Methanohalophilus mahii - Википедия - Methanohalophilus mahii
| Methanohalophilus mahii | |
|---|---|
 | |
| Растровый электронный микроскоп изображение Mhp. махии SLP | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Королевство: | |
| Тип: | |
| Учебный класс: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | М. махии |
| Биномиальное имя | |
| Methanohalophilus mahii Патерек и Смит (1988) | |
Methanohalophilus mahii (также известен как Mhp. махии) является обязательным анаэробный,[1] метилотрофный,[2] метаногенный[1] кокки -образный[2] Археон из род Methanohalophilus[2] что можно найти в высоких соленость ачетвертая среда.[1] Название Methanohalophilus считается производным от метан смысл "метан " в латинский; гало смысл "соль " в Греческий; и махии означает «из Мах» на латыни после Р.А. Мах, который провел значительное исследование аэробный и метаногенный микробы.[2] Правильное слово в древнегреческом языке для обозначения соли - Привет (ἅλς).[3] Конкретные напряжение тип был обозначен SLP (= ATCC 35705) и в настоящее время является единственным идентифицированным штаммом этого вида.[2]
Филогения
Всего четыре разновидность в род Methanohalophilus включая Methanohalophilus mahii, Methanohalophilus halophilus, Methanohalophilus portucalensis, и Methanohalophilus euhalobius.[1] Ближайший родственник, Methanohalophilus portucalensis, имеет 99,8% сходства по последовательности во всем геноме с Methanohalophilus mahii.[1] Другой Methanohalophilus виды имеют сходство с Methanohalophilus mahii.[1] Все виды рода галофильный метаногены которые способствуют морская экосистема минеральная кататься на велосипеде.[1]
Открытие
В 1988 году Роберт Патерек и Пол Смит искали метаногенный бактерии в Большое Соленое озеро в Юта когда они впервые обнаружили Археон Methanohalophilus mahii в его бескислородном отложения.[2] Образцы донных отложений были собраны и сохранены в оргстекло пробирки и пробы промежуточного керна, взятые с латунная пробка и переносили во флаконы с сывороткой на пятьдесят миллилитров.[4] Все образцы были обработаны в течение 48 часов после сбора.[4] СМИ, используемые для изоляция из Methanohalophilus mahii колонии был приготовлен с использованием метода Hungate для надлежащего выделения анаэробных микробов.[4] Серийные разведения были приготовлены в соотношении 1:10,[4] и агар рулонные трубы были привитый и инкубированный при 30 ° C в течение восьми недель.[4] Изолированные метаногенные колонии были выбраны путем идентификации колоний с пенистый текстура, обозначающая газ релиз,[1] и многократно разводили и инокулировали в пробирки с агаром, пока не образовался только один тип колонии. морфология остался.[4] Эти колонии выглядели как крем бледнеть желтый -цветный круговой -образные колонии с общим пенистый текстура из-за выделения газа.[2]
Культура клеток
Было проведено несколько анализов для определения клетка характеристики.[4] Methanohalophilus mahii классифицируется как умеренный галофил, или организм, который может расти в соленость среды, поскольку он может расти от 0,5 до 3,5 млн NaCl классифицировать,[1] с оптимальным ростом концентрация при 2,0 М NaCl,[1] но с концентрацией 1,2 М NaCl, обеспечивающей самую высокую плотность культуры.[1] Он также может расти в различных pH уровни от 6.5 до 8.2,[1] с оптимальным pH 7,5.[1] Methanohalophilus mahii это мезофил, или организм, который процветает при умеренных температурах и лучше всего растет при температуре 37 ° C.[2]
Структура клетки
Methanohalophilus mahii клетки пятно Грамотрицательный,[1] и неподвижны,[2] нерегулярный кокки[2] приблизительно от 0,8 до 1,8 мкм в диаметре.[2] Кроме того, клетки флуоресценция до 420 нанометр свет.[2] Мембрана фосфолипиды состоят из ядер β-гидроксиархеол, глюкоза гликолипиды, и этаноламин, глицерин, и мио-инозитол полярные головные группы.[1]
Метаболизм
