последствия для выбора пути транскрипции или эксцизионной репарации». Молекулярная клетка. 22 (1): 27–37. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.02.017. PMID 16600867.
- ^ О, К.С., Хан С.Г., Ясперс Н.Г., Рамс А., Уэда Т., Леманн А., Фридманн П.С., Эммерт С., Грачев А., Лахлан К., Лукассан А., Бейкер С.К., Кремер К.Х. (2006). «Фенотипическая гетерогенность в гене геликазы ДНК XPB (ERCC3): пигментная ксеродерма без и с синдромом Кокейна». Гм. Мутат. 27 (11): 1092–103. Дои:10.1002 / humu.20392. PMID 16947863. S2CID 22852219.
- ^ Андрессоо Дж.О., Вида Дж., Де Вит Дж., Митчелл Дж. Р., Бимс РБ, ван Стиг Х, ван дер Хорст Г. Т., Hoeijmakers JH (2009). «Модель мыши Xpb для комбинированной пигментной ксеродермы и синдрома кокейна выявляет прогероидные особенности при дальнейшем ослаблении репарации ДНК». Мол. Клетка. Биол. 29 (5): 1276–90. Дои:10.1128 / MCB.01229-08. ЧВК 2643825. PMID 19114557.
- ^ Такеда Н., Сибуя М., Мару Й. (январь 1999 г.). «Онкобелок BCR-ABL потенциально взаимодействует с белком группы B xeroderma pigmentosum». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (1): 203–7. Дои:10.1073 / pnas.96.1.203. ЧВК 15117. PMID 9874796.
- ^ а б c d е ж Giglia-Mari G, Coin F, Ranish JA, Hoogstraten D, Theil A, Wijgers N, Jaspers NG, Raams A, Argentini M, van der Spek PJ, Botta E, Stefanini M, Egly JM, Aebersold R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W (июль 2004 г.). «Новая десятая субъединица TFIIH отвечает за синдром репарации ДНК трихотиодистрофии группы А». Nat. Genet. 36 (7): 714–9. Дои:10,1038 / ng1387. PMID 15220921.
- ^ а б Россиньоль М., Колб-Чейнель И., Эгли Дж. М. (апрель 1997 г.). «Субстратная специфичность cdk-активирующей киназы (САК) изменяется при ассоциации с TFIIH». EMBO J. 16 (7): 1628–37. Дои:10.1093 / emboj / 16.7.1628. ЧВК 1169767. PMID 9130708.
- ^ Йи А., Николс М.А., Ву Л., Холл Флорида, Кобаяши Р., Сюн Й. (декабрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование CDK7-ассоциированного MAT1 человека, фактора сборки циклин-зависимой киназы-активирующей киназы (САК)». Рак Res. 55 (24): 6058–62. PMID 8521393.
- ^ а б c d Маринони Дж. К., Рой Р., Вермёлен В., Миниу П., Лутц И., Вида Дж., Сероз Т., Гомес Д. М., Хоймейкерс Дж. Х., Эгли Дж. М. (март 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции / репарации ДНК TFIIH». EMBO J. 16 (5): 1093–102. Дои:10.1093 / emboj / 16.5.1093. ЧВК 1169708. PMID 9118947.
- ^ Драпкин Р., Рирдон Дж. Т., Ансари А., Хуанг Дж. К., Завел Л., Ан К., Санкар А., Рейнберг Д. (апрель 1994 г.). «Двойная роль TFIIH в эксцизионной репарации ДНК и в транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». Природа. 368 (6473): 769–72. Дои:10.1038 / 368769a0. PMID 8152490. S2CID 4363484.
- ^ Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (февраль 1996 г.). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия. 35 (7): 2157–67. Дои:10.1021 / bi9524124. PMID 8652557.
- ^ Ван XW, Yeh H, Schaeffer L, Roy R, Moncollin V, Egly JM, Wang Z, Freidberg EC, Evans MK, Taffe BG (июнь 1995 г.). «Модуляция p53 TFIIH-ассоциированной активности эксцизионной репарации нуклеотидов». Nat. Genet. 10 (2): 188–95. Дои:10.1038 / ng0695-188. PMID 7663514. S2CID 38325851.
