Семейство гликозид гидролаз 89 - Википедия - Glycoside hydrolase family 89

Тим-бочонок домен альфа-N-ацетилглюкозаминидазы (NAGLU)
Идентификаторы
СимволНАГЛУ
PfamPF05089
Pfam кланCL0058
ИнтерПроIPR007781
CAZyGH89
N-концевой домен альфа-N-ацетилглюкозаминидазы (NAGLU)
Идентификаторы
СимволNAGLU_N
PfamPF12971
CAZyGH89
C-концевой домен альфа-N-ацетилглюкозаминидазы (NAGLU)
Идентификаторы
СимволNAGLU_C
PfamPF12972
CAZyGH89

В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 89 это семья из гликозидгидролазы.

Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]

Семейство гликозидгидролаз 89 КАЗИ GH_89 включает ферменты с α-N-ацетилглюкозаминидаза EC 3.2.1.50 Мероприятия. Фермент состоит из трех структурный домены, то N-концевой домен имеет альфа -бета-фолд центральный домен имеет ТИМ ствол сложить, а C-терминал домен имеет полностью альфа-спиральную складку.[8]

Альфа-N-ацетилглюкозаминидаза представляет собой лизосомный фермент требуется для ступенчатой ​​деградации гепаран сульфат.[9] Мутации на альфа-N-ацетилглюкозаминидазу (НАГЛУ ) ген может привести к Мукополисахаридоз тип IIIB (MPS IIIB; или Синдром Санфилиппо тип B), характеризующийся неврологический дисфункция, но относительно легкая соматический проявления.[10]

Рекомендации

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
  5. ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Выпуск базы данных): D490–5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ «Семейство гликозид гидролаз 89». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
  7. ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID  29040563.
  8. ^ Фико-Блин Э., Стаббс К.А., Немировский О., Vocadlo DJ, Boraston AB (2008). «Структурное и механистическое понимание основы мукополисахаридоза IIIB». Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (18): 6560–5. Bibcode:2008PNAS..105.6560F. Дои:10.1073 / pnas.0711491105. ЧВК  2373330. PMID  18443291.
  9. ^ Ли Х. Х., Ю. Х., Розенгурт Н., Чжао Х. З., Лайонс К. М., Анагностарас С., Фанселоу М. С., Сузуки К., Ванье М. Т., Нойфельд Е. Ф. (декабрь 1999 г.). «Мышиная модель синдрома Санфилиппо типа B, полученная путем направленного разрушения гена, кодирующего альфа-N-ацетилглюкозаминидазу». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (25): 14505–10. Bibcode:1999ПНАС ... 9614505Л. Дои:10.1073 / pnas.96.25.14505. ЧВК  24466. PMID  10588735.
  10. ^ Виллани Г.Р., Фолленци А., Ванакор Б., Ди Доменико С., Налдини Л., Ди Натале П. (июнь 2002 г.). «Коррекция фибробластов мукополисахаридоза типа IIIb с помощью переноса генов, опосредованного лентивирусным вектором». Biochem. J. 364 (Пт 3): 747–53. Дои:10.1042 / BJ20011872. ЧВК  1222624. PMID  12049639.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR007781