Семейство гликозидгидролаз 97 - Glycoside hydrolase family 97
| Гликозид гидролаза 97 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Glyco_hydro_97 | ||||||||
| Pfam | PF10566 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR019563 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 97 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Семейство гликозидгидролаз 97 (GH97) представляет собой бактериальный семья. Центральная часть семейства GH97 белковые последовательности представляет собой типичный и полный (бета / альфа) 8-ствольный или каталитический ТИМ-ствол тип домена. N- и C-концевые части последовательностей, в основном состоящие из бета-нити, скорее всего, образуют два дополнительных некаталитических домены с еще неизвестными функциями. Некаталитический домены гликозидаз из альфа-галактозидаза и альфа-глюкозидаза суперсемейства также преимущественно состоят из бета-цепей, и по крайней мере некоторые из этих доменов участвуют в олигомеризация и связывание углеводов. Во всех известных гликозидазах с 8-бочкообразной (бета-альфа) кратностью аминокислота остатки на активный сайт расположены на C-конец бета-нитей.[8]
внешняя ссылка
Рекомендации
- ^ Хенриссат Б., Каллебаут I, Морнон Дж. П., Фабрега С., Лен П., Дэвис Г. (1995). «Консервированные каталитические механизмы и предсказание общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (15): 7090–7094. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Хенриссат Б., Дэвис Г. (1995). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–859. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Байрох, А. "Классификация семейств гликозилгидролаз и индекс записей гликозилгидролаз в SWISS-PROT". 1999 г.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард, Винсент; Голаконда Рамулу, Хемалата; Друла, Элоди; Coutinho, Pedro M .; Генриссат, Бернар (01.01.2014). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (D1): D490 – D495. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ISSN 0305-1048. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 97». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (01.12.2018). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов». Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. HDL:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. ISSN 1460-2423. PMID 29040563.
- ^ Наумов Д.Г. (2005). «GH97 - это новое семейство гликозидгидролаз, которое относится к суперсемейству альфа-галактозидаз». BMC Genomics. 6: 112. Дои:10.1186/1471-2164-6-112. ЧВК 1249566. PMID 16131397.
