Семейство гликозидгидролаз 52 - Glycoside hydrolase family 52

Glyco_hydro_52
Идентификаторы
СимволGlyco_hydro_52
PfamPF03512
ИнтерПроIPR000852
CAZyGH52

В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 52 это семья из гликозидгидролазы.

Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]

Семейство гликозидгидролаз 52 КАЗИ GH_52 содержит ферменты только с одной известной активностью; бета-ксилозидаза (EC 3.2.1.37 ).

Белки содержащие бета-ксилозидазу и ксиланаза виды деятельности [8] были идентифицированы в грамположительных, факультативных теплолюбивый аэроб Bacillus stearothermophilus 21.[8] Этот микроб, который функционирует в ксилан разложения, может использовать ксилан в качестве единственного источника углерод. Фермент гидролизует 1,4-бета-D-ксиланы, удаляя последующие D-ксилоза остатки от невосстанавливающих концов. Он также гидролизует ксилобиозу.

Рекомендации

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
  5. ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ «Семейство гликозидгидролаз 52». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
  7. ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. HDL:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. PMID  29040563.
  8. ^ а б Баба Т., Шинке Р., Нанмори Т. (июль 1994 г.). «Идентификация и характеристика кластерных генов термостабильных ферментов, разлагающих ксилан, бета-ксилозидазы и ксиланазы Bacillus stearothermophilus 21». Appl. Environ. Микробиол. 60 (7): 2252–8. Дои:10.1128 / AEM.60.7.2252-2258.1994. ЧВК  201640. PMID  8074507.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR000852