Семейство гликозид гидролаз 27 - Википедия - Glycoside hydrolase family 27
| Мелибиаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура рисовой альфа-галактозидазы | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Мелибиаза | ||||||||
| Pfam | PF02065 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000111 | ||||||||
| SCOP2 | 1ktc / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH27 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозилгидролаз 27 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать в гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводным и неуглеводным фрагментом. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозидгидролаз 27 вместе с семья 31 и семья 36 альфа-галактозидазы образуют гликозилгидролазный клан GH-D, суперсемейство альфа-галактозидаз, альфа-N-ацетилгалактозаминидазы, и изомальтодекстраназы которые могут иметь общие каталитический механизм и структурная топология.
Альфа-галактозидаза (EC 3.2.1.22 ) (мелибиаза)[8] катализирует гидролиз мелибиоза в галактоза и глюкоза. У человека дефицит этого фермента является причиной Болезнь Фабри (Х-сцепленный сфинголипидоз). Альфа-галактозидаза присутствует во многих организмах. Существует значительная степень сходства в последовательности альфа-галактозидазы из разных эукариотический разновидность. кишечная палочка альфа-галактозидаза (ген melA), которой необходимы НАД и магний в качестве кофакторов, структурно не связана с эукариотическими ферментами; напротив, кишечная палочка плазмида кодируемая альфа-галактозидаза (ген rafA P16551)[9] содержит область примерно из 50 аминокислот, которая аналогична домену эукариотических альфа-галактозидаз. Альфа-N-ацетилгалактозаминидаза (EC 3.2.1.49 )[10] катализирует гидролиз концевых невосстанавливающих остатков N-ацетил-D-галактозамина в N-ацетил-альфа-D-галактозаминидах. У человека дефицит этого фермента является причиной Шиндлер и Болезни Канзаки. Последовательность этого фермента очень близка к последовательности альфа-галактозидаз эукариот.
внешняя ссылка
Рекомендации
- ^ Хенриссат Б., Каллебаут I, Морнон Дж. П., Фабрега С., Лен П., Дэвис Г. (1995). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (15): 7090–7094. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Хенриссат Б., Дэвис Г. (1995). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–859. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Байрох А. "Классификация семейств гликозилгидролаз и указатель записей гликозилгидролаз в SWISS-PROT". 1999 г.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард, Винсент; Голаконда Рамулу, Хемалата; Друла, Элоди; Coutinho, Pedro M .; Хенриссат, Бернар (01.01.2014). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (D1): D490 – D495. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ISSN 0305-1048. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 27». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (01.12.2018). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. ISSN 1460-2423. PMID 29040563.
- ^ Дей ПМ, Придхэм Дж. Б. (1972). «Биохимия α-галактозидаз». Биохимия альфа-галактозидаз. Adv. Энзимол. Relat. Районы Мол. Биол. Достижения в энзимологии и смежных областях молекулярной биологии. 36. С. 91–120. Дои:10.1002 / 9780470122815.ch3. ISBN 9780470122815. PMID 4561015.
- ^ Асланидис К., Шмид К., Шмитт Р. (1989). «Нуклеотидные последовательности и структура оперона плазмидных генов, опосредующих поглощение и использование рафинозы в Escherichia coli». J. Bacteriol. 171 (12): 6753–6763. Дои:10.1128 / jb.171.12.6753-6763.1989. ЧВК 210573. PMID 2556373.
- ^ Ван А.М., Епископ Д.Ф., Десник Р.Дж. (1990). «Молекулярное клонирование человеческой альфа-N-ацетилгалактозаминидазы, нуклеотидная последовательность и экспрессия полноразмерной кДНК. Гомология с человеческой альфа-галактозидазой А предполагает эволюцию от общего предкового гена». J. Biol. Chem. 265 (35): 21859–21866. PMID 2174888.