- ^ Weeda G, Rossignol M, Fraser RA, Winkler GS, Vermeulen W, van 't Veer LJ, Ma L, Hoeijmakers JH, Egly JM (июнь 1997 г.). «Субъединица XPB фактора репарации / транскрипции TFIIH непосредственно взаимодействует с SUG1, субъединицей протеасомы 26S и предполагаемым фактором транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (12): 2274–83. Дои:10.1093 / nar / 25.12.2274. ЧВК 146752. PMID 9173976.
- ^ Ёкои М., Масутани С., Маэкава Т., Сугасава К., Окума Ю., Ханаока Ф. (март 2000 г.). «Белковый комплекс XPC-HR23B группы C xeroderma pigmentosum играет важную роль в привлечении фактора транскрипции IIH к поврежденной ДНК». J. Biol. Chem. 275 (13): 9870–5. Дои:10.1074 / jbc.275.13.9870. PMID 10734143.
- ^ Датан Э, Минн И, Пэн Х, Хе КЛ, Ан Х, Ю Б., Помпер М.Г., Лю Джо (2020). «Конъюгат глюкоза-триптолид селективно нацелен на раковые клетки в условиях гипоксии». iScience. 23 (9). Дои:10.1016 / j.isci.2020.101536. PMID 33083765.
дальнейшее чтение
- Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Наука. 5 (1): 24–7. Дои:10.1007 / BF02253352. PMID 9570510.
- Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Curr. Биол. 8 (13): R447–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID 9651670. S2CID 15480646.
- Кливер Дж. Э., Томпсон Л. Х., Ричардсон А. С., Штаты JC (1999). «Краткое изложение мутаций чувствительных к УФ-излучению расстройств: пигментная ксеродермия, синдром Кокейна и трихотиодистрофия». Гм. Мутат. 14 (1): 9–22. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 14: 1 <9 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-6. PMID 10447254.
- Ма Л., Вида Г., Йохемсен АГ, Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х., ван дер Эб А. Дж. (1992). «Молекулярный и функциональный анализ промотора XPBC / ERCC-3: транскрипционная активность зависит от целостности сайта связывания Sp1». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (2): 217–24. Дои:10.1093 / nar / 20.2.217. ЧВК 310357. PMID 1741247.
- Weeda G, Wiegant J, van der Ploeg M, Geurts van Kessel AH, van der Eb AJ, Hoeijmakers JH (1991). «Локализация гена ERCC3, корректирующего группу B ксеродермы пигментных, в хромосоме 2q21 человека». Геномика. 10 (4): 1035–1040. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90195-К. HDL:1765/3025. PMID 1916809.
- Weeda G, Ma LB, ван Хэм Р.С., ван дер Эб AJ, Hoeijmakers JH (1991). «Структура и экспрессия гена XPBC / ERCC-3 человека, участвующего в нарушениях репарации ДНК, xeroderma pigmentosum и синдроме Кокейна». Нуклеиновые кислоты Res. 19 (22): 6301–6308. Дои:10.1093 / nar / 19.22.6301. ЧВК 329143. PMID 1956789.
- Вида Г., ван Хэм Р.С., Мазурел Р., Вестервельд А., Одийк Х., де Вит Дж., Ботсма Д., ван дер Эб А.Дж., Хоймейкерс Дж. Х. (1990). «Молекулярное клонирование и биологическая характеристика гена эксцизионной репарации ERCC-3 человека». Мол. Клетка. Биол. 10 (6): 2570–2581. Дои:10.1128 / MCB.10.6.2570. ЧВК 360615. PMID 2111438.
- Вида Г., Ван Хэм Р.С., Вермёлен В., Бутсма Д., ван дер Эб А.Дж., Хоймейкерс Дж. Х. (1990). «Предполагаемая ДНК-геликаза, кодируемая ERCC-3, участвует в нарушениях восстановления ксеродермы у человека и синдроме Кокейна». Клетка. 62 (4): 777–91. Дои:10.1016 / 0092-8674 (90) 90122-У. HDL:1765/3020. PMID 2167179. S2CID 31743602.