Methanohalophilus mahii обязательно анаэробный[1] метилотрофный[2] и метаногенный хемогетеротроф, способен уменьшать Один-углерод соединения и многоуглеродные соединения, учитывая, что нет углерода-углерода двойные связи настоящее время.[1] Следы количества Mg2+, K+, Ca2+, и Fe2+ ионы необходимы для метаногенного роста.[1] Метанол может использоваться независимо как источник углерода, а Эмбден-Мейерхоф-Парнас (EMP ) гликолитический путь может быть использован для катаболический процессы.[1] Возможный доноры электронов включают метанол, метиламины, диметиламины, и триметиламины.[1] Methanohalophilus mahii способен использовать несколько метаболические пути либо уменьшить, либо окислять метильные группы, создавая либо метан или же углекислый газ в процессе.[1] В восстановительном метилотрофном метаногенном пути Methanohalophilus mahii может в конечном итоге восстановить метильную группу до метана, который высвобождается.[1] В окислительном метилотрофном пути метильная группа вместо этого окисляется до углекислый газ и отпустили.[1] Этот процесс напрямую способствует образованию углерода. минерализация в морских экосистемах.[1]
Геном
Methanohalophilus mahii’s геном был секвенирован через секвенирование дробовика используя 6,8 килобаза Библиотека ДНК Сэнгера.[1] Полный размер генома был определен как 2 012 424 человека. пар оснований длинные, всего 2906 гены, а 2032 фактических гены, кодирующие белок.[1] В последовательность было 42,6% Содержимое GC, и сорок пять псевдогены были расположены.[1]
Важность
Methanohalophilus mahii имеет уникальный супрессор тРНК с измененным пирролизин, аминокислота это чаще всего встречается в прокариоты, который может распознать и привязать янтарный STOP-кодон (UAG), который также кодируется генами, используемыми для метиламин метилтрансферазы.[1] Этот вид был также первым представителем, у которого геном полностью секвенирован в роду Methanohalophilus[1], который включает мягко галофильный, метилотрофный метаногены.[1] Эти археи в целом, как известно, вносят большой вклад в углеродную минерализация процесс в морских экосистемах.[1] В частности, окислительный метилотрофный путь Methanohalophilus mahii использует позволяет видам окисляться метан к углекислый газ, который, в свою очередь, используется другими растения и организмы.[1] Этот минеральная езда на велосипеде позволяет больше роста и разнообразие в океан.[1]
Рекомендации
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф Весна, С .; Scheuner, C .; Lapidus, A .; Lucas, S .; Рио, Т. Г. Д .; Tice, H .; Copeland, A .; Cheng, J .; Чен, Ф. (23 декабря 2010 г.). «Последовательность генома SLPT Methanohalophilus mahii выявляет различия в энергетическом метаболизме среди представителей Methanosarcinaceae, обитающих в пресноводных и соленых средах». Археи. 2010: 690737. Дои:10.1155/2010/690737. ISSN 1472-3646. ЧВК 3017947. PMID 21234345.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л м Paterek, J. R .; Смит, П. Х. (1 января 1988 г.). "Methanohalophilus mahii gen. Nov., Sp. Nov., Галофильный метаноген с метилотрофом". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 38 (1): 122–123. Дои:10.1099/00207713-38-1-122.
- ^ Лидделл, Х.Г. и Скотт, Р. (1940). Греко-английский лексикон, полностью переработанный и дополненный сэром Генри Стюартом Джонсом при содействии. Родерик Маккензи. Оксфорд: Clarendon Press.
- ^ а б c d е ж грамм Патерек, Дж. Роберт; Смит, Пол Х. (1 октября 1985 г.). «Выделение и характеристика галофильного метаногена из Большого Соленого озера». Прикладная и экологическая микробиология. 50 (4): 877–881. ISSN 0099-2240. ЧВК 291763. PMID 16346919.
дальнейшее чтение
- Дворкин, Мартин и Стэнли Фалькоу, ред. Прокариоты: Vol. 3: Археи. Спрингер, 2006.
- Весна, Стефан; Лапидус, Алла; Шойнер, Кармен; и другие. (2010). «Последовательность генома SLPT Methanohalophilus mahii выявляет различия в энергетическом метаболизме среди представителей Methanosarcinaceae, обитающих в пресноводных и соленых средах». Археи. 2010: 16. Дои:10.1155/2010/690737. ЧВК 3017947. PMID 21234345.