- Ван XW, Yeh H, Schaeffer L, Roy R, Moncollin V, Egly JM, Wang Z, Freidberg EC, Evans MK, Taffe BG (1995). «Модуляция p53 TFIIH-ассоциированной активности эксцизионной репарации нуклеотидов». Nat. Genet. 10 (2): 188–95. Дои:10.1038 / ng0695-188. PMID 7663514. S2CID 38325851.
- Максон М.Э., Гудрич Дж. А., Тьян Р. (1994). «Фактор транскрипции IIE связывается преимущественно с РНК-полимеразой IIa и рекрутирует TFIIH: модель клиренса промотора». Genes Dev. 8 (5): 515–24. Дои:10.1101 / gad.8.5.515. PMID 7926747.
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Драпкин Р., Рирдон Дж. Т., Ансари А., Хуанг Дж. К., Завел Л., Ан К., Санкар А., Рейнберг Д. (1994). «Двойная роль TFIIH в эксцизионной репарации ДНК и в транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». Природа. 368 (6473): 769–72. Дои:10.1038 / 368769a0. PMID 8152490. S2CID 4363484.
- ван Вуурен А.Дж., Вермёлен В., Ма Л., Вида Дж., Аппелдорн Е., Ясперс Н.Г., ван дер Эб А.Дж., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х., Хумберт С. (1994). «Коррекция дефекта репарации пигментной ксеродермы с помощью базального фактора транскрипции BTF2 (TFIIH)». EMBO J. 13 (7): 1645–1653. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06428.x. ЧВК 394995. PMID 8157004.
- Шеффер Л., Монколлин В., Рой Р., Стауб А., Меззина М., Сарасин А., Вида Г., Хоймейкерс Дж. Х., Эгли Дж. М. (1994). «Белок репарации ERCC2 / ДНК связан с фактором транскрипции BTF2 / TFIIH класса II». EMBO J. 13 (10): 2388–2392. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06522.x. ЧВК 395103. PMID 8194528.
- Гуздер С.Н., Сунг П., Байи В., Пракаш Л., Пракаш С. (1994). «RAD25 - это ДНК-геликаза, необходимая для репарации ДНК и транскрипции РНК-полимеразы II». Природа. 369 (6481): 578–81. Дои:10.1038 / 369578a0. PMID 8202161. S2CID 4332757.
- Вермёлен В., Скотт Р. Дж., Роджерс С., Мюллер Х. Дж., Коул Дж., Арлетт К. Ф., Клейджер В. Дж., Бутсма Д., Хоймейкерс Дж. Х., Вида Г. (1994). «Клиническая гетерогенность пигментной ксеродермы, связанная с мутациями в гене репарации и транскрипции ДНК ERCC3». Являюсь. J. Hum. Genet. 54 (2): 191–200. ЧВК 1918172. PMID 8304337.
- Скотт Р.Дж., Итин П., Клейджер В.Дж., Колб К., Арлетт С., Мюллер Х. (1993). «Комплекс синдрома Xeroderma pigmentosum-Cockayne у двух пациентов: отсутствие опухолей кожи, несмотря на серьезный дефицит эксцизионной репарации ДНК». Варенье. Акад. Дерматол. 29 (5, п. 2): 883–9. Дои:10.1016 / 0190-9622 (93) 70263-С. PMID 8408834.
- Блау Дж., Сяо Х., Маккракен С., О'Хара П., Гринблатт Дж., Бентли Д. (1996). «Три функциональных класса домена активации транскрипции». Мол. Клетка. Биол. 16 (5): 2044–2055. Дои:10.1128 / MCB.16.5.2044. ЧВК 231191. PMID 8628270.
- Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (1996). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия. 35 (7): 2157–2167. Дои:10.1021 / bi9524124. PMID 8652557.
- Hwang JR, Moncollin V, Vermeulen W., Seroz T., van Vuuren H, Hoeijmakers JH, Egly JM (1996). «Дефект геликазы 3 '-> 5' XPB в факторе репарации / транскрипции TFIIH группы B xeroderma pigmentosum влияет как на репарацию ДНК, так и на транскрипцию». J. Biol. Chem. 271 (27): 15898–904. Дои:10.1074 / jbc.271.27.15898. PMID 8663148.
внешняя ссылка
- GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о Xeroderma Pigmentosum
- XPBC-ERCC-3 + белок в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
